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受容体による環境情報感知機構とゲノム編集による機能解明

Publicly Offered Research

Project AreaPlant cell wall as information-processing system
Project/Area Number 15H01245
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

刑部 祐里子  徳島大学, 大学院生物資源産業学研究部(連携), 特任准教授 (50444071)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥8,710,000 (Direct Cost: ¥6,700,000、Indirect Cost: ¥2,010,000)
Fiscal Year 2016: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2015: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Keywordsアポプラストシグナル / 受容体型キナーゼ / 重複性遺伝子 / ゲノム編集 / 植物 / シグナル伝達 / ゲノム / 重複遺伝子
Outline of Annual Research Achievements

植物アポプラストには様々な化学的・物理的な刺激が存在しており、植物細胞膜局在する受容タンパク質がこれらのシグナルを細胞内へ情報伝達する。特に、水分ストレスに関連するアポプラストシグナルは多様かつ複合的であり、我々はそのシグナル伝達機構を明らかにするために、シロイヌナズナにおいて水分ストレス応答に重要な組織やストレス初期に特異的な発現を示す受容体型キナーゼ(RLK)遺伝子を探索した結果、ロイシンリッチリピート(LRR)型RLK(LRR-RLK)遺伝子を含む異なるドメイン構造をもち、これまで水分ストレス応答との関わりは不明であったRLK遺伝子を選抜した。選抜したLRR-RLKとその相同性遺伝子が欠損する多重変異体では水分ストレスへの耐性能が強く低下しており、またストレス耐性に関わる遺伝子群の発現が抑制されることが明らかになった。これらから、LRR-RLKが担う新規ペプチドシグナル伝達経路の存在が推定された。また、その他のRLK遺伝子群の中には、相同性遺伝子がゲノム上で重複して存在するクラスター構造を示していた。重複遺伝子は遺伝的多様性をもたらし生物の進化に重要な役割を持っていると考えられている。しかし、これまで機能欠損を解析するための多重変異体作製は困難であったため、tRNAプロセシングを利用したMultiplex-CRISPR/Cas9 を用いた高効率ゲノム編集系を構築し、多重変異体を作出した。構築したベクターを用いて複数の遺伝子からなるRLKクラスター領域に、広範囲に変異を導入した。作製した多重変異系統を用いたシグナル伝達経路の詳細解析を進めており、水分ストレス耐性メカニズムの組織・細胞特異性の解明などの研究を進めており、今後詳細なシグナル伝達経路を明らかにする。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (25 results)

All 2017 2016 2015 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Book (4 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] MYB transcription factor gene involved in sex determination in Asparagus officinalis2016

    • Author(s)
      K. Murase, S. Shigenobu, S. Fujii, K. Ueda, T. Murata, A. Sakamoto, Y. Wada, K. Yamaguchi, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, A. Kanno, Y. Ozaki and S. Takayama
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 22 Issue: 1 Pages: 115-123

    • DOI

      10.1111/gtc.12453

    • NAID

      120005983408

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genome engineering of woody plants: past, present and future2016

    • Author(s)
      Yuriko Osakabe, Shigeo S Sugano and Keishi Osakabe
    • Journal Title

      Journal of Wood Science

      Volume: 62 Issue: 3 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1007/s10086-016-1548-5

    • NAID

      120006961148

    • Related Report
      2016 Annual Research Report 2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Optimization of CRISPR/Cas9 genome editing to modify abiotic stress responses in plants.2016

    • Author(s)
      Yuriko Osakabe, Y Watanabe, SS Sugano, R Ueta, R Ishihara, K Shinozaki and Keishi Osakabe
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 26685-26685

    • DOI

      10.1038/srep26685

    • NAID

      120006240041

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Genome editing with engineered nucleases in plants.2015

    • Author(s)
      Yuriko Osakabe and Keishi Osakabe
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 56 Issue: 3 Pages: 389-400

    • DOI

      10.1093/pcp/pcu170

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] CRISPR/Cas9 による植物ゲノム編集技術の開発2017

    • Author(s)
      刑部祐里子
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会シンポジウム
    • Place of Presentation
      鹿児島大学(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 根毛形成に異常を示すシロイヌナズナ変異体の原因遺伝子の同定2017

    • Author(s)
      島田 佳南里, 井内 聖, 井内 敦子, 坂本 秀樹, 山田 晃嗣, 刑部 敬史, 刑部 祐里子
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] CRISPR/Cas9によるイチゴFvD14遺伝子を標的としたゲノム編集技術の確立2017

    • Author(s)
      田上 翔也, 島田 佳南里, 篠原 啓子, 島田 佳南里, 刑部 敬史, 刑部 祐里子
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAプロセシングを利用した多重ゲノム編集の双子葉植物への応用2017

    • Author(s)
      石原 諒典, 上田 梨紗, 阿部 千尋, 山田 晃嗣, 刑部 祐里子, 刑部 敬史
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Genome editing technology to improve plant environmental response2016

