Studies on the proton pump mechanism of the terminal oxidase by time resolved analyses at the hydrogen atom level resolution

• Project/Area Number: 26291033
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Partial Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Biophysics
• Research Institution: University of Hyogo
• Principal Investigator: Yoshikawa Shinya 兵庫県立大学, 生命理学研究科, 名誉教授 (40068119)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): ISHIMORI Koichiro 北海道大学, 大学院理学系研究院, 教授 (20192487) ; TATENO Masaru 兵庫県立大学, 大学院生命理学研究科, 教授 (40291926) ; SHINZAWA Kyoko (ITOH Kyoko) 兵庫県立大学, 大学院生命理学研究科, 准教授 (70206316) ; KUBO Minoru 独立行政法人理化学研究所, 城生体金属科学研究室, 研究員 (90392878) ; TAMADA Tarou 独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究主幹 (50391248) ; MISAKI Tomonori 兵庫県立大学, 大学院物質理学研究科, 助教 (00411786)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2016)
• Budget Amount: ¥16,640,000 (Direct Cost: ¥12,800,000、Indirect Cost: ¥3,840,000); Fiscal Year 2016: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2015: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2014: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
• Keywords: 呼吸鎖末端酸化酵素 / プロトンポンプ / 膜タンパク質 / ヘムタンパク質 / 時分割X線構造解析 / 時分割Ｘ線構造解析 / チトクロム酸化酵素 / ミトコンドリアエネルギー変換 / 振動分光解析 / 電子構造生物学

Outline of Final Research Achievements

Cytochrome c oxidase, which is one of the most important enzymes for preserving the Life, reduces molecular oxygen (O2) coupled with proton pumping which creates the proton gradient for driving ATP synthesis by FoF1 ATPase. By using the X-ray free electron laser facility, we have succeeded in (i) determination of the O2 reduction site and (ii) showing that the pumping proton back leak is blocked by O2 binding to a copper ion site included in the O2 reduction site. The O2 reduction site structure has been yet to be determined for the last 50 years. The latter accomplishment together with the former set a mile stone for elucidation of the mechanism of this enzyme at the hydrogen atom level resolution which is a dream of most of Life Scientist.

Research Products

• [Int'l Joint Research] Oxford大学化学科(英国)
• [Journal Article] Complex structure of cytochrome c-cytochrome c oxidase reveals a novel protein-protein interaction mode (2017)
  • Author(s): Satoru Shimada, Kyoko Shinzawa‐Itoh, Junpei Baba, Shimpei Aoe, Atsuhiro Shimada, Eiki Yamashita, Jiyoung Kang, Masaru Tateno, Shinya Yoshikawa, and Tomitake Tsukihara
  • Journal Title: EMBO J. Volume: 86 Issue: 3 Pages: 291-300
  • DOI: 10.15252/embj.201695021
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Osuda Y, Shinzawa-Itoh K, Tani K, Maeda S, Yoshikawa S, Tsukihara T, Gerle C. (2016)
  • Author(s): Osuda Y, Shinzawa-Itoh K, Tani K, Maeda S, Yoshikawa S, Tsukihara T, Gerle C.
  • Journal Title: Microscopy Volume: 65 Issue: 3 Pages: 263-267
  • DOI: 10.1093/jmicro/dfv381
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Energetic Mechanism of Cytochrome c - Cytochrome c Oxidase Electron Transfer Complex Formation under Turnover Conditions Revealed by Mutational Effects and Docking Simulation (2016)
  • Author(s): W. Sato, S. Hitaoka, K. Inoue, M. Imai, T. Saio, T. Uchida, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, K. Yoshizawa, and K. Ishimori
  • Journal Title: J. Biol. Chem. Volume: 291 Issue: 29 Pages: 15320-15331
  • DOI: 10.1074/jbc.m115.708065
  • NAID: 120006324913
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] The Mg2+-containing Water Cluster of Mammalian Cytochrome c Oxidase Collects Four Pumping Proton Equivalents in Each Catalytic Cycle (2016)
  • Author(s): Yano N, Muramoto K, Shimada A, Takemura S, Baba J, Fujisawa H, Mochizuki M, Shinzawa-Itoh K, Yamashita E, Tsukihara T, Yoshikawa S.
