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Spatiotemporal expression pattern of splice variants of synapse organizers

Research Project

Project/Area Number 26640038
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Neurochemistry/Neuropharmacology
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

Yoshida Tomoyuki  富山大学, 大学院医学薬学研究部(医学), 准教授 (90372367)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords選択的スプライシング / シナプスオーガナイザー / スプライシング / シナプス形成
Outline of Final Research Achievements

Synapse formation in the brain is partly mediated by a small subset of trans-synaptic cell adhesion molecules called synapse organizers. We found that PTPδ one of presynaptic synapse organizers, existed in multiple splice variants generated by insertions of 3, 6 and 4 amino-acid residue peptides (termed mini-exon peptides) in the extracellular immunoglobulin (Ig)-like domains. At least 8 splice variants in the Ig-like domains of PTPδ were expressed in the developing mouse brains. Proportions of these splice variants varied across brain regions and developmental stages. Furthermore, structural analyses of synapse-organizing complex of PTPδ and its ligands revealed the role of mini-exon peptides on the ligand recognition and synaptic differentiation. These results suggest that the choice of mini-exons may be determinants for selective pairing between PTPδ variants and their corresponding postsynaptic ligands to ensure the target specific synapse formation in the brain.

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Research-status Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structure of Slitrk2–PTPδ complex reveals mechanisms for splicing-dependent trans-synaptic adhesion.2015

    • Author(s)
      Yamagata A, Sato Y, Goto-Ito S, Uemura T, Maeda A, Shiroshima T, Yoshida T*, Fukai S*.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: 9686

    • DOI

      doi: 10.1038/srep09686.

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Mechanisms of splicing-dependent trans-synaptic adhesion by PTPδ–IL1RAPL1/IL-1RAcP for synaptic differentiation.2015

    • Author(s)
      Yamagata A, Yoshida T*, Sato Y, Goto-Ito S, Uemura T, Maeda A, Shiroshima T, Iwasawa-Okamoto S, Mori H, Mishina M, Fukai S*.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 6 Pages: 6926

    • DOI

      doi: 10.1038/ncomms7926.

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      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Is D-aspartate produced by glutamic-oxaloacetic transaminase-1 like 1 (Got1l1): a putative aspartate racemase?2015

    • Author(s)
      Tanaka-Hayashi, A., Hayashi, S., Inoue, R., Ito, T., Konno, K., Yoshida, T., Watanabe, M., Yoshimura, T., Mori, H
    • Journal Title

      Amino Acids

      Volume: 47 Pages: 79-86

    • DOI

      doi: 10.1007/s00726-014-1847-3.

    • Related Report
      2014 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] IL1RAPL1欠損マウスの表現型解析2015

    • Author(s)
      安村美里, 吉田知之, 三品昌美
    • Journal Title

      日本薬理学雑誌

      Volume: 145 Pages: 187-192

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      2014 Research-status Report
  • [Journal Article] IL1RAPL1 knockout mice show spine density decrease, learning deficiency, hyperactivity and reduced anxiety-like behaviours.2014

    • Author(s)
      Yasumura, M., Yoshida, T., Yamazaki, M., Abe, M., Natsume, R., Kanno, K., Uemura, T., Takao, K., Sakimura, K., Kikusui, T., Miyakawa, T., Mishina, M
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 4 Pages: 6613

    • DOI

      doi: 10.1038/srep06613.

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A590T mutation in KCNQ1 C-terminal helix D decreases IKs channel trafficking and function but not Yotiao interaction.2014

    • Author(s)
      Kinoshita, K., Komatsu, T., Nishide, K., Hata, Y., Hisajima, N., Takahashi, H., Kimoto, K., Aonuma, K., Tsushima, E., Tabata, T., Yoshida, T., Mori, H., Nishida, K., Yamaguchi, Y., Ichida, F., Fukurotani, K., Inoue, H., Nishida N
    • Journal Title

      Journal of Molecular and Cellular Cardiology

      Volume: 72 Pages: 273-280

    • DOI

      doi: 10.1016/j.yjmcc.2014.03.019.

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  • [Presentation] Slitrkファミリータンパク質とIIa型受容体タンパク質チロシン脱リン酸化酵素がスプライスインサートに依存して相互作用するメカニズム2015

    • Author(s)
      山形敦史, 佐藤祐介, 伊藤桜子, 植村健, 吉田知之, 深井周也.
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 ワークショップ.
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-12-03
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  • [Presentation] 運動ニューロンの標的骨格筋への投射にCLAC-P/Collagen type XXVが果たす分子メカニズムの解明2015

    • Author(s)
      宗実悠佳, 大泉寛明, 吉田知之, 若林朋子, 岩坪威.
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会.
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-12-02
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  • [Presentation] 小脳シナプス形成を制御するGluD2-Cbln1-neurexin接着分子複合体の構造基盤2015

    • Author(s)
      植村健, 佐藤祐介, 山形敦史, 吉田知之, 後藤桜子, 前田亜沙美, 城島知子, 田渕克彦, 三品昌美, 深井周也.
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 ワークショップ.
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-12-01
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] IIa型受容体チロシンフォスファターゼδとインターロイキン1受容体タイプのシナプスオーガナイザー間の選択的スプライシング依存的相互作用制御の構造基盤2015

