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Elucidation of mechanisms for genomic integrity through establishing novel tools for genetic analysis in Thermus thermophilus.

Research Project

Project/Area Number 26340029
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Risk sciences of radiation and chemicals
Research InstitutionInternational Christian University

Principal Investigator

NUNOSHIBA Tatsuo  国際基督教大学, 教養学部, 教授 (10270802)

Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) HIRATSU KEIICHIRO  防衛大学校, 応用化学群, 准教授 (00294538)
Research Collaborator AIHATRA REIKO  
NISHIMURA MIKI  
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords高度好熱菌 / ゲノム情報維持 / 突然変異 / 相同組み換え / 遺伝子発現 / レポーター / カロテノイド / シャトルベクター / 相同組換え / 光回復 / pyrophosphatase / 酸化損傷 / 脱塩基損傷 / 酸化DNA損傷 / 脱アミノ化損傷 / 損傷ヌクレオチド浄化 / AP endonuclease / ゲノム情報維持機構
Outline of Final Research Achievements

To investigate genome integrity in Thermus thermophilus, which survives in extreme environment around 70°C, three assays from genetic approach were established. They were i) mutation assay to analyze mutation spectra by using E. coli supF gene as a target, ii) assay to examine the frequency of homologous recombination, iii) assay to monitor the gene expression by monitoring yellow color carotenoid encoded by the crtB gene.
By using these assays, contribution to genome integrity of AP endonuclease, which can repair the abasic site, gene regulation mechanism of the phr gene whose product can repair UV induced DNA damage, and identification of Ham1 pyrophosphatase for deaminated nucleotides and its contribution to genome integrity.

Report

(4 results)
  • 2016 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2015 Research-status Report
  • 2014 Research-status Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2017 2016 2015 2014

All Presentation (22 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilus のsupF 変異検出系の構築2017

    • Author(s)
      外川 陽一郎、塩谷 詩織、布柴 達男、平津 圭一郎
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      ウェスティン都ホテル京都(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilusの突然変異検出系の構築2016

    • Author(s)
      塩谷 詩織、外川 陽一郎、河東 祐季、江崎 和音、牧野 耕三、布柴 達男、平津 圭一郎
    • Organizer
      日本分子生物学会 日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-30
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] OH生成の抑制機構に関わる3つの遺伝子とそのゲノム安定性への寄与2016

    • Author(s)
      佐藤 翼, 岩田 梨佳、布柴 達男
    • Organizer
      日本環境変異原学会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Zn-SOD における家族性筋萎縮性側索硬化症 (fALS) 関連の突然変異が酵母のゲノム安定性に与える影響2016

    • Author(s)
      金子 秋穂、小野田 麻由、岩田 梨佳、平津 圭一郎、布柴 達男
    • Organizer
      日本環境変異原学会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilusの突然変異検出系の構築2016

    • Author(s)
      塩谷 詩織、外川 陽一郎、河東 祐季、江崎 和音、布柴 達男、平津 圭一郎
    • Organizer
      日本環境変異原学会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilusの突然変異検出系の構築2016

    • Author(s)
      塩谷 詩織、外川 陽一郎、河東 祐季、江崎 和音、牧野 耕三、布柴 達男、平津 圭一郎
    • Organizer
      第29回変異機構研究会
    • Place of Presentation
      京都府立ゼミナールハウス(京都府京都市)
    • Year and Date
      2016-09-09
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilusの突然変異検出系の構築2015

    • Author(s)
      塩谷詩織、河東 祐季、江崎 和音、牧野 耕三、布柴 達男、平津 圭一郎
    • Organizer
      日本分子生物学会 日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸)
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] Introduction ~故きを訪ねて DNA damage and mutagenesis induced by oxidative stress2015

    • Author(s)
      布柴達男
    • Organizer
      日本環境変異原学会第44回大会シンポジウム 『酸化ストレスによる生物影響』
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡)
    • Year and Date
      2015-11-27
    • Related Report
      2015 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Roles of GO system on genome integrity in Thermus thermophilus2015

