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環境自律応答する移動型転写分子ロボットの創出

Publicly Offered Research

Project AreaDevelopment of Molecular Robots equipped with sensors and intelligence
Project/Area Number 15H00798
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionOsaka University (2016)
Kyoto University (2015)

Principal Investigator

多田隈 尚史  大阪大学, たんぱく質研究所, 助教 (10339707)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Fiscal Year 2016: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2015: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Keywords1分子計測(SMD) / 核酸 / 蛋白質 / 分子機械 / 分子モーター / 1分子計測(SMD)
Outline of Annual Research Achievements

自律的に動作する分子ロボットを構築する為に、DNAナノ構造物(DNA origami)上に転写酵素(T7 RNA polymerase、以下T7 RNAP)と基質遺伝子を集積化した"転写ナノチップ"を構築し、観察を行った。本年度は、前年までの基本的な性質の評価を踏まえ、制御システムの導入に注力した。具体的には、基質遺伝子と、固定部位の間に、センサーとして機能するリンカーを入れ、外部シグナルによって、ナノチップの機能のON/OFFを制御した。活性を溶液反応系で測定した所、外部シグナル依存的に、ナノチップの転写活性をON/OFFできる事がわかった。続いて、論理演算子の組み込みを行った。外部シグナルとして、microRNA(miRNA)を用いた実験系を計画・実施した所、3入力のAND、OR、多数決回路を構築することができた。これらの演算子付ナノチップを、人工細胞に見立てたエマルジョンの中に閉じ込めて、非常に薄い濃度で活性を測定した所、1分子で動作することがわかった。すなわち、1分子のチップで、検出・演算・出力の機能を併せ持つ、自律的ナノデバイスの構築に成功した。そこで、このナノチップを組合わせた遺伝子回路を構築し、人工細胞の中に入れた所、miRNAのプロファイルに自律的に応答する事に成功した。これらの成果は、従来、多種・多数の生体因子を用いる必要があった論理機能の実現が、1分子のチップで実現できる事を示唆しており、従来作製することが難しかったより複雑な遺伝子回路の構築に有用であると期待される。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2016 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] RNA Study Using DNA Nanotechnology.2016

    • Author(s)
      *Tadakuma H, Masubuchi T, Ueda T.
    • Journal Title

      Prog Mol Biol Transl Sci

      Volume: 139 Pages: 121-163

    • DOI

      10.1016/bs.pmbts.2015.11.004

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Journal Article] Single-molecule analysis of the target cleavage reaction by Drosophila RNAi enzyme complex2015

    • Author(s)
      Yao C, Sasaki HM, Ueda T, *Tomari Y, *Tadakuma H
    • Journal Title

      Molecular Cell (in press)

      Volume: - Issue: 1 Pages: 125-132

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2015.05.015

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Rational design of orthogonal gene transcription nano device on DNA origami2016

    • Author(s)
      Masubuchi T, Tadakuma H, Endo M, Iizuka R, Sugiyama H, Harada Y, Funatsu T, Ueda T
    • Organizer
      CBI学会2016年大会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都江戸川区)
    • Year and Date
      2016-10-25
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 転写ナノチップを用いた、転写機構の機能解析2016

    • Author(s)
      多田隈尚史
    • Organizer
      第39回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Construction of DNA origami base gene transcription nano chip2016

    • Author(s)
      多田隈尚史
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Holliday junction DNA facilitates RuvA-RuvB complex formation2016

    • Author(s)
      Yong-Woon Han, Reiko Yamamoto, Kimiko Nakao, Hisashi Tadakuma, Yoshie Harada
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] A single integrated gene nano-chip functioning in an artificial cell2016

    • Author(s)
      増渕、遠藤、飯塚、井口、Hyun、関口、Qi、飯沼、宮薗、庄子、船津、杉山、原田、上田、多田隈
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 神経分化時における神経細胞内温度イメージング2016

    • Author(s)
      Masaki Kinoshita, Kohki Okabe, Hisashi Tadakuma, Yoshie Harada
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Rational design of orthogonal gene transcription nano device on DNA origami2016

    • Author(s)
      Takeya Masubuchi, Hisashi Tadakuma, Masayuki Endo, Ryo Iizuka, Hiroshi Sugiyama, Yoshie Harada, Takashi Funatsu, Takuya Ueda
    • Organizer
      RNA2016
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府・京都市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Rational design of orthogonal gene transcription nano device on DNA origami2015

    • Author(s)
      Takeya Masubuchi, Hisashi Tadakuma, Masayuki Endo, Hiroshi Sugiyama, Yoshie Harada, Takuya Ueda
    • Organizer
      BMB2015 第38回日本分子生物学学会, 第88回日本生化学大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Construction and functional analysis of DNA origami base DNA-RNAP hybrid nanomachine2015

    • Author(s)
      Takeya Masubuchi, Hisashi Tadakuma, Masayuki Endo, Hiroshi Sugiyama, Yoshie Harada, Takuya Ueda
    • Organizer
      CBI学会2015年大会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都・江戸川区)
    • Year and Date
      2015-10-27
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Rational design of orthogonal gene transcription nano device on DNA origami2015

    • Author(s)
      Takeya Masubuchi, Hisashi Tadakuma, Masayuki Endo, Hiroshi Sugiyama, Yoshie Harada, Takuya Ueda
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      金沢大学角間キャンパス(石川県・金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Book] 現代化学 No.5482016

    • Author(s)
      藤原慶、多田隈尚史
    • Total Pages
      2
    • Publisher
      現代化学
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Book] DNA分子デザインのすべて~BIOMOD虎の巻2016

    • Author(s)
      多田隈尚史
    • Total Pages
      16
    • Publisher
      情報計算化学生物学会 (CBI 学会) 出版
    • Related Report
      2016 Annual Research Report

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Published: 2015-04-16   Modified: 2019-03-07  

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