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Study on biased species of actinomycetes in deep sea and its metabolites

Research Project

Project/Area Number 26450107
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionMicrobial Chemistry Research Foundation

Principal Investigator

IGARASHI Masayuki  公益財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究所, 部長 (40260137)

Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) SAWA Ryuichi  公益財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究所, 主席研究員 (50235454)
WADA Syunichi  公益財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究所, 上級研究員 (40450233)
HATANO Masaki  公益財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究所, 上級研究員 (40414106)
KATO Chiaki  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋生物多様性研究分野, シニアスタッフ (90360750)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords深海底泥 / 放線菌 / Micromonospora / 分類 / MALDI-TOF MS / 新規代謝物 / シデロフォア / enediyne / 代謝物 / 深海由来放線菌 / Nonomuraea / Streptomyces / 新規抗生物質 / 代謝物解析 / MALDI TOF MS / 抗生物質
Outline of Final Research Achievements

We focused on actinomycetes inhabiting deep-sea sediments and analyzed taxonomics, metabolites and bioactive substance production. The Actinomycetes isolated 204 strains from the Japan Trench, Sagami Bay, Okinawa Trough sediments. Taxonomical analysis was performed using phylogenetic analysis with 16S rDNA and MALDI-TOF MS. We also found a new actinomycete and established the evaluation method for actinomycetes by MALDI-TOF MS. For metabolite analysis, multivariate analysis based on metabolite analysis using LC-HRMS was performed. We discovered a new siderophore and a new endiyen including 5 kinds of related new compounds as new bioactive compounds. As a result of the analysis, it was found that metabolic product diversity greatly differs from deep-sea and terrestrial actinomycetes in comparison with taxonomic diversity.

Report

(4 results)
  • 2016 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2015 Research-status Report
  • 2014 Research-status Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2017 2016 2015 2014 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (13 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Fradiamine A, a new siderophore from the deep-sea actinomycete Streptomyces fradiae MM456M-mF7.2017

    • Author(s)
      Takehana Y, Umekita M, Hatano M, Kato C, Sawa R, Igarashi M.
    • Journal Title

      J Antibio.

      Volume: 70 Issue: 5 Pages: 611-615

    • DOI

      10.1038/ja.2017.26

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Stability and Bioavailability of Lentztrehaloses A, B, and C as Replacements for Trehalose.2016

    • Author(s)
      Wada S, Sawa R, Ohba S, Hayashi C, Umekita M, Shibuya Y, Iijima K, Iwanami F, Igarashi M.
    • Journal Title

      J Agric Food Chem.

      Volume: 64 Issue: 38 Pages: 7121-7126

    • DOI

      10.1021/acs.jafc.6b02782

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 深海底泥由来放線菌の生産する新規 enediyne 系抗生物質に関する研究2017

    • Author(s)
      五十嵐 雅之、澤 竜一、梅北 まや、林 千草、波多野 和樹、加藤 千明
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-19
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] MALDI-TOF MS を用いた放線菌の識別2017

    • Author(s)
      高橋 裕子、波多野 和樹、五十嵐 雅之、澤 竜一、梅沢 洋二、加藤 千明
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-19
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 深海由来 Micromonospora 属の分類学的研究2016

    • Author(s)
      波多野 和樹, 高橋 裕子, 澤 竜一, 五十嵐 雅之, 加藤 千明
    • Organizer
      第31回日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都文京区)
    • Year and Date
      2016-09-09
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Lentzea 属放線菌由来 lentztrehalose 類の trehalose 改良品としての安定性評価2016

    • Author(s)
      和田俊一、澤竜一、大庭俊一、林千草、梅北まや、渋谷優子、飯島希昌子、五十嵐雅之
    • Organizer
      第31回日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都文京区)
    • Year and Date
      2016-09-09
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] MALDI-TOF MS を用いた放線菌の識別2016

    • Author(s)
      高橋 裕子, 波多野 和樹, 五十嵐 雅之, 澤 竜一, 梅沢 洋二, 加藤 千明
    • Organizer
      JASISコンファレンス
    • Place of Presentation
      幕張メッセ国際会議場(千葉県千葉市)
    • Year and Date
      2016-09-07
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] MALDI-TOF MS を用いた放線菌の識別2016

    • Author(s)
      高橋 裕子, 波多野 和樹, 五十嵐 雅之, 澤 竜一, 梅沢 洋二, 加藤 千明
    • Organizer
      第43回BMSコンファレンス (BMS2016)
    • Place of Presentation
      ホテル ニューアカオ(静岡県熱海市)
    • Year and Date
      2016-07-05
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 深海底泥由来放線菌二次代謝産物からの新規シデロフォアの発見2016

    • Author(s)
      竹花康弘、澤竜一、五十嵐雅之、波多野和樹、梅北まや、林千草、梅沢洋二、加藤千明
    • Organizer
      日本農芸化学会 2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌イノベーションセンター(札幌)
    • Year and Date
      2016-03-29
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 深海底泥からの放線菌の分離、分類と代謝物の多様性2016

    • Author(s)
      波多野和樹、高橋 裕子、澤 竜一、五十嵐 雅之、加藤 千明
    • Organizer
      日本農芸化学会 2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌イノベーションセンター(札幌)
    • Year and Date
      2016-03-29
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] MALDI-TOF MS を用いた放線菌の識別2016

    • Author(s)
      高橋 裕子、波多野 和樹、五十嵐 雅之、澤 竜一、梅沢 洋二、加藤 千明
    • Organizer
      日本農芸化学会 2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌イノベーションセンター(札幌)
    • Year and Date
      2016-03-29
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] MALDI-TOF MSを用いた深海由来Micromonospora属菌種の識別2015

    • Author(s)
      波多野和樹, 高橋裕子, 澤竜一, 五十嵐雅之, 加藤千明, 柴﨑正勝
    • Organizer
      第30回日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場(富山)
    • Year and Date
      2015-09-08
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] MALDI-TOFMS を用いた放線菌の分類の試み2015

    • Author(s)
      高橋裕子、澤 竜一、波多野和樹、五十嵐雅之、梅沢洋二、加藤千明、柴﨑正勝
    • Organizer
      第42回BMSコンファレンス
    • Place of Presentation
      岐阜グランドホテル(岐阜)
    • Year and Date
      2015-07-07
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] MALDI-TOFMS を用いた有用微生物である放線菌の識別について2015

    • Author(s)
      澤 竜一、高橋裕子、波多野和樹、五十嵐雅之、梅沢洋二、加藤千明、柴﨑正勝
    • Organizer
      第42回BMSコンファレンス
    • Place of Presentation
      岐阜グランドホテル(岐阜)
    • Year and Date
      2015-07-07
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 深海底泥棲Micromonospora 属放線菌と陸棲Micromonospora 属放線菌の多様性性2014

    • Author(s)
      五十嵐雅之、波多野和樹、澤竜一、木下直子、加藤千明、野本明男
    • Organizer
      第41回BMSコンファレンス
    • Place of Presentation
      能登ロイヤルホテル(石川)
    • Year and Date
      2014-07-08
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Remarks] 微生物化学研究所

    • URL

      http://www.bikaken.or.jp

    • Related Report
      2016 Annual Research Report

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Published: 2014-04-04   Modified: 2018-03-22  

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