    • Author(s)
      山形敦史, 吉田知之, 佐藤祐介, 伊藤桜子, 植村健, 森寿, 三品昌美, 深井周也.
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 ワークショップ.
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-12-01
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  • [Presentation] ミニエクソンペプチド選択によるシナプスオーガナイザー機能の調節2015

    • Author(s)
      吉田知之.
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 ワークショップ.
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-12-01
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Interleukin-1 receptor family proteins function as neuronal synapse organizers2015

    • Author(s)
      Tomoyuki Yoshida.
    • Organizer
      第58回日本神経化学会年会 APSN/JSN Joint Symposium
    • Place of Presentation
      大宮ソニックシティ, 大宮
    • Year and Date
      2015-09-12
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      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Slitrk2 によるPTPδのスプライシング依存的認識機構の構造基盤2015

    • Author(s)
      山形敦史, 佐藤祐介, 伊藤桜子, 植村健, 前田亜沙美, 城島知子, 吉田知之, 深井周也.
    • Organizer
      第38回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-07-31
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] シナプス形成を司るIL1RAPL1-PTPδ複合体の構造基盤2015

    • Author(s)
      吉田知之, 山形敦史, 佐藤祐介, 伊藤桜子, 植村健, 前田亜沙美, 城島知子, 岡本志穂, 森寿, 三品昌美, 深井周也.
    • Organizer
      第38回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-07-31
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 小脳シナプス形成を担うGluRδ2-Cbln1-Neurexin複合体の構造生物学的解析2015

    • Author(s)
      植村健, 佐藤祐介, 山形敦史, 吉田知之, 後藤桜子, 田渕克彦, 三品昌美, 深井周也.
    • Organizer
      第38回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-07-31
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Intrinsic role of serine racemase in apoptosis and metabolism2015

    • Author(s)
      Gourango Talukdar, Ran Inoue, Tomoyuki Yoshida, Tetsuya Ishimoto, Takashi Nakagawa, Hisashi Mori.
    • Organizer
      第38回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場, 神戸
    • Year and Date
      2015-07-30
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] PTPδスプライスバリアントのシナプス形成における機能解析と脳部位別発現解析2015

    • Author(s)
      畦地健司, 吉田知之, 岡本志穂, 森寿.
    • Organizer
      第33回日本生化学会北陸支部大会
    • Place of Presentation
      富山大学杉谷キャンパス, 富山
    • Year and Date
      2015-05-23
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] アルツハイマー病脳老人斑構成成分CLAC-Pの中枢神経系における生理機能の解明2014

    • Author(s)
      宗実悠佳, 若林朋子, 吉田知之, 岩坪威
    • Organizer
      第33回日本認知症学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      2014-11-30
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  • [Presentation] インターロイキン-1受容体ファミリータンパク質による中枢シナプス形成の調節2014

    • Author(s)
      吉田知之, 城島知子, 山崎真弥, 阿部学, 山形敦史, 深井周也, 森寿, 崎村建司, 岩倉洋一郎, 三品昌美
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      2014-11-26
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    • Invited
  • [Presentation] インターロイキン-1受容体ファミリー分子群による中枢シナプス形成の調節2014

    • Author(s)
      吉田知之
    • Organizer
      生理学研究所研究会「グリア細胞機能から迫る脳機能解明」
    • Place of Presentation
      生理学研究所、岡崎
    • Year and Date
      2014-10-24
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    • Invited
  • [Presentation] Got1l1 ノックアウトマウスの解析2014

    • Author(s)
      林-田中亜由美, 井上蘭, 吉田知之, 林修平, 伊藤智和, 吉村徹, 森寿
    • Organizer
      第87回日本生化学会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館、京都
    • Year and Date
      2014-10-18
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  • [Presentation] NeuritinはFGFシグナルを介して、神経活動依存的な軸索分枝形成を誘導する2014

    • Author(s)
      島田忠之, 吉田知之,山形要人
    • Organizer
      第37回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      2014-09-11
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  • [Presentation] IL-1受容体共通サブユニットIL-1RAcPは中枢シナプス形成を担うシナプスオーガナイザーとして機能する2014

    • Author(s)
      吉田知之, 森寿, 三品昌美
    • Organizer
      日本生化学会北陸支部 第32回大会
    • Place of Presentation
      富山大学杉谷キャンパス、富山
    • Year and Date
      2014-05-24
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  • [Book] 「分子脳科学」22章「神経回路網形成とシナプス形成」2015

    • Author(s)
      吉田知之.
    • Total Pages
      11
    • Publisher
      化学同人
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  • [Book] 実験医学増刊 構造生命科学で何がわかるのか, 何ができるのか 「シナプス形成を誘導する膜受容体の機能と構造」2014

    • Author(s)
      深井周也, 植村健, 吉田知之
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      羊土社
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  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.med.u-toyama.ac.jp/molneurosci/index.html

    • Related Report
      2015 Annual Research Report 2014 Research-status Report

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Published: 2014-04-04   Modified: 2025-11-19  

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