黒毛和種で胚死滅を引き起こす遺伝的要因の解明

• Project/Area Number: 26450384
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Animal production science
• Research Institution: National Livestock Breeding Center, Incorporated Administrative Agency
• Principal Investigator: 佐々木 慎二 独立行政法人家畜改良センター, その他部局等, 研究員 (10365439)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2016-03-31
• Project Status: Discontinued (Fiscal Year 2015)
• Budget Amount: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000); Fiscal Year 2016: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2015: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2014: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: 動物遺伝育種学 / 繁殖学 / ゲノム科学 / 黒毛和種 / 胚死滅 / ゲノムワイド関連解析 / 一塩基多型 / ゲノムコピー数多型 / 受胎率

Outline of Annual Research Achievements

黒毛和種雌牛の受胎率は年々低下する傾向にあり、胚死滅が主な原因の１つと考えられている。本申請では、黒毛和種で、劣性変異では説明できない胚死滅の遺伝的要因を明らかにするため、胚死滅育種価を表型値としてゲノムワイド関連解析を行い、関連ゲノム領域を詳しく調べることで、胚死滅を引き起こす遺伝子とそのリスク多型を同定することを目的として研究を行った。

ゲノムワイド関連解析の結果、18-29日の間に起こる胚死滅に関連するSNPを10番染色体に1ヶ所、30-60日の間に起こる胚死滅に関連するSNPを7番染色体に1ヶ所それぞれ検出した。関連領域内から原因となる遺伝子とリスク多型を同定するまでには至らなかったが、DNAマーカーを特定したことで目標を達成した。また、多型の１つとしてゲノムコピー数多型についても検討した結果、1,481頭のSNP情報から861ヶ所のゲノムコピー数多型領域を特定し、その中の１つが30-60日の間に起こる胚死滅に関連することを明らかにした。今後、これらの3つの領域の胚死滅への効果と黒毛和種集団における頻度を調べ、育種利用性について検討する必要がある。

Research Products

• [Journal Article] Genome-wide identification of copy number variation using high-density single-nucleotide polymorphism array in Japanese Black cattle (2016)
  • Author(s): Sasaki S, Watanabe T, Nishimura S, Sugimoto Y.
  • Journal Title: BMC Genetics Volume: 17 Issue: 1 Pages: 26-26
  • DOI: 10.1186/s12863-016-0335-z
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Genetic variants in the upstream region of activin receptor IIA are associated with female fertility in Japanese Black cattle (2015)
  • Author(s): Sasaki S, Ibi T, Matsuhashi T, Takeda K, Ikeda S, Sugimoto M, Sugimoto Y.
  • Journal Title: BMC Genetics Volume: 16 Issue: 1 Pages: 123-123
  • DOI: 10.1186/s12863-015-0282-0
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] 黒毛和種の受胎障害に関連する変異特定の試み (2016)
  • Author(s): 有島太一, 佐々木慎二, 新原慎一, 池畑義久, 磯部知弘, 川嶋啓介, 溝下和則, 杉本喜憲
  • Organizer: 日本畜産学会第121回大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2016-03-27
• [Presentation] 黒毛和種におけるゲノムコピー数多型 (2015)
  • Author(s): 佐々木慎二、渡邊敏夫、西村翔太、杉本喜憲
  • Organizer: 日本畜産学会第119回大会
  • Place of Presentation: 宇都宮市
  • Year and Date: 2015-03-28
• [Presentation] 黒毛和種の胚死滅に関与するcopy number variationの探索 (2014)
  • Author(s): 佐々木慎二、揖斐隆之、渡邊敏夫、杉本喜憲
  • Organizer: 日本動物遺伝育種学会第15回大会
  • Place of Presentation: 和光市
  • Year and Date: 2014-11-01