Construction of a database of a world map of human history of transcriptome genetic adaptation.

• Project/Area Number: 25K15028
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 60030:Statistical science-related
• Research Institution: Chuo University
• Principal Investigator: 岸野 洋久 中央大学, 研究開発機構, 客員研究員 (00141987)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中道 礼一郎 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), 主任研究員 (70401255)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000); Fiscal Year 2027: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2026: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
• Keywords: ヒト集団ゲノム / 混血グラフ / 遺伝適応 / ブラウン運動 / 最尤法

Outline of Research at the Start

現生人類と旧人類のゲノムデータが充実してくると、中立SNPsのアレル頻度スペクトルから、集団の分化と混合の歴史を混血グラフの形で推定することが可能となった。どこで本研究ではこの混血グラフを土台にして、形質に影響するSNP (QTL)のアレル頻度が中立なSNPsの遺伝的浮動を超えて、有意に変化したエッジを網羅的に収集する。ベースとなる祖先集団の状態推定と有意な変動の検出に関する統計手法を開発しつつ、これに基づき人類史における遺伝子発現の適応を納めたデータベースを構築する。