ゼロ過剰シングルセルデータからの遺伝子間因果関係推定とその検証

• Project/Area Number: 25K21331
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 佐藤 憲明 東京大学, 医科学研究所, 助教 (90838997)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2027: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: バイオインフォマティクス / 遺伝子調節ネットワーク

Outline of Research at the Start

本研究では、一細胞レベルの転写産物の網羅的な定量を行うシングルセルトランスクリプトームデータを基に、遺伝子調節ネットワークを推定する新規手法の開発を行う。さらに、推定されたネットワークの因果関係を基にした評価を行うことを目的としている。これにより、生物学的に妥当性のある遺伝子間の有向ネットワークを細胞種毎に推定し、疾患分類や病態の進行に重要な調節関係を同定することが可能となり、疾患や生命の新しいメカニズムを明らかにすることが期待される。