Elucidation of a relationship of bacteriophage to pathogenicity of Helicobacter pylori and development of eradication system to H. pylori using bacteriophage.

• Project/Area Number: 26461504
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Infectious disease medicine
• Research Institution: Kochi University
• Principal Investigator: MATSUZAKI Shigenobu 高知大学, 教育研究部医療学系基礎医学部門, 准教授 (00190439)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 内山 淳平 麻布大学, 獣医学部, 講師 (20574619) ; 大畑 雅典 高知大学, 教育研究部医療学系基礎医学部門, 教授 (50263976)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2016)
• Budget Amount: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000); Fiscal Year 2016: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2015: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2014: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
• Keywords: ピロリ菌 / バクテリオファージ / 除菌 / ファージ / 制限-修飾

Outline of Final Research Achievements

In this study, we aimed at collection of information about a bacteriophage-exclusion system (restriction-modification system) in Helicobacter pylori, to develop an effective sterilization method of drug-resistant H. pylori from the stomach using bacteriophages KHP30 and KHP40. The results indicated that H. pylori had multiple functional restriction-modification systems, suggesting strongly that the bacteriophages must be adapted to all H. pylori-possessed restriction-modification systems for effective sterilization.

Research Products

• [Journal Article] High load of Merkel cell polyomavirus DNA detected in the normal skin of Japanese patients with Merkel cell carcinoma. (2016)
  • Author(s): Yumiko Hashida, Kimiko Nakajima, Hideki Nakajima, Takeo Shiga, Moe Tanaka, Masanao Murakami, Shigenobu Matsuzaki, Seiji Naganuma, Naoki Kuroda, Yasutaka Seki, Harutaka Katano, Shigetoshi Sano, Masanori Daibata.
  • Journal Title: Journal of Clinical Virology Volume: 82 Pages: 101-107
  • DOI: 10.1016/j.jcv.2016.07.011
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Screening of KHP30-like prophages among Japanese Helicobacter pylori strains, and genetic analysis of a defective KHP30-like prophage sequence integrated in the genome of the H. pylori strain NY40. (2016)
  • Author(s): Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, Kato S, Takeuchi H, Sakaguchi Y, Ujihara T, Daibata M, Shimakura H, Okamoto N, Sakaguchi M, Matsuzaki S.
  • Journal Title: FEMS Microbiol Lett. Volume: 363 Issue: 16 Pages: 1-9
  • DOI: 10.1093/femsle/fnw157
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Analyses of Short-Term Antagonistic Evolution of Pseudomonas aeruginosa Strain PAO1 and Phage KPP22 (Myoviridae Family, PB1-Like Virus Genus). (2016)
  • Author(s): Uchiyama J, Suzuki M, Nishifuji K, Kato S, Miyata R, Nasukawa T, Yamaguchi K, Takemura-Uchiyama I, Ujihara T, Shimakura H, Murakami H, Okamoto N, Sakaguchi Y, Shibayama K, Sakaguchi M, Matsuzaki S.
  • Journal Title: Appl Environ Microbiol Volume: 82 Issue: 15 Pages: 4482-4491
  • DOI: 10.1128/aem.00090-16
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Helicobacter pylori ファージとそのゲノム (2016)
  • Author(s): 内山淳平、竹内啓晃、平山隆一郎、島倉秀勝、阪口雅弘、松崎茂展
  • Journal Title: Helicobacter Research Volume: 20 Pages: 470-474
• [Journal Article] Characterization of Pseudomonas aeruginosa phage KPP21 belonging to family Podoviridae genus N4-like viruses isolated in Japan (2016)
  • Author(s): Shigehisa, R., Uchiyama, J., Kato S, Takemura-Uchiyama, I, Yamaguchi, K., Miyata, R., Ujihara, T., Sakaguchi, Y., Okamoto, N., Shimakura, H., Daibata, M., Sakaguchi, M., and Matsuzaki, S.
