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原核生物から真核生物への進化に伴う生物時計の普遍性と進化の解明

Research Project

Project/Area Number 26440187
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Genetics/Chromosome dynamics
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

小内 清  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 研究員 (00402454)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords藍色細菌 / 生物発光 / 概日リズム / 生物時計
Outline of Annual Research Achievements

27年度は生物発光リズム系の改良を行い、リズム変異株の大規模スクリーニングと原因遺伝子として新規遺伝子を特定することを目指した。
昨年度に引き続き、PCC6803において生物発光リズムをイメージング法(高感度CCDカメラによって寒天培地上に生育させた多数のコロニーの生物発光を個別に認識して発光レベルを定量する方法)を実施するための改良を行った。PCC6803における発現レベルを改善したバクテリアルシフェラーゼ遺伝子を用いた新たな発光レポーター株を構築した。作製したいずれのレポーター株も高精度な大規模スクリーニングに十分な発光レベルを示さなかったが、最も発光レベルが高かったレポーター株では、イメージング法による発光リズムの検出と解析が可能であった。そこで、この株を標準株としてイメージング法による変異体のスクリーニングを実施した。定量精度に問題があったため分離した多くの変異株候補は、光電子増倍管を測光デバイスとするより高感度・高精度な測定装置で2次スクリーニングを行うと、変異表現型が再現できなかった。しかし、変異株候補の1つは発光リズムがほぼ観察できない(振幅が劇的に低下する)という表現型が2次スクリーニングで再現できた。
この変異体の既知の時計遺伝子群の塩基配列を調査し、いずれの遺伝子にも変異が見られなかったので、新規遺伝子の変異株であると考えられた。この変異株の原因遺伝子のクローニングを進めた。また、さらに多数の新規の変異体を得るために、イメージング法による変異株のスクリーニングを継続した。
今後、この新規の遺伝子を同定して、その機能を解明することにより、藍色細菌の時計機構の新たなメカニズムの解明が期待できる。また、この遺伝子のオーソログが真核植物に存在すれば、原核植物から真核植物への進化に伴う生物時計の進化の謎を解明する手がかりが得られると期待できる。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2016 2015 2014

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Importance of the monomer-dimer-tetramer interconversion of the clock protein KaiB in the generation of circadian oscillations in cyanobacteria2015

    • Author(s)
      Iida T, Mutoh, R, Onai, K, Morishita, M, Furukawa, Y, Namba, K, Ishiura, M
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 20 Issue: 3 Pages: 173-90

    • DOI

      10.1111/gtc.12211

    • Related Report
      2014 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comparative analysis of kdp and ktr mutants reveals distinct roles of the potassium transporters in the model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 68032014

    • Author(s)
      Nanatani, K., Shijuku, T., Takano, Y., Zulkifli, L., Yamazaki, Y., Tominaga, A., Souma, S., Onai, K., Morishita, M., Ishiura, M., Hagemann, M., Suzuki, I., Maruyama, H., Arai, F., Uozumi, N.
    • Journal Title

      J. Bacteriology

      Volume: - Issue: 4 Pages: 676-87

    • DOI

      10.1128/jb.02276-14

    • Related Report
      2014 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 遺伝子発現や細胞内タンパク質レベルのリアルタイム測定装置2016

    • Author(s)
      小内清
    • Organizer
      平成27年度 中部地区 医療・バイオ系シーズ発表会
    • Place of Presentation
      吹上ホール(名古屋市中小企業振興会館)、名古屋市
    • Year and Date
      2016-02-03
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける種子成熟遺伝子の発芽後の発現抑制に関わる新規因子の解析2015

    • Author(s)
      河合都妙、鈴木孝征、小内清、前尾健一郎、石浦正寛、東山哲也、中村研三
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(世田谷キャンパス)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
    • Related Report
      2014 Research-status Report

URL: 

Published: 2014-04-04   Modified: 2017-01-06  

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