Elucidating structural diversity and functional significance of the MHC region using long-read sequencing

• Project/Area Number: 25K18717
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 48040:Medical biochemistry-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 曽根原 究人 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 客員研究員 (60975358)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2026: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000); Fiscal Year 2025: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
• Keywords: 遺伝統計学 / ロングリードシーケンス / HLA遺伝子 / MHC領域 / 構造多型

Outline of Research at the Start

ヒト6番染色体に位置する主要組織適合遺伝子複合体（major histocompatibility complex; MHC）領域は、全ゲノム領域中で最も強力に数多くのヒト疾患感受性に影響する。一方で当該領域はゲノム中でも特に複雑な構造的多様性（欠失・挿入や逆位、遺伝子重複）を有するため、従来のゲノムデータ解析手法では、領域中の多彩な構造多型が捕捉できず、疾患ゲノム解析の対象から見逃されてきた。本研究では、ロングリードシークエンスの活用を通じて、個々人が有するMHC領域の構造的多様性を再構成する。日本人集団におけるMHC領域の構造的多様性を解明することで、幅広いヒト疾患に果たす役割を解明する。