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Analysis for mobility and molecular mechanism of centromeric non-coding RNP in chromosome segregation

Research Project

Project/Area Number 26870442
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Molecular biology
Genetics/Chromosome dynamics
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

Ideue Takashi  熊本大学, 自然科学研究科, 助教 (20420250)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
KeywordsノンコーディングRNA / セントロメア / 染色体分離 / RNP / 抗がん戦略
Outline of Final Research Achievements

Non-coding (nc)RNA transcribed from human centromere region forms RNA-Protein complex with several factors, and have a role in chromosome segregation and cytokinesis. In this study, I have identified several factors associate with centromere ncRNA and analyzed these functions in chromosome segregation and cytokinesis as a components of centromere ncRNP.
RBMX, IMP-3, IQGAP1 are identified as a components of centromeric ncRNP. IP experiment revealed that these factors associates with centromere ncRNA. Depletion of RBMX showed abnormal chromosome segregation and sister chromatid separation.IMP-3, IQGAP1 and Centromere ncRNA shows localization of central spindle and midbody which concern to cytokinesis after chromosome segregation. Depletion of ncRNA and these factors show abnormal cytokinesis in addition of defects of chromosome segregation.These results reveals that these factors have a role in not only chromosome segregation but also cytokinesis together with centromeric ncRNA.

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Research-status Report
  • Research Products

    (24 results)

All 2016 2015 2014 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (4 results)

  • [Int'l Joint Research] ウエルカムトラスト細胞生物学センター(英国)

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  • [Journal Article] ノックダウンによるncRNAの機能解析2015

    • Author(s)
      井手上賢
    • Journal Title

      羊土社 実験医学増刊号 ノンコーディングRNAテキストブック

      Volume: 33 Pages: 3390-3395

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  • [Journal Article] Involvement of satellite I RNA associating with Aurora B in regulation of chromosome segregation2014

    • Author(s)
      T.Ideue, Y. Cho, K. Nishimura and T. Tani
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 19 Issue: 6 Pages: 528-538

    • DOI

      10.1111/gtc.12149

    • Related Report
      2014 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Centromeric non-coding RNP complexes regulate chromosome segregation2016

    • Author(s)
      Yukiko Cho, Takashi Ideue, Kanako Nishimura, Norie Araki ,Tokio Tani
    • Organizer
      2016 joint annual meeting of the RNA Society and the RNA Society of Japan
    • Place of Presentation
      京都国際会議場
    • Year and Date
      2016-06-28
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      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] セントロメアncRNP複合体によるコヒーシンならびに染色体分離の制御2015

    • Author(s)
      長 裕紀子、井手上 賢、荒木 令江、谷 時雄
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会 第88回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2015-12-01
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    • Author(s)
      本田 杏子、井手上 賢、長 裕紀子、荒木 令江、谷 時雄
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会 第88回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2015-12-01
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  • [Presentation] 染色体分離制御に関与するセントロメアncRNP複合体の同定2015

    • Author(s)
      長 裕紀子、井手上 賢、西村 佳菜子、荒木 令江、谷 時雄
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2015年会
    • Place of Presentation
      くまもと森都心プラザ
    • Year and Date
      2015-07-23
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  • [Presentation] セントロメアncRNA複合体によるクロマチン動態の制御2015

    • Author(s)
      牟田園 正敏、井手上 賢、長 裕紀子、西岡 詩織、坂本 美鈴、石井 浩二郎、荒木 令江、谷 時雄
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2015年会
    • Place of Presentation
      くまもと森都心プラザ
    • Year and Date
      2015-07-23
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  • [Presentation] セントロメアncRNP複合体は染色体分離および細胞質分裂に関与する2015

    • Author(s)
      井手上 賢、長 裕紀子、荒木 令江、谷 時雄
    • Organizer
      第17回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      ホテルライフォート札幌
    • Year and Date
      2015-07-15
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] セントロメアncRNP複合体の染色体分離制御における役割2015

    • Author(s)
      長 裕紀子、井手上 賢、荒木 令江、谷 時雄
    • Organizer
      第17回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      ホテルライフォート札幌
    • Year and Date
      2015-07-15
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  • [Presentation] Regulation of RNAi-mediated formation of centromeric heterochromatin through ncRNA and the splicing machinery in fission yeast2015