  • Journal Title: Microbiology and Immunology Volume: 60 Issue: 1 Pages: 64-67
  • DOI: 10.1111/1348-0421.12347
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] ウイローム バクテリオファージ療法 (2015)
  • Author(s): 松崎茂展, 氏原隆子, 村上雅尚, 大畑雅典
  • Journal Title: 臨床と微生物 Volume: 42（6） Pages: 697-701
• [Journal Article] ファージ吸着分子を利用した簡易迅速細菌検出技術 (2015)
  • Author(s): 内山淳平、松井秀仁、内山（竹村）伊代、渡辺茂、花木秀明、松崎茂展
  • Journal Title: 化学工業 Volume: 65 Pages: 12-19
  • Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Complete genome sequence of a Pseudomonas aeruginosa bacteriophage KPP23 belonging to family Siphoviridae (2014)
  • Author(s): Yamaguchi K, Miyata R, Shigehisa R, Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, Kato S, Ujihara T, Sakaguchi Y, Daibata M, Matsuzaki S
  • Journal Title: Genome Announcements Volume: 2(3) Issue: 3
  • DOI: 10.1128/genomea.00233-14
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Characterization of a novel Pseudomonas aeruginosa bacteriophage, KPP25, of the family Podoviridae (2014)
  • Author(s): Miyata R, Yamaguchi K, Uchiyama J, Shigehisa R, Takemura-Uchiyama I, Kato S, Ujihara T, Sakaguchi Y, Daibata M, Matsuzaki S
  • Journal Title: Virus Research Volume: 189 Pages: 43-46
  • DOI: 10.1016/j.virusres.2014.04.019
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Perspective: The age of the phage. (2014)
  • Author(s): Matsuzaki S, Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, Daibata M.
  • Journal Title: Nature Volume: 509 Issue: 7498 Pages: S9-S9
  • DOI: 10.1038/509s9a
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Experimental phage therapy again st lethal lung-derived septicemia ca used by Staphylococcus aureus in mice (2014)
  • Author(s): Takemura-Uchiyama I, Uchiyama J, Osa nai M, Morimoto N, Asagiri T, Ujihar a T, Daibata M, Sugiura T, Matsuzaki S
  • Journal Title: Microbes Infect Volume: (in press) Issue: 6 Pages: 512-517
  • DOI: 10.1016/j.micinf.2014.02.011
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Intragenus generalized transduction in Staphylococcus spp. by a novel giant phage. (2014)
  • Author(s): Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, Sakaguchi Y, Gamoh K, Kato SI, Daibata M, Ujihara T, Misawa N, Matsuzaki S.
  • Journal Title: ISME J. Volume: in press Issue: 9 Pages: 1949-1952
  • DOI: 10.1038/ismej.2014.29
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] In silico analysis of AHJD-like viruses, Staphylococcus aureus phages S24-1 and S13', and study of phage S24-1 adsorption. (2014)
  • Author(s): Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, Kato S, Sato M, Ujihara T, Matsui H, Hanaki H, Daibata M, Matsuzaki S.
  • Journal Title: Microbiologyopen. Volume: 3 Issue: 2 Pages: 257-270
  • DOI: 10.1002/mbo3.166
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] Study of adsorption of AHJD-like phages infecting Staphylococcus aureus. (2017)
  • Author(s): 内山淳平, 黒川健児, 内山伊代, 氏原隆子, 坂口義彦, 松崎茂展, 坂口雅弘
  • Organizer: 第９０回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 仙台国際センター展示棟 （宮城県仙台市）
  • Year and Date: 2017-03-19
• [Presentation] バクテリオファージKHP30の感染能に及ぼすピロリ菌保有制限-修飾系の解析 (2017)
