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The role of bacterial toxin-antitoxin genes on biofim formation

Research Project

Project/Area Number 26450110
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

Nobutaka Nakashima  東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (70357622)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywordsバイオフィルム / 大腸菌 / トキシンアンチトキシン / トランスクリプトーム / 次世代シーケンサー
Outline of Final Research Achievements

Biofilm is a structure in which microorganisms are present at high density on the interface and solid surface together with extracellular polysaccharides etc. In this application, we studied the bacterial toxin - antitoxin (TA) gene system playing an important role in biofilm formation and acquisition of resistance to antibiotics using molecular biology techniques. As a result, it was suggested that the function of the toxin gene overlapped in a substantial part and contributed to biofilm formation. Furthermore, it was revealed that the expression of the gene involved in biofilm formation is differentially regulated following the activation of the toxin gene.

Report

(4 results)
  • 2016 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2015 Research-status Report
  • 2014 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Establishment of a multi-species biofilm model and metatranscriptomic analysis of biofilm and planktonic cell communities.2016

    • Author(s)
      Nakamura Y, Yamamoto N, Kino Y, Yamamoto N, Kamei S, Mori H, Kurokawa K, Nakashima N
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology

      Volume: NA

    • Related Report
      2015 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 微生物を集団として解析し、利用する2017

    • Author(s)
      中島 信孝, 中村 祐哉, 山元奈緒
    • Organizer
      デザイン生命工学研究会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2017-03-21
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 土壌微生物叢の経年及び外部刺激による変化2017

    • Author(s)
      早川聖香、加藤碧、中村祐哉、森宙史、中島信孝、根塚千晶
    • Organizer
      ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 抗生物質を産生する土壌微生物の検出2017

    • Author(s)
      伊藤匡志、新堀将也、山元奈緒、森宙史、中島信孝、根塚千晶
    • Organizer
      ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Discovery of valuable genes by massive sequencing and time lapse analysis of environmental RNAs2016

    • Author(s)
      Nobutaka Nakashima
    • Organizer
      日本生物工学会年会
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2016-09-30
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 新規抗生物質の開発に向けた微生物群集の単離培養を伴わないスクリーニング手法の確立2016

    • Author(s)
      山元 奈緒, 中島 信孝
    • Organizer
      日本生物工学会年会
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2016-09-30
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] アンチセンス核酸による配列特異的な殺菌2016

    • Author(s)
      木野 裕太, 中島 信孝
    • Organizer
      日本生物工学会年会
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2016-09-29
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 環境試料RNA の大量シーケンシングと経時解析による有用遺伝子の大規模検索2016

    • Author(s)
      中村 祐哉, 森 宙史, 黒川 顕, 中島 信孝
    • Organizer
      日本生物工学会年会
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2016-09-29
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Microbial production of valuable conpounds and microbial diversity2016

    • Author(s)
      Nobutaka Nakashima
    • Organizer
      The korean society for microbiology and biotechnology annual meeting
    • Place of Presentation
      Daejong
    • Year and Date
      2016-06-23
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 環境試料RNAの大量シーケンシングと経時解析による有用遺伝子の大規模検索2016

    • Author(s)
      中村 祐哉, 森 宙史, 黒川 顕, 中島 信孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度札幌大会
    • Place of Presentation
      北海道・札幌
    • Year and Date
      2016-03-30
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      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 川崎工科高等学校の土壌に潜む微生物種の解析2016

    • Author(s)
      赤嶺 佑佳, 木村 達哉, 中村 祐哉, 森 宙史, 黒川 顕, 中島 信孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
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      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 大腸菌toxin-antitoxin遺伝子群のバイオフィルム形成における役割の解析2016

    • Author(s)
      亀井 翔太、中島 信孝、黒川 顕
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] バイオフィルム形成時、非形成時の時系列遺伝子発現変動の解析2016

    • Author(s)
      中村 祐哉, 山元 奈緒, 木野 裕太, 森 宙史, 中島 信孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-03
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] アンチセンス核酸による配列特異的な殺菌2016

    • Author(s)
      木野裕太、中島信孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-03
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 環境試料RNAの大量シーケンシングと経時解析による有用遺伝子の大規模検索2015

    • Author(s)
      中村 祐哉, 森 宙史, 黒川 顕, 中島 信孝
    • Organizer
      第67回 日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      鹿児島・鹿児島
    • Year and Date
      2015-10-26
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 大腸菌における遺伝子発現の低コスト化と生育必須遺伝子の操作方法2015

    • Author(s)
      中島 信孝、秋田 紘長、星野 保
    • Organizer
      第67回 日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      鹿児島・鹿児島
    • Year and Date
      2015-10-26
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] アンチセンス核酸による微生物群集での特異的な殺菌2015

    • Author(s)
      木野裕太、黒川顕、中島信孝
    • Organizer
      日本微生物生態学会
    • Place of Presentation
      茨城・土浦
    • Year and Date
      2015-10-18
    • Related Report
      2015 Research-status Report

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Published: 2014-04-04   Modified: 2018-03-22  

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