  • Journal Title: J. Biol. Chem. Volume: 291 Issue: 46 Pages: 23882-23894
  • DOI: 10.1074/jbc.m115.711770
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Dimer interface of bovine cytochrome c oxidase is influenced by local posttranslational modifications and lipid binding (2016)
  • Author(s): Idlir Liko, Matteo Degiacomi, Shabaz Mohammed, Shinya Yoshikawa, Carla Schmidt and Carol V. Robinson,
  • Journal Title: Proc. Natl. Acad. Sci. USA Volume: 113 Issue: 29 Pages: 8230-8235
  • DOI: 10.1073/pnas.1600354113
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] X-ray structure of cyanide-bound bovine heart cytochrome c oxidase in the fully oxidized state at 2.0 angstrom resolution. (2015)
  • Author(s): Yano N, Muramoto K, Mochizuki M, Shinzawa-Itoh K, Yamashita E, Yoshikawa S, Tsukihara
  • Journal Title: Acta Cryst. F Volume: 71 Issue: 6 Pages: 726-730
  • DOI: 10.1107/s2053230x15007025
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Stepwise Binding of Two Azide Ions to the O2-reduction Site of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase Shown by Resonance Raman Analyses (2015)
  • Author(s): M. Hikita, A. Yamamoto, K. Shinzawa-Itoh, T. Ogura, S. Yoshikawa
  • Journal Title: Chem. Lett. Volume: 44 Issue: 8 Pages: 1142-1144
  • DOI: 10.1246/cl.150384
  • NAID: 130005092608
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Higdla is a oositive regulaator of cytochrome c oxidase (2015)
  • Author(s): T. Hayashi, Y. Asano, Y. Shintani, H. Aoyama, H. Kioka, O. Tsukamoto, M. Hikita, K. Shinzawa-Itoh, K. Takajuji, S. Higo, H. Kato, S. Yamazaki, K. Matsuoka, A. Nakano, H. Asanuma, M. Asakura, T. Minamino, Y. Goto, T. Ogura, M. Kitakaze, I. Komuro, Y. Sakata, T. Tsukihara, S. Yoshikawa, S. Takashima
  • Journal Title: Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. Volume: 112 Issue: 5 Pages: 1553-1558
  • DOI: 10.1073/pnas.1419767112
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Reaction mechanism of cytochrome c oxidase (2015)
  • Author(s): Yoshikawa, S., Shimada, A.
  • Journal Title: Chem. Rev Volume: 112 Issue: 4 Pages: 1936-1989
  • DOI: 10.1021/cr500266a
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] 膜タンパク質機能解析のための結晶構造解析戦略 (2015)
  • Author(s): 吉川信也
  • Journal Title: Ｄｏｊｉｎ Ｎｅｗｓ Volume: １５２ Pages: 7-15
  • Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] フェムト秒レーザー結晶構造解析法を用いた無損傷休止型チトクロム酸化酵素の構造解析 (2015)
  • Author(s): 吉川信也
  • Journal Title: Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｔｈｅ Ｊａｐａｎｅｓｅ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｓｙｎｃｈｒｏｔｒｏｎ Ｒａｄｉａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Volume: ２８ Pages: 56-66
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Determination of damage-free crystal structure of an X-ray sensitive protein using an XFEL (2014)
  • Author(s): Hirata K, Shinzawa-Itoh K, Yano N, Takemura S, Kato K, Hatanaka M, Muramoto K, Kawahara T, Tsukihara T, Yamashita E, Tono K, Ueno G, Hikima T, Murakami H, Inubushi Y, Yabashi M, Ishikawa T, Yamamoto M, Ogura T, Sugimoto H, Shen J-R, Yoshikawa S, Ago H
  • Journal Title: Nature Methods Volume: 11 Issue: 7 Pages: 734-736
  • DOI: 10.1038/nmeth.2962
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effects of proton motive force on the structure and dynamics of bovine cytochrome c oxidase in phospholipid visicles (2014)
