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Analysis of dynamics of neural network that processes spatial information on chemotaxis of C. elegans

Research Project

Project/Area Number 26830006
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Neurophysiology / General neuroscience
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Toyoshima Yu  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (10632341)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2016: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2015: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Keywordsシステム生物学 / モデル化とシミュレーション / ライブイメージング / 神経情報処理 / 線虫
Outline of Final Research Achievements

In salt chemotaxis of the nematode C. elegans, they choose behavioral strategies according to the direction of gradient of salt concentration. Information of the direction will be encoded in the temporal patterns of neural activity, and we try to find how the neural circuit decodes it.
By using latest Calcium indicators, we confirmed that sensory neurons and 1st-layer interneurons show accurate response to fast stimuli that corresponds to the gradient vertical to the locomotion direction. We also developed several techniques required for whole-brain activity imaging. Additionally, we developed mathematical models of chemotaxis based on the measured neural activities.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

<1. カルシウムイメージングによる神経細胞の活性測定>によって、線虫の神経活動を正確に測定するための枠組みを確立することができた。また全脳の神経活動を測定する技術を開発して、自発活動の影響を明らかにすることができた。観察された神経活動を個体間で比較したり、神経回路の視点で解釈するための技術の開発も進んでいる。また<2. 実験データに基づいた数理モデルの作成>によって、実験データに基づいた数理モデル化の枠組みを確立することができた。とくに神経活動を正確にモデル化することで、環境―神経回路―行動という多階層システムの包括的な解析が可能になった。

Report

(6 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • 2015 Research-status Report
  • 2014 Research-status Report
  • Research Products

    (84 results)

All 2019 2018 2017 2016 2015 2014 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (72 results) (of which Int'l Joint Research: 26 results,  Invited: 9 results) Remarks (4 results)

  • [Int'l Joint Research] Medical Research Council(United Kingdom)

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    • Author(s)
      豊島 有
    • Journal Title

      生体の科学

      Volume: 68 Issue: 5 Pages: 474-475

    • DOI

      10.11477/mf.2425200701

    • ISSN
      0370-9531, 1883-5503
    • Year and Date
      2017-10-15
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      Hirose Osamu、Kawaguchi Shotaro、Tokunaga Terumasa、Toyoshima Yu、Teramoto Takayuki、Kuge Sayuri、Ishihara Takeshi、Iino Yuichi、Yoshida Ryo
    • Journal Title

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      Volume: - Issue: 6 Pages: 1-1

    • DOI

      10.1109/tcbb.2017.2782255

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  • [Journal Article] Modulation of sensory information processing by a neuroglobin inCaenorhabditis elegans2017

    • Author(s)
      Oda Shigekazu、Toyoshima Yu、de Bono Mario
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 114 Issue: 23

    • DOI

      10.1073/pnas.1614596114

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    • Author(s)
      豊島 有、飯野 雄一
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 57 Issue: 1 Pages: 001-001

    • DOI

      10.2142/biophys.57.001

    • NAID

      130005296440

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
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  • [Journal Article] 神経応答のモデリング ~Ca2+イメージングを用いて2017

    • Author(s)
      豊島 有
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 35 Pages: 875-878

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    • Author(s)
      Toyoshima Y, Tokunaga T, Hirose O, Kanamori M, Teramoto T, Jang MS, Kuge S, Ishihara T, Yoshida R, Iino Y.
    • Journal Title

      PLoS Comput Biol.

