Development of a Novel Analysis Method for Personal Identification Using Nanopore Sequencers – Degraded and Mixed DNA Sample Analysis

Research Project

Project/Area Number	25K13663
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 58040:Forensics medicine-related
Research Institution	Nihon University
Principal Investigator	奥田貴久日本大学, 医学部, 教授 (20620305)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	鉄堅日本大学, 医学部, 講師 (40277439)
Project Period (FY)	2025-04-01 – 2028-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2027: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000) Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords	ナノポアシークエンサー / 個人識別 / DNA鑑定 / 劣化DNA試料 / 混合DNA試料
Outline of Research at the Start	法医鑑定の重要な実務に個人識別があり、その中でもDNA鑑定の信頼度が高い。しかし、現在のDNA鑑定は、劣化によって断片化したDNAや混合試料の識別能が低い。ナノポアシークエンサーは、繰り返し塩基配列(STR)を正確に読み取り、さらに、ミトコンドリアDNA（mtDNA）の全塩基配列解読も可能である。ナノポアシークエンサーを用いて、これまで課題とされた劣化および混合DNA試料の個人識別能が向上する可能性が高い。本研究では、ホルマリン固定臓器および紫外線照射試料から抽出した劣化DNAのSTR多型解析、近親者でない5検体の混合血液試料からのmtDNAを用いた人数推定を行う。