  • Author(s): T. Nomura, S. Yanagisawa, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, and T. Ogura
  • Journal Title: Biochemistry Volume: 53 Issue: 40 Pages: 6382-6391
  • DOI: 10.1021/bi501022j
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Improved X-ray structures of bovine heart cytochrome c oxidase reveal redox-driven proton active transports by Mg2+-containing water cluster (2014)
  • Author(s): Shinya Yoshikawa, Naomine Yano, Kyoko Shinzawa-Itoh, Kazumasa Muramoto, Eiki Yamashita, Tomitake Tsukihara
  • Journal Title: Biochimica et Biophysica Acta (BBA), Bioenergetics Volume: 1837 Pages: e103-e104
  • DOI: 10.1016/j.bbabio.2014.05.186
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] Reaction mechanism of cytohrome c oxidase (2017)
  • Author(s): S. Yoshikawa
  • Organizer: IGER International Symposium on Physics of Life
  • Place of Presentation: ES hall, Nagoya Yuniversity (愛知県名古屋市）
  • Year and Date: 2017-03-25
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Processing of XFELstill images with a reference oscillation data set for crystal structural analyses of cytochrome c oxidase (2016)
  • Author(s): L. Fangjia, A. Shimada, K. Yamashita, K. Hirata, M. Yamamoto, K. Shinzawa-Itoh, S.Yoshikawa, T. Tsukihara
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] Elucidating the nmehanism of proton pumping in cytochrome c oxidase by time resolved IR spectroscopy (2016)
  • Author(s): C. Li, T. Nishiguchi, S. Yamauchi, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, S. Nakashima, T. Ogura
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] Detailed crystal structural studies of bovine cytochrome oxidase to elucidate the coupling of dioxygen reduction and proton pumping (2016)
  • Author(s): T. Tsukihara, A. Shimada, N. Yano, K. Muramoto, K. Shinzawa-Itoh, E. Yamshita, S. Yoshikawa
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] Complex structure of cytochrome c and cytochrome c oxidase shows a novel inter-protein interaction mode. (2016)
  • Author(s): Shimada S, Shinzawa-Itoh K, Baba J, Aoe S, Shimada A, Yamashita E, Kang J, Tateno M, Yoshikawa S, Tsukihara T
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] Interaction analysis of electron transfer complex formation between cytochrome c-cytochrome c oxidaseusing fluorescence anisotropy (2016)
  • Author(s): H. Kagaya, W. Sato, T. Uchida, K. Shinzawa Itoh, S. Yoshikawa, K. Ishimori
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] The effect of the hydrogen bond network on the oxygen reduction of cytochrome c oxidase (2016)
  • Author(s): Y. Aoyagi, T. Nishiguchi, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, S. Nakashima, T. Ogura
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] Coupling mechanism of cytochrome c oxidase studied by timeresolved resonance Raman spectroscopy (2016)
  • Author(s): S. Nakashima, Y. Nakagawa, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, T. Ogura
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] Functional significance of dehydration for formaton of electron transfer complex between cytochrome c and cytochrome c oxidase (2016)
  • Author(s): W. Sato, K. shinzawa-Itoh, T. Uchida, P. Brezezinski, S. Yoshikawa, K. Ishimori