      Volume: 12 Issue: 6 Pages: 1-20

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1004970

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      Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
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      豊島 有, 佐藤 研, 三上 秀治, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 滝沢 拓己, 大江 紗, 寺本 孝行, 徳永 旭将, 広瀬 修, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
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      豊島 有, 佐藤 研, 三上 秀治, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 滝沢 拓己, 大江 紗, 寺本 孝行, 徳永 旭将, 広瀬 修, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
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      豊島 有, Stephen Wu, 佐藤 研, 滝沢 拓己, 徳永 旭将, 広瀬 修, 金森 真奈美, 佐藤 博文, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 石原 健, 吉田 亮, 飯野 雄一
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      Yu Toyoshima, Stephen Wu, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Moon-Sun Jang, Hirofumi Sato, Suzu Oe, Yuko Murakami, Ken Sato, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
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      CeNeuro2018
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  • [Presentation] Molecular and circuit-level analyses reveal the neural mechanisms for the experience-dependent salt chemotaxis in C. elegans.2018

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      Yuichi Iino, Hirofumi Sato, Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Hirofumi Kunitomo, Takashi Nagashima, Moon-Sun Jang, Stephen Wu, Manami Kanamori, Llian Mabardi, Shingo Hiroki, Suzu Oe, Yuko Murakami, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida and Takeshi Ishihara
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      Asia-Pacific C. elegans meeting
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 感覚統合のメカニズム2018

    • Author(s)
      村上 悠子, 大江 紗, 勝目 拓海, 寺本 孝行, 豊島 有, 徳永 旭将, 広瀬 修, Wu Stephan, Jang Moon Song, 佐藤 博文, 久下 小百合, 岩崎 唯史, 吉田 亮, 飯野 雄一, 石原 健
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      第41回日本神経科学大会
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      飯野 雄一, 佐藤 博文, 豊島 有, 大江 紗, ジャン ムンソン, ウ ステファン, 金森 真奈美, 國友 博文, 岩崎 唯史, 吉田 亮, 石原 健
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      第41回日本神経科学大会
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  • [Presentation] 線虫全脳イメージングのための高速三次元蛍光顕微鏡の開発2018

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      佐藤 研, 三上 秀治, 豊島 有, 飯野 雄一, 合田 圭介
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      第41回日本神経科学大会
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  • [Presentation] Simultaneous measurement of whole-brain activity and behavior toward comprehensive understanding of salt chemotaxis of C. elegans2018

    • Author(s)
      Yu Toyoshima, Ken Sato, Hideharu Mikami, Stephen Wu, Hirofumi Sato, Moon-Sun Jang, Manami Kanamori, Suzu Oe, Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Keisuke Goda, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
    • Organizer
      International Symposium on Systems Science of Bio-Navigation 2018
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  • [Presentation] Simultaneous measurement of whole-brain activity and behavior toward comprehensive understanding of salt chemotaxis of C. elegans2018

    • Author(s)
      Suzu Oe, Yuko Murakami, Yuki Kawahara, Takayuki Teramoto, Yu Toyoshima, Terumasa Tokunaga, Stephan Wu, Osamu Hirose, Jang Moon-Sun, Hirofumi Sato, Hiroki Takizawa, Sayuri Kuge, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Yuichi Iino, Takeshi Ishihara.
    • Organizer
      International Symposium on Systems Science of Bio-Navigation 2018
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  • [Presentation] 線虫の全中枢神経細胞活動データに対する因果性解析II2018

    • Author(s)
      岩崎唯史,佐藤博文,大江紗,久下小百合,寺本孝行,徳永旭将,広瀬修,Stephen Wu, 豊島有, ジャン;ムンソン,吉田亮,飯野雄一,石原健
    • Organizer
      日本物理学会 2018年秋季大会
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      日本動物学会第89回札幌大会
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  • [Presentation] 線虫の頭部全神経のイメージングによる神経回路の動態解析2018

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      飯野 雄一, 豊島 有, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 大江 紗, 村上 悠子, 久下 小百合, 広瀬 修, 徳永 旭将, 寺本 孝行, 岩崎 唯史, 吉田 亮, 石原 健
    • Organizer
      日本動物学会第89回札幌大会
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  • [Presentation] Bio-image informatics for whole-brain activity imaging of C. elegans2018

    • Author(s)
      Yu Toyoshima, Stephen Wu, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Moon-Sun Jang, Hirofumi Sato, Suzu Oe, Yuko Murakami, Ken Sato, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
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  • [Presentation] 線虫の全脳イメージングとその解析2018