  • Author(s): 松澤佑一, 内山淳平, 竹内啓晃, 氏原隆子, 橋田裕美子, 樋口知紀, 田中望紅，冨永宗一竜, 大畑雅典, 松崎茂展
  • Organizer: 第９０回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 仙台国際センター展示棟 (宮城県仙台市）
  • Year and Date: 2017-03-19
• [Presentation] Phylogenetic analysis of Merkel cell polyomavirus based on full-length LT and VP1 sequences derived from normal skin of healthy individuals. (2016)
  • Author(s): 田中望紅, 橋田裕美子, 村上雅尚, 松﨑茂展, 大畑雅典
  • Organizer: 第64回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター （北海道札幌市）
  • Year and Date: 2016-10-23
• [Presentation] Epidemiological study of Merkel cell polyomavirus in healthy skin among healthy individuals in Japan. (2016)
  • Author(s): 橋田裕美子, 田中望紅, 村上雅尚, 松﨑茂展, 大畑雅典
  • Organizer: 第64回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター （北海道札幌市）
  • Year and Date: 2016-10-23
• [Presentation] 新規PB1様ファージKPP22と緑膿菌PAO1株を利用した前適応ファージKPP22M作成過程の遺伝的解析 (2016)
  • Author(s): 那須川忠弥，内山淳平，鈴木仁人，西藤公司，加藤伸一郎，内山伊代，氏原隆子，島倉秀勝，村上裕信，岡本憲明，阪口義彦，柴山恵吾，阪口雅弘，松崎茂展
  • Organizer: ファージ・環境ウイルス研究会 合同シンポジウム（第6回ファージ研究会
  • Place of Presentation: JAMSTEC （神奈川県横須賀市）
  • Year and Date: 2016-10-21
• [Presentation] Screening of KHP30-like prophage in Helicobacter pylori using Japanese strains, andanalysis of their fate by in silico approach. (2016)
  • Author(s): Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, Kato S, Takeuchi H, Sakaguchi Y, Ujihara T,Nasukawa T, Shimakura H, Okamoto N, Sakaguchi M, Matsuzaki S
  • Organizer: ファージ・環境ウイルス研究会 合同シンポジウム（第6回ファージ研究会
  • Place of Presentation: JAMSTEC （神奈川県横須賀市）
  • Year and Date: 2016-10-21
• [Presentation] ピロリ菌ゲノムに溶原化したKHP30様ファージDNAへの挿入配列の転移. (2016)
  • Author(s): 松崎茂展, 内山淳平, 竹内啓晃, 氏原隆子, 大畑雅典
  • Organizer: 第６９回日本細菌学会中国・四国支部総会
  • Place of Presentation: かがわ国際会議場高松シンボルタワー （香川県高松市）
  • Year and Date: 2016-10-15
• [Presentation] 活性型ピロリ菌ファージKHP30の特徴付けとその潜伏感染性の解析. （ワークショップ ファージ・ルネッサンス －ファージ発見から100年たった今―） (2016)
  • Author(s): 内山淳平, 内山伊代, 竹内啓晃, 阪口義彦, 阪口雅弘, 松崎茂展
  • Organizer: 第89回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 大阪国際交流センター
  • Year and Date: 2016-03-23
  • Invited
• [Presentation] ファージを利用した細菌検出～黄色ブドウ球菌ファージクロマト法の開発～（ワークショップ ファージ・ルネッサンス －ファージ発見から100年たった今―） (2016)
  • Author(s): 松井秀仁、内山淳平、津田愛美、松崎茂展、花木秀明
  • Organizer: 第89回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 大阪国際交流センター
  • Year and Date: 2016-03-23
  • Invited
• [Presentation] 緑膿菌PAO1株とファージKPP22の短期間進化的軍拡競争の解析. (2016)
  • Author(s): 那須川忠弥、内山淳平、鈴木仁人、宮田怜奈、山口琴絵、内山伊代、阪口義彦、柴山恵吾、阪口雅弘
  • Organizer: 第89回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 大阪国際交流センター
  • Year and Date: 2016-03-23
• [Presentation] ボツリヌス毒素変換ファージのゲノム比較と遺伝子解析. (2016)
  • Author(s): 阪口義彦、内山淳平、小椋義俊、山本友由弥子、松崎茂展、林哲也、松下治、小熊惠二、林俊治
  • Organizer: 第89回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 大阪国際交流センター
  • Year and Date: 2016-03-23
• [Presentation] Mycobacterium smegmatisに感染するバクテリオファージの形態学的解析. (2016)
  • Author(s): 氏原隆子、大原直也、谷口初美、山崎利雄、大畑雅典、松崎茂展
  • Organizer: 第89回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 大阪国際交流センター
  • Year and Date: 2016-03-23
• [Presentation] バクテリオファージを利用するピロリ菌除菌法開発のための基礎的研究 (2016)
  • Author(s): 大畑雅典, 松澤佑一, 松崎茂展
  • Organizer: 平成28年度 中四国乳酸菌研究会・研究発表会
  • Place of Presentation: ホテル グランヴィア岡山 （岡山県岡山市）
