共翻訳フォールディングを予測する理論的手法の構築とその応用

Research Project

Project/Area Number	25K18429
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 43040:Biophysics-related
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	季高駿士東京大学, 大学院総合文化研究科, 助教 (50968138)
Project Period (FY)	2025-04-01 – 2028-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help	¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000) Fiscal Year 2027: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000) Fiscal Year 2026: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000) Fiscal Year 2025: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Keywords	タンパク質 / フォールディング / 構造予測 / タンパク質デザイン
Outline of Research at the Start	タンパク質がひも状から天然構造に折りたたまれる「フォールディング」の反応機構を解明することは、生命科学における最重要課題の一つである。細胞内のタンパク質はリボソームで合成される途中にフォールディングを開始するが（共翻訳フォールディング）、共翻訳フォールディングを実験で測定することは極めて難しく、未解明な点が多い。そこで本研究では、深層学習を用いた最新のタンパク質立体構造予測法と、物理学に基づく最先端のエネルギー計算法を組み合わせて、アミノ酸配列情報のみからタンパク質の共翻訳フォールディングを予測する新規手法の構築を目指す。