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      石原健、豊島有、大江紗、ウー・ステファン、村上悠子、徳永旭将、金森真奈美、岩崎唯史、寺本孝行、ジャン・ムンソン、佐藤博文、吉田亮、飯野雄一
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      線虫研究の未来を創る会
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  • [Presentation] Robustness of synaptic pathway and signaling pathway estimated from the whole-brain activity data in C. elegans2018

    • Author(s)
      岩崎唯史,佐藤博文,大江紗,久下小百合,寺本孝行,徳永旭将,広瀬修,Stephen Wu, 豊島有, ジャン;ムンソン,吉田亮,飯野雄一,石原健
    • Organizer
      第56回日本生物物理学会大会
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  • [Presentation] 塩走性行動中の線虫の全脳活動計測のための技術開発2018

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      豊島 有, 佐藤 研, 三上 秀治, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 滝沢 拓己, 大江 紗, 寺本 孝行, 徳永 旭将, 広瀬 修, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
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      第3回新学術領域「生物ナビゲーションのシステム科学」若手合宿
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  • [Presentation] Observation and Analyses of the Dynamics of the Whole Head Nervous System in C. elegans2018

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      Yuichi Iino, Yu Toyoshima, Stephen Wu, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Hirofumi Sato, Jang Moon-Sun, Manami Kanamori, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto and Takeshi Ishihara
    • Organizer
      日本神経回路学会 第28回全国大会(JNNS2018)
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  • [Presentation] 線虫の連合学習の記憶に基づく行動スイッチング:中枢神経回路の活動可視化による解析2018

    • Author(s)
      大江紗, 村上悠子, 川原祐樹, 寺本孝行, 豊島有, 徳永旭将, Stephan Wu, 広瀬修, Jang Moon-Sun, 佐藤博文, 滝沢拓己, 久下小百合, 岩崎唯史, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健
    • Organizer
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  • [Presentation] Mechanisms of taste avoidance learning in the nematode C. elegans2018

    • Author(s)
      Moon-Sun Jang, Hirofumi Kunitomo, Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Stephen Wu, Suzu Oe, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino
    • Organizer
      The 17th International Symposium on Molecular and Neural Mechanisms of Taste and Olfactory Perception (ISMNTOP2018)
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  • [Presentation] 4Dイメージングデータ内の密集した細胞核を正確に検出・追跡・定量する画像解析手法2018

    • Author(s)
      豊島 有, Stephen Wu, 佐藤 研, 滝沢 拓己, 徳永 旭将, 広瀬 修, 金森 真奈美, 佐藤 博文, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 石原 健, 吉田 亮, 飯野 雄一
    • Organizer
      新学術領域「レゾナンスバイオ」平成29年度第二回班会議
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  • [Presentation] 線虫の全脳活動データに対する位相解析2017

    • Author(s)
      岩崎唯史, 寺本孝行, 大江紗, 徳永旭将, 広瀬修, Stephen Wu, 豊島有, ジャンムンソン, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健
    • Organizer
      日本物理学会 第72回年次大会
    • Place of Presentation
      大阪大学 豊中キャンパス (大阪府豊中市)
    • Year and Date
      2017-03-17
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  • [Presentation] Neuronal signaling pathways estimated from whole-brain imaging data of C. elegans2017

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      Yuishi Iwasaki, Takayuki Teramoto,,Suzu Oe, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Stephen Wu, Yu Toyoshima, Moon Sun Jang, Ryo Yoshida, Yuichi Iino, Takeshi Ishihara
    • Organizer
      第19回国際生物物理学大会(IUPAB2017)
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      21st International Worm Meeting
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  • [Presentation] Mathematical methods to analyze imaging data in the whole central nervous system: From noise reduction to causality detection2017