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] High-resolution crystal structure of cytochrome c oxidase reveals the mechanism of highly efficient protonpumping (2016)
  • Author(s): A. Shimada, N. Yano, K. Muramoto, E. Yamashita, K. shinzawa-Itoh, T. Tsukihara, S. Yoshikawa,
  • Organizer: 第５４回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県・つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] The Mg2+-containing water cluster of mammalian cytochrome c oxidase collects four pumping proton equivalents in each catalytic cycle (2016)
  • Author(s): S. Yoshikawa
  • Organizer: EBEC 2016, 19th European Bioenergetics Conference
  • Place of Presentation: Riva del Garda (Italy)
  • Year and Date: 2016-07-02
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Processing of XFEL still images with a refference oscillation data set for crystal structural analyses of cytochrome coxidase (2016)
  • Author(s): L. Fangja, A. Shimada, K. Yamashita, K. Hirata, K. Shinzwa-Itoh, T. Tsukihara, S. Yoshikawa
  • Organizer: 日本蛋白質科学会第１６回年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡県・福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] Structure of complex of cytochrome c and cytochrome c oxidase shows the novel protein-protein interaction style (2016)
  • Author(s): Shimada S, Shinzawa-Itoh K, Baba J, Aoe S, Shimada A, Yamashita E, Kang J, Tateno M, Yoshikawa S, Tsukihara T
  • Organizer: 日本蛋白質科学会第１６回年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡県・福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] Time resolved crystallographic analysis of cytochrome c oxidase using X-ray free electron laser (2016)
  • Author(s): Keita Hatano, Atsuhiro Shimada, Akari Miyamoto, Seiki Baba, Keitaro Yamashita, Minoru Kubo, Hideo Ago, Kunio Hirata, Go Ueno, Hironori Murakami, Masaki Yamamoto, Takashi Kumasaka, Eiki Yamashita, Takashi Ogura, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, Tomitake Tsukihara
  • Organizer: 日本蛋白質科学会第１６回年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡県・福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] Development of thawing method of frozen protein crystal for ｈigh resolution crystal structure analysis at room temperature (2016)
  • Author(s): Akari Miyamoto, Atsuhiro Shimada, Keita Hatano, Seiki Baba, Takashi Kumasaka, Kyoko Shinzawa-Itoh, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa
  • Organizer: 日本蛋白質科学会第１６回年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡県・福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] X-ray crystal structure of F-intermediate of cytochrome c oxidase at 1.6 angstrom resolution (2016)
  • Author(s): Yuki Eto, Atsuhiri Shimada, Eiki Yamashita Kyoko Shinzawa-Itoh, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa
  • Organizer: 日本蛋白質科学会第１６回年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡県・福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] Dynamics at the reaction site of cytochrome c oxidase studied by time-resolved resonance Raman spectroscopy (2016)
  • Author(s): S. Nakashima, Y. Nakagawa, K. Shinzwa-Itoh, S. Yoshikawa, T. Ogura
  • Organizer: 日本蛋白質科学会第１６回年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡県・福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] The proton pump mechanism suggested from the crystal structures of cytochrome c oxidase intermediates and their derivatives. (2016)
