Elucidating the role of introns in de novo gene birth

• Project/Area Number: 25K15342
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
• Research Institution: Kyushu Institute of Technology
• Principal Investigator: 矢田 哲士 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (10322728)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2030-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2029: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000); Fiscal Year 2028: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000); Fiscal Year 2027: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000); Fiscal Year 2026: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2025: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: 遺伝子のde novo誕生 / イントロン / バイオインフォマティクス

Outline of Research at the Start

De novoに誕生した遺伝子(ゲノム中の非遺伝子領域に突然変異が蓄積することで誕生した遺伝子)の発見は大変な驚きだった。なぜなら、それらの配列が100塩基ほどの短さでも配列の場合の数は4の100乗に達し、そこから遺伝子の配列を探しだすには現代のコンピュータを使っても天文学的な時間が必要になる。一方、遺伝子をコードするゲノム配列にイントロンと呼ばれる配列が介在するとゲノム中の遺伝子の候補数が飛躍的に増大する。そこで、イントロンの介在が遺伝子のde novo誕生を促進すると考え、互いに近縁で、イントロンに富む遺伝子をもつ種とイントロンが乏しい遺伝子をもつ種で遺伝子のde novo誕生の速度を比較する。