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Investigation of biosilicification mechanism in geothermal environment

Research Project

Project/Area Number 26292182
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypePartial Multi-year Fund
Section一般
Research Field Environmental agriculture(including landscape science)
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

Doi Katsumi  九州大学, 農学研究院, 教授 (40253520)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田代 康介  九州大学, 農学研究院, 准教授 (00192170)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2017: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2014: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
Keywordsシリカ / バイオミネラリゼーション / メタゲノム / Thermus / Geobacillus / 鉄飢餓 / プロモーター / シリカスケール / シリカ誘導性タンパク質 / γ-Proteobacteria門 / プロモーターアッセイ / Thermus thermopiles / 金属元素 / Thermus thermopilus / 超好熱アーキア / Feric uptake regulator / 環境 / 応用微生物 / ゲノム / シグナル伝達 / 金属応答 / 好熱微生物
Outline of Final Research Achievements

This work aims to investigate biosilicification mechanism in geothermal environment. To complete the study, we carried out metagenomic analysis of microflora in geothermal water and silica scale formed in the geothermal water. Comparative genome analysis showed specific hyperthermophilc microrganisms habitat in only silica scale. According to the results, we examined biosilicification abilities of T. thermophilus, G. kaustophilus, and P. calidifontis as representatives. Among these thermophiles, availability of silica biodeposition of T. thermophilus was significant. We conclude that cell surface proteins of T. thermophilus (molecular weight; 45、57、70 kDa) function to interact with supersaturated silica in environment. These proteins are annotated periplasm localized ABC transporters by ESI-MS/MS analysis.

Report

(5 results)
  • 2017 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (48 results)

All 2018 2017 2016 2015 2014 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (13 results) (of which Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 9 results) Presentation (33 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results) Book (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Plant Protection Research Institute(ベトナム)

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      Volume: 82 Issue: 11 Pages: 3198-3207

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      Volume: - Pages: 1-11

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      Volume: 36 Issue: 11 Pages: 2245-2248

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      Hai Bang T, Suhara H, Doi K, Ishikawa H, Fukami K, Parajuli GP, Katakura Y, Yamashita S. Watanabe K, Adhikari MK, Manandhar HK, Kondo R, Shimizu K.
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      Evidence-based Complementary and Alternative Medicine

      Volume: 2014 Issue: 1 Pages: 195305-195305

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      第23回 日本生物工学会九州支部 飯塚大会
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      九州工業大学 飯塚キャンパス
    • Year and Date
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      千羽 啓太, 黒木 未知瑠, 原田 額郎, 片倉 喜範, 土居 克実
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      日本分子生物学会 第39回(2016年)年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2016-11-30
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      Mina Kim, Hindra Martono, Yuko Nagayoshi, Junpei Maeda, Yasuhiro Fujino and Katsumi Doi
    • Organizer
      The 13th International Joint Symposium between Korea and Japan
    • Place of Presentation
      Hotel InterCiti
    • Year and Date
      2016-11-09
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      The 13th International Joint Symposium between Korea and Japan
    • Place of Presentation
      Hotel InterCiti
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      2016-11-09
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      ファージ・環境ウイルス研究会 合同シンポジウム
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      海洋研究開発機構
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      2016-10-21
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    • Year and Date
      2016-07-02
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      千羽啓太,黒木未知瑠,原田額郎,片倉喜範,土居克実
    • Organizer
      第53回化学関連支部合同九州大会
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      北九州国際会議場
    • Year and Date
      2016-07-02
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      札幌コンベンションセンター
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      2016-03-29
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      第10回 日本ゲノム微生物学会
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    • Year and Date
      2016-03-04
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    • Organizer
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    • Place of Presentation
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    • Organizer
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    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2015-03-28
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    • Organizer
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      岡山大学
    • Year and Date
      2015-03-27
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      岡山大学
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      佐賀大学
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      2014-09-04 – 2014-09-05
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    • Organizer
      第5回ファージ研究会
    • Place of Presentation
      三重大学生物資源学部
    • Year and Date
      2014-09-04 – 2014-09-05
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    • Author(s)
      田上諒、藤野泰寛、土居克実
    • Organizer
      第51回化学関連支部合同九州大会
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場
    • Year and Date
      2014-06-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 地熱環境に生息する好熱性繊維状ファージの特性解析2014

    • Author(s)
      永吉佑子、相川浩輝、熊谷健太、藤野泰寛、土居克実
    • Organizer
      第51回化学関連支部合同九州大会
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場
    • Year and Date
      2014-06-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Book] アーキア生物学2017

    • Author(s)
      永吉 佑子, 土居 克実
    • Total Pages
      212
    • Publisher
      共立出版
    • ISBN
      9784320057852
    • Related Report
      2017 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-04-04   Modified: 2022-02-16  

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