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組織特異的なヘテロクロマチンサイレンシングに関わる新規因子の解析

Research Project

Project/Area Number 26891018
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Plant molecular biology/Plant physiology
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

池田 陽子  岡山大学, その他部局等, 助教 (80467688)

Project Period (FY) 2014-08-29 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsサイレンシング / ヒストン修飾 / ヘテロクロマチン
Outline of Annual Research Achievements

トランスポゾンを含むヘテロクロマチン領域のサイレンシング機構を明らかにするため、シロイヌナズナを用いて、特定の組織において特異的にヘテロクロマチンサイレンシングが解除される新規変異体kumonosu(kun)を単離した。kun変異体では、多数のトランスポゾン及びrDNAリピートを含むヘテロクロマチン領域の転写が活性化されていた。本年度において、KUNがどのような機構でヘテロクロマチン領域の転写制御に関わるかを明らかにするため、kun変異体を用いた機能解析を行い、次の点について成果を得た。

1. kun変異体における特定のターゲット領域のDNAメチル化を解析したところ、CG, CHG, CHHすべてのタイプのメチル化のわずかな減少が見られた。
2. kun変異体におけるターゲット領域のクロマチン構造を解析するため、ヒストンメチル化抗体を用いたクロマチン免疫沈降法により、ヒストン修飾を調べた結果、ターゲット領域における抑制型ヒストン修飾の減少を検出した。

これらのことから、KUNはDNAメチル化及びヒストンメチル化を介してヘテロクロマチン領域のサイレンシングに関与すると考えられた。今後は、kun変異体におけるDNAメチル化及びヒストンメチル化のゲノムワイドな解析や、既知のヘテロクロマチンサイレンシングに関わる変異体との遺伝学的相互作用の解析を行う計画である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(1 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2015 2014

All Presentation (3 results)

  • [Presentation] KUMONOSU gene is involved in DNA methylation and heterochromatin-associated silencing2015

    • Author(s)
      Ikeda, Y., Lopez-Gonzalez, L., Pouch-Pelissier, M., Bourguet, P., Thierry, P., Pogorelcnik, R., Mathieu, O.
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京)
    • Year and Date
      2015-03-18
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Towards functional analysis of DNA methylation in Marchantia polymorpha.2014

    • Author(s)
      Ikeda, Y., Kato, M., Nishihama, R., Yamaoka, S., Kohchi, T., Hirayama T.
    • Organizer
      Marchantia workshop 2014
    • Place of Presentation
      神戸大学(神戸)
    • Year and Date
      2014-12-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification of Arabidopsis KUMONOSU gene involved in DNA methylation and heterochromatin-associated silencing.2014

    • Author(s)
      Ikeda, Y., Becker, C., Lopez-Gonzalez, L., Pouch-Pelissier, M., Pogorelcnik, R., Weigel, D., Mathieu, O.
    • Organizer
      FEBS-EMBO 2014 conference
    • Place of Presentation
      パリ(フランス)
    • Year and Date
      2014-09-01
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-09-09   Modified: 2016-06-01  

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