異分散性重ね合わせ法に基づくタンパク質ダイナミクス解析のための確率的生成モデル

• Project/Area Number: 25K15324
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
• Research Institution: Tottori University
• Principal Investigator: 網崎 孝志 鳥取大学, 医学部, プロジェクト研究員 (20231996)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2027: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2026: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2025: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: 変分オートエンコーダ / 構造重ね合わせ / 反復重み最小二乗法

Outline of Research at the Start

タンパク質の働きは、それぞれに固有の静的構造だけで決まるのではなく、そのダイナミクスや構造多様性が関係している。本研究では、確率的生成モデルを用いたタンパク質の新たな構造生成・分布推定法を開発する。分子動力学法で得られたトラジェクトリ・データから構造の分布を推定することを第一の用途と考えている。最大の特徴は、デカルト座標空間での原子位置の分子内異分散性を考慮することである。これにより、解釈の容易なデカルト座標での新規かつ有用な構造生成・分布推定を実現することを目指す。