    • Author(s)
      Y. Iwasaki, T. Teramoto, S. Oe, T. Tokunaga, O. Hirose, S. Wu, Y. Toyoshima, M. S. Jang, R. Yoshida, Y. Iino, T. Ishihara
    • Organizer
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      Moon-Sun Jang, Yu Toyoshima, Hirofumi Kunitomo, Yuichi Iino
    • Organizer
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      Suzu Oe, Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Sayuri Kuge, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara.
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      Stephen Wu, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino, Ryo Yoshida
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      4th International Workshop on Quantitative Biology
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      豊島 有, Stephen Wu, 滝沢 拓己, 佐藤 研, 徳永 旭将, 広瀬 修, 金森 真奈美, 佐藤 博文, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 三上 秀治, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
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  • [Presentation] How taste preference is modulated in the nematode2017

    • Author(s)
      Yuichi Iino, Takashi Nagasima, Hirofumi Sato, Jang Moon-Sun, Suzu Oe), Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Hirofumi Kunitomo, Stephen Wu, Ryo Yoshida, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara
    • Organizer
      The 16th International Symposium on Molecular and Neural Mechanisms of Taste and Olfactory Perception
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 線虫C. elegansの頭部神経系全体のGCaMP6fを用いた活動解析2016

    • Author(s)
      大江紗, 寺本孝行, 徳永旭将, 広瀬修, 豊島有, 久下小百合, 飯野雄一, 吉田亮, 石原健
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] 線虫のwhole-brainイメージングデータに関する位相同期解析2016

    • Author(s)
      岩崎唯史, 寺本孝行, 大江紗, 徳永旭将, 広瀬修, Stephen Wu, 豊島有, ジャンムンソン, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会大会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] 線虫の塩忌避学習による行動変化に関与する神経の同定及び神経回路の解析2016

    • Author(s)
      Jang Moon-Sun, 豊島 有, 国友 博文, 金森 真奈美, 寺本 孝行, 石原 健, 飯野 雄一
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会大会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Related Report
      2016 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] A machine learning pipeline for whole brain imaging of Caenorhabditis elegans: cell tracking, quantification, annotation and visualization2016

    • Author(s)
      Stephen Wu , 徳永 旭将, 広瀬 修, 豊島 有, 寺本 孝行, 石原 健, 飯野 雄一, 吉田 亮
    • Organizer
      BioImage Informatics Conference 2016
    • Place of Presentation
      Breakthrough & Discovery Theatrette, Biopolis, Singapore
    • Year and Date
      2016-10-10
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 全脳イメージングの自動解析に向けた要素技術について2016

    • Author(s)
      豊島 有, 徳永 旭将, 広瀬 修, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
    • Organizer
      第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2016)
    • Place of Presentation
      東京国際交流館プラザ平成(東京都江東区)
    • Year and Date
      2016-09-29
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    • Invited
  • [Presentation] Whole Brain Imaging of Caenorhabditis Elegans × Machine Learning2016

    • Author(s)
      Stephen Wu, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino and Ryo Yoshida
    • Organizer
      第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2016)
    • Place of Presentation
      東京国際交流館プラザ平成(東京都江東区)
    • Year and Date
      2016-09-29
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  • [Presentation] Neural information processing by neuroglobin in Caenorhabditis elegans2016

    • Author(s)
      Shigekazu Oda, Yu Toyoshima, Mario de Bono
    • Organizer
      The 17th International Conference on Systems Biology
    • Place of Presentation
      Barcelona Palau de Congressos, Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2016-09-16
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      2016 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Accurate automatic detection of densely distributed cell nuclei in 3D space.2016

    • Author(s)
      Yu Toyoshima, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Moon-Sun Jang, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
    • Organizer
      CeNeuro2016
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2016-07-27
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Whole brain imaging reveals the roles of gap junctions for the synchronized oscillatory activity.2016

    • Author(s)
      Takeshi Ishihara, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuishi Iwasaki, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takayuki Teramoto.
    • Organizer
      CeNeuro2016
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2016-07-27
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of the neuronal activities of the central nervous system by GCaMP6f in C. elegans2016

    • Author(s)
      Suzu Oe, Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Sayuri Kuge, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara.
    • Organizer
      CeNeuro2016
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2016-07-27
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Correlation clustering reveals intrinsic graph structure of whole-brain imaging data2016