• [Presentation] Mycobacterium smegmatis バクテリオファージの長期保存状態における生存率. (2015)
  • Author(s): 松崎茂展，大原直也, 谷口初美，山崎利雄，氏原隆子，村上雅尚，大畑雅典
  • Organizer: 第 68回日本細菌学会中国四国支部総会
  • Place of Presentation: 岡山大学
  • Year and Date: 2015-10-03
• [Presentation] B型ボツリヌス菌のボツリヌス毒素遺伝子をコードするプラスミド解析 (2015)
  • Author(s): 坂口義彦、内山淳平、細見晃司、幸田知子、松崎茂展、小椋義俊、林哲也、林俊治、小崎俊司、向本雅郁
  • Organizer: 第88回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 長良川国際会議場 （岐阜）
  • Year and Date: 2015-03-26 – 2015-03-28
• [Presentation] 各種ファージに対する黄色ブドウ球菌受容体の解析 (2015)
  • Author(s): 内山淳平、黒川健司、坂口義彦、内山（竹村）伊代、氏原隆子、村上雅尚、大畑雅典、松崎茂展
  • Organizer: 第88回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 長良川国際会議場 （岐阜）
  • Year and Date: 2015-03-26 – 2015-03-28
• [Presentation] 緑膿菌感染症に対するファージ療法と化学療法の併用療法の可能性検討 (2015)
  • Author(s): 重久 立、内山淳平、宮田玲奈、山口琴絵、内山伊代、坂口義彦、氏原隆子、大畑雅典、松崎茂展
  • Organizer: 第88回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 長良川国際会議場 （岐阜）
  • Year and Date: 2015-03-26 – 2015-03-28
• [Presentation] ピロリ菌におけるKHP30 様ファージの溶原性に関する研究 (2014)
  • Author(s): 内山淳平、内山（竹村）伊代、阪口義彦、竹内啓晃、村上雅尚、氏原隆子、大畑雅典、松崎茂展
  • Organizer: 第67回日本細菌学会中国四国支部総会
  • Place of Presentation: 徳島文理大学 （徳島）
  • Year and Date: 2014-10-04 – 2014-10-05
• [Presentation] バクテリオファージ療法の現状と可能性 (2014)
  • Author(s): 松崎茂展、内山淳平、内山伊代、村上雅尚、大畑雅典
  • Organizer: 2014年度日本農芸化学会西日本支部大会シンポジウム 「ファージ研究の新展開」
  • Place of Presentation: HOTELグランデはがくれ・佐賀大学本庄キャンパス(佐賀)
  • Year and Date: 2014-09-18 – 2014-09-19
  • Invited
• [Presentation] Generalized transduction in vitro among Staphylococcus spp., using a novel phage S6. (2014)
  • Author(s): 10. Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, Sakaguchi Y, Kato S, Gamoh K, Misawa N, Daibata M, Matsuzaki S:
  • Organizer: International Union of Microbiological Societies Congress
  • Place of Presentation: Montreal, Canada
  • Year and Date: 2014-07-27 – 2014-08-01
• [Presentation] KHP30-like phages among clinical isolates of Helicobacter pylori (2014)
  • Author(s): 11. Takemura-Uchiyama I, Uchiyama J, Takeuchi H, Gamoh K, Sakaguchi Y, Kato S, Ujihara T, Daibata M, Matsuzaki S
  • Organizer: International Union of Microbiological Societies Congress
  • Place of Presentation: Montreal, Canada
  • Year and Date: 2014-07-27 – 2014-08-01
• [Presentation] Analysis of botulinum neurotoxin type G gene-encoding plasmid in Clostridium argentinense strain 2740 (2014)
  • Author(s): 12. Sakaguchi Y, Uchiyama J, Suzuki T, Yamamoto Y, Hosomi K, Kohda T, Matsuzaki S, Hayashi T, Mukamoto M, Oguma K
  • Organizer: International Union of Microbiological Societies Congress
  • Place of Presentation: Montreal, Canada
  • Year and Date: 2014-07-27 – 2014-08-01
• [Book] Chapter 10. Phage therapy: experiments using animal infection models. .Phage Therapy. Current Research and Applications. (2014)
  • Author(s): Matsuzaki S, Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, and Daibata M
  • Total Pages: 20
  • Publisher: Caister Academic Press
• [Patent(Industrial Property Rights)] 特許 (2014)
  • Inventor(s): 大畑雅典、松崎茂展、内山淳平、内山伊代
  • Industrial Property Rights Holder: 大畑雅典、松崎茂展、内山淳平、内山伊代
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Filing Date: 2014-04-01
  • Acquisition Date: 2016-04-28