    • Author(s)
      Masatoshi Mutazono, Misato Morita, Chihiro Tsukahara, Madoka Chinen, Jun-ichi Nakayama, Kojiro Ishii, Takashi Ideue, Tokio Tani
    • Organizer
      Chromatin and Epigenetics EMBO CONFERENCE
    • Place of Presentation
      Germany EMBL Heidelberg
    • Year and Date
      2015-05-06 – 2015-05-10
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Novel role of the splicing factors in chromosome segregation2014

    • Author(s)
      Kanako Nishimura, Takashi Ideue, Yukiko Cho, Tokio Tani
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜 パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Novel roles of centromeric non-coding RNP in regulation of sister chromatid cohesion2014

    • Author(s)
      Takashi Ideue, Yukiko Cho, Kanako Nishimura, Norie Araki Tokio Tani.
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜 パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] スプライシング因子とncRNAイントロンを介したセントロメアへテロクロマチン形成の制御機構2014

    • Author(s)
      牟田園正敏、森田京、塚原千紘、知念まどか、中山潤一、石井浩二郎、井手上賢、谷時雄
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜 パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] セントロメアサイレンシングにおけるdg non-coding RNAイントロンの役割2014

    • Author(s)
      牟田園正敏、森田京、塚原千紘、知念まどか、中山潤一、石井浩二郎、井手上賢、谷時雄
    • Organizer
      第32回 Yeast Workshop
    • Place of Presentation
      広島 呉 ビューポートくれ/呉海員会館
    • Year and Date
      2014-11-14 – 2014-11-15
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Identification of centromeric ncRNP components involved in regulation of chromosome segregation2014

    • Author(s)
      Takashi Ideue, Kanako Nishimura, Yukiko Cho, Norie Araki and Tokio Tani
    • Organizer
      Joint Australia and Japan RNA Meeting
    • Place of Presentation
      Sydney Australia
    • Year and Date
      2014-11-02 – 2014-11-05
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 染色体分離におけるセントロメアncRNPの役割2014

    • Author(s)
      長裕紀子、井手上賢、西村佳菜子、荒木令江、谷時雄
    • Organizer
      第16回 日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋 ウインクあいち
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] スプライシング因子とncRNAイントロンを介したセントロメアへテロクロマチン形成の制御機構2014

    • Author(s)
      牟田園正敏、森田京、塚原千紘、弓掛辰洋、知念まどか、中山潤一 石井浩二郎 井手上賢、谷時雄
    • Organizer
      第16回 日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋 ウインクあいち
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Regulation of RNAi-mediated formation of centromeric heterochromatin through the splicing machinery in fission yeast2014

    • Author(s)
      Masatoshi Mutazono, Misato Morita, Chihiro Tsukahara, Madoka Chinen, Jun-ichi Nakayama, Kojiro Ishii, Takashi Ideue, Tokio Tani
    • Organizer
      19th RNA meeting
    • Place of Presentation
      Canada Quebec
    • Year and Date
      2014-06-03 – 2014-06-08
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Roles of centromeric non-coding RNA in chromosome segregation2014

    • Author(s)
      Yukiko Cho, Kanako Nishimura, Takashi Ideue, Tokio Tani
    • Organizer
      19th RNA meeting
    • Place of Presentation
      Canada Quebec
    • Year and Date
      2014-06-03 – 2014-06-08
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      2014 Research-status Report
  • [Remarks] 熊本大学 理学部 谷研究室 ホームページ

    • URL

      http://www.sci.kumamoto-u.ac.jp/~biohome/staff/tani/index.htm

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  • [Remarks] 熊本大学 研究コア キラル分子生命科学 ホームページ

    • URL

      http://www.sci.kumamoto-u.ac.jp/chiralmolecule/

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      2015 Annual Research Report
  • [Remarks] 熊本大学 大学院 自然科学研究科 谷研究室 ホームページ

    • URL

      http://www.sci.kumamoto-u.ac.jp/bio/staff/tani/index.htm

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    • URL

      http://www.sci.kumamoto-u.ac.jp/chiralmolecule/

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      2014 Research-status Report

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Published: 2014-04-04   Modified: 2022-01-31  

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