    • Author(s)
      Hiromu Sakuma, Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuishi Iwasaki
    • Organizer
      CeNeuro2016
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2016-07-27
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Labeling of active neural circuit by the calcium probe CaMPARI2016

    • Author(s)
      Keita Mori,Yu Toyoshima,Yuichi Iino
    • Organizer
      第39回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-07-20
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  • [Presentation] 全脳イメージングの自動解析に向けた要素技術について2016

    • Author(s)
      豊島 有, 徳永 旭将, 広瀬 修, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
    • Organizer
      バイオイメージインフォマティクスワークショップ2016
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      大阪大学吹田キャンパス(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2016-06-22
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  • [Presentation] A machine learning pipeline for whole brain imaging of Caenorhabditis elegans: cell tracking, quantification, annotation and visualization2016

    • Author(s)
      Stephen Wu, 徳永 旭将, 広瀬 修, 豊島 有, 寺本 孝行, 石原 健, 飯野 雄一, 吉田 亮
    • Organizer
      バイオイメージインフォマティクスワークショップ2016
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      大阪大学吹田キャンパス(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2016-06-22
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  • [Presentation] Neural coding moduladion by Neuroglobin alters the behavior of C. elegans2016

    • Author(s)
      Shigekazu Oda, Yu Toyoshima, Mario de Bono
    • Organizer
      European Worm Meeting 2016
    • Place of Presentation
      Max Delbruck Center, Berlin, Germany
    • Year and Date
      2016-06-01
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 全脳イメージングに必要な要素技術について2016

    • Author(s)
      豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、Jang Moon Sun、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一
    • Organizer
      CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第4回領域会議
    • Place of Presentation
      国立科学博物館 (東京都台東区)
    • Year and Date
      2016-02-18
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  • [Presentation] 線虫C. elegansの頭部神経系全体のGCaMP6fを用いた活動解析2015

    • Author(s)
      大江紗、寺本孝行、徳永旭将、広瀬修、豊島有、久下小百合、飯野雄一、吉田亮、石原健
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場 (兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
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  • [Presentation] Intrinsic graph structure estimation from whole-brain imaging data of C. elegans2015

    • Author(s)
      Hiromu Sakuma, Takayuki Teramoto, Sayuri Kuge, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuishi Iwasaki
    • Organizer
      16th International Conference on Systems Biology
    • Place of Presentation
      Biopolis, Singapore
    • Year and Date
      2015-11-23
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Whole-brain Ca2+ imaging of C. elegans reveals the multi-neuronal dynamics that are coordinated by global synaptic connectivity.2015

    • Author(s)
      Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara
    • Organizer
      JST CREST-PRESTO joint international symposium - Structural Biological Dynamics: From Molecules to Life with 60 trillion Cells -
    • Place of Presentation
      東京大学伊東謝恩ホール (東京都文京区)
    • Year and Date
      2015-11-05
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Whole-brain Ca2+ imaging of C. elegans to explore the neuronal mechanisms for behavioral choice.2015

    • Author(s)
      Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara.
    • Organizer
      International Symposium on Prediction and Decision Making 2015
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール (東京都文京区)
    • Year and Date
      2015-10-31
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] "Tracking multiple cells with strongly-correlated moves in a 4D live-cell imaging data2015

    • Author(s)
      Osamu Hirose, Shotaro Kawaguchi, Terumasa Tokunaga, Takayuki Teramoto, Sayuri Kuge, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida
    • Organizer
      BioImage Informatics Conference 2015
    • Place of Presentation
      Green Auditorium (Gaithersburg, Maryland, USA)
    • Year and Date
      2015-10-14
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Whole-brain imaging of C. elegans reveals multi-neuronal dynamics under non-stimulus condition.2015

    • Author(s)
      Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara
    • Organizer
      第38会日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-07-28
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  • [Presentation] Whole-brain imaging of C. elegans reveals multi-neuronal dynamics under non-stimulus condition.2015

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      Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara
    • Organizer
      20th International Worm Meeting
    • Place of Presentation
      University of California, Los Angels (Los Angeles, California, USA)
    • Year and Date
      2015-06-24
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 空間粒子フィルタによる多数の細胞の同時追跡2015

