Development for simultaneous detection of multiple pathogens in patients of acute respiratory infections and evolutionary analysis using complete genome sequences.

• Project/Area Number: 25K13539
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
• Research Institution: Osaka Institute of Public Health
• Principal Investigator: 改田 厚 地方独立行政法人 大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 主幹研究員 (50372131)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 山元 誠司 地方独立行政法人 大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 主任研究員 (20649008) ; 平井 有紀 地方独立行政法人 大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 研究員 (80818203)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2026: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2025: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
• Keywords: 急性呼吸器感染症 / ウイルス / 細菌 / ゲノム解析

Outline of Research at the Start

急性呼吸器感染症（Acute Respiratory Infection; ARI）の原因病原体は多く報告されている。効率的な病原体同定のために多項目病原体の包括的検出系の構築、さらに病態、疫学、病原体解析のために検出病原体の全長ゲノム解読、解析、データ蓄積が重要である。本研究では、マルチプレックス・リアルタイムPCR法を用いたARIの多項目病原体遺伝子検出系の構築および結果判定システム開発をおこなう。臨床検体中の標的ウイルス核酸濃縮法開発に取り組むとともに、長期間の国内外検出株のゲノム情報を含め、検出ウイルス株の進化解析をおこなう。