  • Author(s): A. Shimada, J. Baba, E. Yamashita, K. muramoto, K. Shinzawa-Itoh, T.Tsukihara, S. Yoshikawa
  • Organizer: 日本蛋白質科学会第１６回年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡県・福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] Time-resolved IR spectroscopic studies for proton pumping mechanisms of cytochrome c oxidase (2016)
  • Author(s): *C. Li, T. Nishiguchi, S. Yamauchi, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, S. Nakashima, T. Ogura
  • Organizer: 日本化学会第96回春季年会
  • Place of Presentation: 同志社大学京田辺キャンパス(京都府京田辺市）
  • Year and Date: 2016-03-24
• [Presentation] 時間分解共鳴ラマン分光法によるチトクロムc酸化酵素のCO光解離に伴う構造ダイナミクスの研究 (2016)
  • Author(s): 中川善之・伊藤-新澤 恭子・吉川信也・中島 聡・小倉尚志
  • Organizer: 日本化学会第96回春季年会
  • Place of Presentation: 同志社大学京田辺キャンパス(京都府京田辺市）
  • Year and Date: 2016-03-24
• [Presentation] チトクロムc酸化酵素のP中間体の紫外共鳴ラマン分光 (2016)
  • Author(s): 渡邉祥子・柳澤幸子・伊藤-新澤 恭子・吉川信也・小倉尚志
  • Organizer: 日本化学会第96回春季年会
  • Place of Presentation: 同志社大学京田辺キャンパス(京都府京田辺市）
  • Year and Date: 2016-03-24
• [Presentation] チトクローム酸化酵素の水素結合状態変化の酸素還元反応への影響 (2016)
  • Author(s): 青柳裕大・西口達人・伊藤-新澤 恭子・吉川信也・中島 聡・小倉尚志
  • Organizer: 日本化学会第96回春季年会
  • Place of Presentation: 同志社大学京田辺キャンパス(京都府京田辺市）
  • Year and Date: 2016-03-24
• [Presentation] 常温嫌気結晶試料の動的構造解析へ向けた自動サンプルチェンジャーSPACEの高度化 (2015)
  • Author(s): 上野剛、平田邦生、吾郷日出夫、村上博則、馬場清喜、島田敦広、熊坂崇、伊藤-新澤恭子、吉川信也、月原冨武、山本雅貴
  • Organizer: 常温嫌気結晶試料の動的構造解析へ向けた自動サンプルチェンジャーSPACEの高度化
  • Place of Presentation: 大阪府立大学 中百舌鳥キャンパス（大阪府堺市）
  • Year and Date: 2015-10-18
• [Presentation] Molecular Mechanisms of Cytochrome c Oxidase as Studied by Vibrational Spectroscopy (2015)
  • Author(s): T. Ogura, N. Satoru, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa
  • Organizer: 5th Asian Spectroscopy Conference on Vibrational Spectroscopy
  • Place of Presentation: Sydney, Australia
  • Year and Date: 2015-09-29
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] チトクロームc酸化酵素における酸素還元反応とプロトンポンプ共役機構 (2015)
  • Author(s): 中島 聡・西口達人・李 辰・伊藤-新澤 恭子・吉川信也・小倉尚志
  • Organizer: 第53回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • Year and Date: 2015-09-13
• [Presentation] Development of high-resolution X-ray diffraction experiments at room temperature (2015)
  • Author(s): 波多野 啓太、宮本 朱梨、島田 敦広、馬場 清喜、熊坂 崇、伊藤ー新澤 恭子、月原 冨武 、吉川 信也
  • Organizer: 第53回 日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • Year and Date: 2015-09-13
• [Presentation] Active supercomplex purified from bovine heart reveals the functional unit of the mitochondrial respiratory chain (2015)
  • Author(s): 伊藤-新澤 恭子、下村 陽信、柳澤 幸子、島田 悟、高橋 涼子、上根 滋史、小倉 尚志、吉川 信也、月原 冨武
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • Year and Date: 2015-09-13
• [Presentation] The X-ray structural analysis of O intermediate of bovine heart cytochrome c oxidase. (2015)
  • Author(s): 江藤 勇樹、島田 敦広、原 史剛、山下 栄樹、伊藤ー新澤 恭子、月原 冨武、吉川 信也
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • Year and Date: 2015-09-13
• [Presentation] チトクロム酸化酵素 F 型中間体の高分解能 Ｘ 線結晶構造解析 (2015)
  • Author(s): 江藤 勇樹、島田 敦広、前田 友子、山下 栄樹、村本 和優、伊藤- 新澤 恭子、月原 冨武、吉川 信也
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
• [Presentation] チトクロム酸化酵素内のMgを含む水クラスターが酸素取り込み前に4等量のプロトンを蓄積することで、高効率プロトンポンプ反応を可能にする (2015)