    • Author(s)
      小野坂規賀子、宮下久枝、西村美起、平津圭一郎、布柴達男
    • Organizer
      日本環境変異原学会第44回大会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡)
    • Year and Date
      2015-11-27
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] Purification and identification of pyrophosphatase Ham1 for the sanitization of deaminated nucleotides in Thermus thermophilus2015

    • Author(s)
      西村美起、森本絵美子、平津圭一郎、布柴達男
    • Organizer
      日本環境変異原学会第44回大会シンポジウム 『酸化ストレスによる生物影響』
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡)
    • Year and Date
      2015-11-27
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 高度好熱菌の脱アミノ化ヌクレオチド浄化酵素Ham1の活性測定とゲノム安定化における役割2015

    • Author(s)
      西村美起、森本絵美子、平津圭一郎、米良花香、布柴達男
    • Organizer
      日本極限環境生物学会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学(東京)
    • Year and Date
      2015-11-08
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 酸化ストレスで生じる突然変異の由来は?2015

    • Author(s)
      布柴達男
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会ワークショップ 『どこから来たのか、そしてどこへ行くのか ~ヌクレオチド損傷をとりまく仕組み』
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台)
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Related Report
      2015 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 高度好熱菌の脱アミノ化ヌクレオチド浄化酵素Ham1の精製と機能解析2015

    • Author(s)
      西村美起、森本絵美子、平津圭一郎、米良花香、布柴達男
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台)
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] ヌクレオチド損傷とゲノム安定化機構~ヌクレオチド損傷浄化機構の役割~2015

    • Author(s)
      布柴達男
    • Organizer
      福岡歯科大学先端・老化研究推進戦略セミナー
    • Place of Presentation
      福岡歯科大学(福岡)
    • Year and Date
      2015-05-22
    • Related Report
      2015 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 植物ゲノムに生じる紫外線(UV-C)誘発変異の検出と変異スペクトル解析2014

    • Author(s)
      中村宗久、牧野耕三、布柴達男、平津圭一郎
    • Organizer
      日本環境変異原学会第43回大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-12-04 – 2014-12-05
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Analysis of Genomic Integrity in Thermus thermophilus -The Roles of AP endonuclease-2014

    • Author(s)
      Reiko Aihara, Hanaka Mera, Kazune Esaki, Keiichiro Hiratsu, Tatsuo Nunoshiba
    • Organizer
      日本環境変異原学会第43回大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-12-04 – 2014-12-05
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Purification and identification of pyrophosphatase Ham1 for the sanitization of deaminated nucleotides in Thermus thermophilus2014

    • Author(s)
      Miki Nishimura, Emiko Morimoto, Keiichiro Hiratsu, Tatsuo Nunoshiba
    • Organizer
      日本環境変異原学会第43回大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-12-04 – 2014-12-05
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 紫外線照射により植物ゲノムに生じる突然変異スペクトルの線量依存性2014

    • Author(s)
      中村宗久、牧野耕三、布柴達男、平津圭一郎
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 高度好熱菌のゲノム維持機構の解明 ~AP endonuclease nfoの役割~2014

    • Author(s)
      相原玲子、米良花香、江崎和音、平津圭一郎、布柴達男
    • Organizer
      日本遺伝学会第86回大会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Year and Date
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilusの光回復酵素遺伝子の発現機構2014

    • Author(s)
      西村美紀、相原玲子、平澤祐啓、平津圭一郎、布柴達男
    • Organizer
      日本遺伝学会第86回大会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Year and Date
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 出芽酵母の銅/亜鉛スーパーオキシドディスムターゼのゲノム安定性の維持における役割2014

    • Author(s)
      小野田麻由、岩田梨佳、相原玲子、西村美起、布柴達男
    • Organizer
      第26回変異機構研究会
    • Place of Presentation
      小牧市
    • Year and Date
      2014-06-21 – 2014-06-22
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 植物ゲノムに生じる紫外線(UV-C)誘発変異の検出と変異スペクトル解析2014

    • Author(s)
      中村宗久、長谷部航、牧野耕三、布柴達男、平津圭一郎
    • Organizer
      第26回変異機構研究会
    • Place of Presentation
      小牧市
    • Year and Date
      2014-06-21 – 2014-06-22
    • Related Report
      2014 Research-status Report

URL: 

Published: 2014-04-04   Modified: 2018-03-22  

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