    • Author(s)
      広瀬修、川口翔太郎、徳永旭将、豊島有、寺本孝行、久下小百合、石原健、飯野雄一、吉田亮
    • Organizer
      第21回 情報論的学習理論と機械学習(IBISML)研究会
    • Place of Presentation
      沖縄科学技術大学院大学 (沖縄県国頭郡)
    • Year and Date
      2015-06-23
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  • [Presentation] 3次元的に密集した細胞核の高精度な自動認識手法2015

    • Author(s)
      豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、Jang Moon Sun、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一
    • Organizer
      バイオイメージ・インフォマティクス ワークショップ 2015
    • Place of Presentation
      九州大学馬出キャンパス (福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2015-06-18
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  • [Presentation] 3次元的に密集した細胞核の高精度な自動認識手法と神経細胞の自動アノテーションの試み2015

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      豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、Jang Moon Sun、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一、
    • Organizer
      CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第4回数理道場
    • Place of Presentation
      大阪ガス研修所 奥池ロッジ (兵庫県芦屋市)
    • Year and Date
      2015-06-12
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  • [Presentation] Whole-brain imaging of C. elegans reveals multi-neuronal dynamics under non-stimulus condition.2015

    • Author(s)
      Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara
    • Organizer
      Wiring The Brain (Cold Spring Harbor Laboratory Meeting)
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor Laboratory (New York, USA)
    • Year and Date
      2015-03-24 – 2015-03-28
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  • [Presentation] 3次元的に密集した細胞核の高精度な自動認識手法2015

    • Author(s)
      豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、張 文瑄、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一、
    • Organizer
      定量生物学の会第7会年会
    • Place of Presentation
      九州大学筑紫キャンパスC-Cube(福岡県春日市)
    • Year and Date
      2015-01-11 – 2015-01-12
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  • [Presentation] 線虫C. elegansの全中枢神経のCa2+イメージングによる刺激に対する応答と無刺激時における神経活動の計測2014

    • Author(s)
      寺本 孝行、徳永 旭将、広瀬 修、豊島 有、飯野 雄一、吉田 亮、石原 健
    • Organizer
      第37回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
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  • [Presentation] 密集した細胞核の高精度な自動認識手法2014

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      豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、張 文瑄、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一、
    • Organizer
      第37回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
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  • [Presentation] 密集した細胞核の高精度な自動認識手法2014

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      豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、張 文瑄、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一、
    • Organizer
      CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第3回数理道場
    • Place of Presentation
      沖縄科学技術大学院大学シーサイドハウス(沖縄県国頭郡)
    • Year and Date
      2014-10-30
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  • [Presentation] Automated detection and tracking of many cells by using 4D live-cell imaging data2014

    • Author(s)
      Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Shotaro Kawaguchi, Yu Toyoshima, Takayuki Teramoto, Hisaki Ikebata, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino, Ryo Yoshida
    • Organizer
      第3回生命医薬情報学連合大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2014-10-02 – 2014-10-04
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  • [Presentation] 4D ライブセルイメージングデータ内の非常に多数の細胞を自動追跡するための空間粒子フィルタ手法の開発2014

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      広瀬修、川口翔太郎、徳永旭将、豊島有、寺本孝行、久下小百合、石原健、飯野雄一、吉田亮
    • Organizer
      2014年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス(東京都文京区)
    • Year and Date
      2014-09-13 – 2014-09-16
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    • URL

      http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JResearch/

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  • [Remarks] 密集した多数の神経細胞の活動を同時に測定する自動画像解析技術を開発

    • URL

      https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2016/4863/

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  • [Remarks] 神経細胞と神経回路のシミュレーション

    • URL

      http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JResearch/JResearch10_simulation.html

    • Related Report
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  • [Remarks] 全神経回路の働きの解明

    • URL

      http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JResearch/JResearch11_wholebrain.html

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Published: 2014-04-04   Modified: 2020-03-30  

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