  • Author(s): 島田 敦広、矢野 直峰、武村 秀平、村本 和優、山下 栄樹、伊藤－新澤 恭子、前田 友子、月原 冨武、吉川 信也
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
• [Presentation] 中性領域(pH7.3) でのウシ心筋チトクロム酸化酵素の結晶化及び構造解明 (2015)
  • Author(s): 萩本 楓、伊藤- 新澤 恭子、島田 敦広、島田 悟、Luo Fangjia、山下 栄樹、吉川 信也、月原 冨武
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
• [Presentation] 機能を保持したウシ心筋ミトコンドリア呼吸鎖超複合体の調製 (2015)
  • Author(s): 伊藤-新澤恭子・下村陽信・柳澤幸子・島田 悟・小倉尚志・月原富武
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
• [Presentation] チトクロム酸化酵素の真のアジ化物イオン結合型構造により明らかになった、酸素還元中心の構造変化とプロトンポンプ経路の関係性 (2015)
  • Author(s): 波多野 啓太、島田 敦広、引田 理英、蓼原 瞳、山本 旭麻、山下 栄樹、前田 友子、伊藤- 新澤 恭子、月原 冨武、吉川 信也
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
• [Presentation] シアン結合完全還元型チトクロム酸化酵素のX 線結晶構造解析から明らかになった、 (2015)
  • Author(s): 馬場 淳平、島田 敦広、山下 栄樹、村本 和優、伊藤- 新澤 恭子、月原 冨武、吉川 信也
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
• [Presentation] チトクロムc とチトクロム酸化酵素共結晶の高分解能X 線結晶構造に基づく相互作用解明 (2015)
  • Author(s): 島田 悟、青江 新平、伊藤- 新澤 恭子、島田 敦広、馬場 淳平、武村 秀平、山下 栄樹、吉川 信也、月原 冨武
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
• [Presentation] Newly Developed systems of time-resolved IR spectroscopy for elucidating the proton pumping reaction of cytochrome c oxidase (2015)
  • Author(s): C. Li, T. Nishiguchi, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, S. Nakashima, T. Ogura
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
• [Presentation] Collection of 4 pumping-proton equivalents into Mg2+-containing water cluster of cytochrome c oxidase, revealed by X-ray analyses (2015)
  • Author(s): S. Yoshikawa, N. Yano, A. Shimada, K. Muramoto, S. Takemura, K. Shinzawa-Itoh, E. Yamashita, T. Tsukihara
  • Organizer: Bioenergetics, Gordon Research Conferences
  • Place of Presentation: Procter Academy Andover, NH (USA)
  • Year and Date: 2015-06-21
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] チトクロームc酸化酵素の酸素還元反応とプロトンポンプの共役機構 (2015)
  • Author(s): 中島 聡・西口達人・Chen Li・中川善之・青柳裕大・新澤-伊藤恭子・吉川信也・小倉尚志
  • Organizer: 第42回生体分子科学討論会
  • Place of Presentation: 高崎シティーギャラリーコアホール（群馬県高崎市）
  • Year and Date: 2015-06-12
• [Presentation] Effects of Proton Motive Force on the Structure and Dynamics of Cytochrome c Oxidase: Resonance Raman Spectroscopy (2015)
  • Author(s): *T. Ogura, T. Nomura, S. Yanagisawa, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa
  • Organizer: 5th Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry (CanBIC5)
  • Place of Presentation: Parry Sound, Canada
  • Year and Date: 2015-05-19
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Proton pump mechanism of bovine heart cytochrome c oxidase (2015)
  • Author(s): 吉川信也
  • Organizer: 日本生物物理学会北海道支部講演会
  • Place of Presentation: 北大理学部(北海道・札幌市)
  • Year and Date: 2015-03-04
  • Invited
• [Presentation] チトクロムc とチトクロム酸化酵素複合体のX 線結晶構造解析 (2014)
  • Author(s): Satoru Shimada, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shimpei Aoe, Atsuhiro Shimada, Jumpei Baba, Syuhei Takemura, Eiki Yamashita, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa
  • Organizer: 第５２回日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
  • Year and Date: 2014-09-27
• [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖のシトクロムc-シトクロムc 酸化酵素複合体における 電子伝達反応の構造制御機構 (2014)
