Phylogeny and phylogeography of evergreen oaks (Quercus) in the warm temperate zone in Japan using genomic approach

• Project/Area Number: 26440214
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Biodiversity/Systematics
• Research Institution: Osaka University (2016-2017); Kyoto University (2014-2015)
• Principal Investigator: Aoki Kyoko 大阪大学, 連合小児発達学研究科, 寄附講座助教 (70378537)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2018-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2017)
• Budget Amount: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000); Fiscal Year 2016: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2015: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2014: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: 分子植物地理学 / 照葉樹林 / レフュジア / 遺伝的多様性 / 植食性昆虫 / 次世代シーケンス

Outline of Final Research Achievements

Phylogeny and phylogeography of evergreen oaks (Quercus) in the warm temperate zone in Japan were analyzed using a genomic approach (restriction site associated DNA sequence). Eight evergreen Quercus speceis (Q. gilva, Q. acuta, Q. salicina, Q. miyagii, Q. glauca, Q. myrsinifolia, Q. sessilifolia, Q. hondae) in Japan were clearly genetically differentiated.

Research Products

• [Journal Article] Detecting east-west genetic differentiation in Castanopsis (Fagaceae) on the main islands of Japan and north-south on the Ryukyu Islands, based on chloroplast haplotypes (2016)
  • Author(s): Kyoko Aoki, Saneyoshi Ueno, Takashi Kamijo, Hiroaki Setoguchi, Noriaki Murakami, Makoto Kato, Yoshihiko Tsumura
  • Journal Title: Plant Systematics and Evolution Volume: 302 Issue: 8 Pages: 1093-1107
  • DOI: 10.1007/s00606-016-1319-1
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] 【解 説】シリーズ「日本の森林樹木の地理的遺伝構造(11) シイ類(ブナ科シイ属) (2015)
  • Author(s): 青木京子
  • Journal Title: 森林遺伝育種 Volume: 4 Pages: 173-179
  • Open Access
• [Journal Article] 照葉樹林の歴史変遷を調べるー植物を食べる昆虫の情報も用いて (2015)
  • Author(s): 青木京子
  • Journal Title: 人環フォーラム「フィールド便り」 Volume: 34 Pages: 48-49
• [Presentation] RADseq法を用いた日本のカシ類の系統解析および種内の遺伝構造 (2017)
  • Author(s): 青木京子・瀬尾明弘・川口 利奈・手塚あゆみ・永野惇・井鷺裕司
  • Organizer: 日本植物分類学会第16回大会
  • Place of Presentation: 京都大学
  • Year and Date: 2017-03-09
• [Presentation] RADseq法を用いた日本のカシ類の系統解析 (2016)
  • Author(s): 青木京子・瀬尾明弘・手塚あゆみ・永野惇・井鷺裕司
  • Organizer: 日本植物分類学会第15回大会
  • Place of Presentation: 富山大学
  • Year and Date: 2016-03-06
• [Presentation] 照葉樹林の分布変遷過程―スダジイと種子食昆虫の集団動態から (2015)
  • Author(s): 青木京子・上野真義・玉木一郎・津村義彦・村上哲明・加藤 真
  • Organizer: 日本森林学会第126回大会
  • Place of Presentation: 北海道大学
  • Year and Date: 2015-03-27
  • Invited
• [Presentation] 日本植物学会第78回奨励賞受賞講演：植食性昆虫のDNA多型情報を利用した照葉樹林の植物地理学的研究 (2014)
  • Author(s): 青木京子
  • Organizer: 日本植物学会第78回大会
  • Place of Presentation: 明治大学
  • Year and Date: 2014-09-13
  • Invited
• [Book] ホルトノキ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」 (2015)
  • Author(s): 青木京子・村上哲明（津村義彦・陶山佳久（編））
  • Publisher: 文一総合出版
• [Book] バクチノキ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」 (2015)
  • Author(s): 青木京子・村上哲明（津村義彦・陶山佳久（編））
  • Publisher: 文一総合出版
• [Book] カナメモチ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」 (2015)
  • Author(s): 青木京子・村上哲明（津村義彦・陶山佳久（編））
  • Publisher: 文一総合出版
• [Book] コショウノキ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」 (2015)
  • Author(s): 青木京子・村上哲明（津村義彦・陶山佳久（編））
  • Publisher: 文一総合出版
• [Book] スダジイ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」 (2015)
  • Author(s): 上野真義・青木京子 （津村義彦・陶山佳久（編））
  • Publisher: 文一総合出版