  • Author(s): Mizue Imai1, Wataru Sato, Kaoru Inoue, Koichi Sakamoto, Kyoko Shinzawa, Takeshi Uchida, Shinya Yoshikawa, Koichiro Ishimori
  • Organizer: 第５２回日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
  • Year and Date: 2014-09-26
• [Presentation] チトクローム酸化酵素の反応初期過程における共役機構の解明 (2014)
  • Author(s): Satoru Nakashima, Minoru Kubo, Izumi Ishigami, Kyoko Itoh-Shinzawa, Shinya Yoshikawa, Takashi Ogura
  • Organizer: 第５２回日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
  • Year and Date: 2014-09-26
• [Presentation] チトクロムc 酸化酵素の酸素還元反応の時間分解赤外吸収測定を目的とした酸素肺フローシステムの開発 (2014)
  • Author(s): Tatsuhito Nishiguchi, Masahide Hikita, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, Satoru Nakashima, Takashi Ogura
  • Organizer: 第５２回日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
  • Year and Date: 2014-09-26
• [Presentation] アジ化物結合型チトクロム酸化酵素の高分解能 X 線結晶構造解析によるアジ化物結合様式の解析 (2014)
  • Author(s): Atsuhiro Shimada, Masahide Hikita, Hitomi Tadehara, Akima Yamamoto, Eiki Yamashita, Kyoko Shinzawa-Itoh, Tomoko Maeda, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa
  • Organizer: 第５２回日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
  • Year and Date: 2014-09-25
• [Presentation] 高度に組織化された鉄イオンの機能により駆動されるチトクロム酸化酵素反応機構 (2014)
  • Author(s): 吉川信也、
  • Organizer: 鉄バイオサイエンス学会第３８回学術集会
  • Place of Presentation: 仙台国際センター(宮城県・仙台市)
  • Year and Date: 2014-09-06 – 2014-09-07
  • Invited
• [Presentation] Improved X-ray structures of bovine heart cytochrome c oxidase reveal redox-driven proton active transports by Mg2+-containing water cluster (2014)
  • Author(s): Shinya Yoshikawa, Naomine Yano, Kyoko Shinzawa-Itoh, Kazumasa Muramoto, Eiki Yamashita, Tomitake Tsukihara
  • Organizer: European Bioenrgetics Conference (EBEC)2014
  • Place of Presentation: Lisbon （Portugal）
  • Year and Date: 2014-07-12 – 2014-07-17
• [Presentation] CO結合型ウシ心筋チトクロムc酸化酵素に対する高分解能Ｘ線結晶構造解析法を用いた金属酸化還元中心によるプロトンポンプ制御機構の解明 (2014)
  • Author(s): 矢野直峰、武村秀平、前田友子、村本和優、山下栄樹、伊藤―新澤恭子、月原冨武、吉川信也
  • Organizer: 第１４回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: ワークピア横浜/横浜産貿ホールマリネリア(神奈川県・横浜市)
  • Year and Date: 2014-06-26
• [Presentation] Highly stable tubes of bovine mitochondrial F-ATP synthase suitable for electron cryo tomography (2014)
  • Author(s): Chimari Jiko, Kyoko Shinzaw-Itoh, Shintaro Maeda, Karen Davies, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa
  • Organizer: 第１４回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: ワークピア横浜/横浜産貿ホールマリネリア(神奈川県・横浜市)
  • Year and Date: 2014-06-26
• [Presentation] CN-結合型およびCN-結合部分還元型チトクロムc酸化酵素の高分解能Ｘ線結晶構造解析 (2014)
  • Author(s): 川原貴子、長尾修平、島田敦広、矢野直峰、武村秀平、前田友子、村本和優、伊藤―新澤恭子、山下栄樹、月原冨武、吉川信也
  • Organizer: 第１４回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: ワークピア横浜/横浜産貿ホールマリネリア(神奈川県・横浜市)
  • Year and Date: 2014-06-26
• [Book] “Respiratory Conservation of Energy with Dioxygen: Cytochrome c Oxidase” Metals Ions in Life Sciences Vol. 15, Sustaining Life on Planet Earth: Metalloenzymes Mastering Dioxygen and Other Chewy Gases (2015)
  • Author(s): Yoshikawa, S., Shimada, A., and Shinzawa-Itoh, K
  • Publisher: Springer, Dordrecht
• [Book] “XFEL studies on bovine heart cytochrome c oxidase” ADVANCES IN PHOTOSYNTHESIS AND RESPIRATION Including Bioenergy and Related Processes (2015)
  • Author(s): Yoshikawa, S
  • Publisher: Springer, Dordrecht