    • Author(s)
      Yuriko Osakabe
    • Organizer
      Latest Advances in Plant Development and Environmental Response 2016, Cold Spring Harbor-Asia Meeting
    • Place of Presentation
      ウェスティンホテル淡路(兵庫県淡路市)
    • Year and Date
      2016-11-28
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] RNAプロセシングを利用した多重ゲノム編集技術の植物への応用2016

    • Author(s)
      石原 諒典, 上田 梨紗, 阿部 千尋, 島田 佳南里, 菅野 茂夫, 渡辺 崇人, 刑部 祐里子, 刑部 敬史
    • Organizer
      日本植物学会第80回大会
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県沖縄市)
    • Year and Date
      2016-09-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] ゲノム編集技術による植物環境応答能の改変2016

    • Author(s)
      刑部 祐里子, 渡辺 崇人, 菅野 茂夫, 上田 梨紗, 石原 諒典, 篠崎 一雄, 刑部 敬史
    • Organizer
      日本ゲノム編集学会第1回大会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場(広島県広島市)
    • Year and Date
      2016-09-06
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] CRISPR/Cas9によるイチゴFvD14遺伝子を標的としたゲノム編集技術の確立2016

    • Author(s)
      田上 翔也, 島田 佳南里, 篠原 啓子, 島田 佳南里, 刑部 敬史, 刑部 祐里子
    • Organizer
      日本ゲノム編集学会第1回大会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場(広島県広島市)
    • Year and Date
      2016-09-06
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAプロセシングを利用した多重ゲノム編集技術を用いた植物ゲノムの改変2016

    • Author(s)
      石原 諒典, 上田 梨紗, 阿部 千尋, 島田 佳南里, 菅野 茂夫, 渡辺 崇人, 刑部 祐里子, 刑部 敬史
    • Organizer
      日本ゲノム編集学会第1回大会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場(広島県広島市)
    • Year and Date
      2016-09-06
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] CRISPR/Cas9によるシロイヌナズ ナ環境ストレス応答性遺伝子のゲ ノム編集2016

    • Author(s)
      刑部 祐里子, 菅野 茂夫, 渡辺 崇人, 上田 梨紗, 石原 諒典, 篠崎 一雄, 刑部 敬史
    • Organizer
      第57回日本植物生理学会大会
    • Place of Presentation
      岩手大学( 岩手県・盛岡市)
    • Year and Date
      2016-03-20
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 高効率 CRISPR/Cas9による SlIAA9 ノックアウトトマトの作出2016

    • Author(s)
      上田 梨紗, 阿部 千尋, 石原 諒典, 渡辺 崇人, 菅野 茂夫, 宮脇 克行, 野地 澄晴, 刑部 祐里子, 刑部 敬史
    • Organizer
      第57回日本植物生理学会大会
    • Place of Presentation
      岩手大学( 岩手県・盛岡市)
    • Year and Date
      2016-03-20
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物ゲノム編集の基礎・最先端情報と新育種技術への応用;有効かつ効果的に利用するために2016

    • Author(s)
      刑部祐里子
    • Organizer
      情報機構セミナー
    • Place of Presentation
      江戸川区産業会館(東京都江戸川区)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CRISPR/Cas9によるトマトIAA9 遺伝子を標的としたゲノム編集技術の確立2015

    • Author(s)
      上田 梨紗, 石原 諒典, 阿部 千尋, 渡辺 崇人, 菅野 茂夫, 宮脇 克行, 野地 澄晴, 刑部 祐里子, 刑部 敬史
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド( 兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-04
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] CRISPRの植物研究への応用- CRISPR/Cas9による植物ゲノム編集技術開発2015

    • Author(s)
      刑部 祐里子
    • Organizer
      学術振興会植物バイオ第160委員会 第10回研究会「ゲノム編集研究の現状と産業応用の可能性」
    • Place of Presentation
      千里ライフセンター( 大阪府・大阪市)
    • Year and Date
      2015-07-30
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Genetic Engineering of Abiotic Stress Response and Growth in Plants2015

    • Author(s)
      Yuriko Osakabe
    • Organizer
      26 th International Conference on Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      Paris (France)
    • Year and Date
      2015-07-09
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 実験医学増刊「All Aboutゲノム編集」2016

    • Author(s)
      刑部 祐里子, 刑部 敬史
    • Total Pages
      233
    • Publisher
      羊土社
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Book] 「第11章 植物でのゲノム編集」論文だけではわからないゲノム編集成功の秘訣Q&A2015

    • Author(s)
      安本 周平, 關 光, 刑部 祐里子, 刑部 敬史, 村中 俊哉
    • Total Pages
      17
    • Publisher
      羊土社
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Book] 「人工ヌクレアーゼを用いた植物の遺伝子変異導入技術への応用展開」進化するゲノム編集技術2015

    • Author(s)
      刑部祐里子、菅野茂夫、刑部敬史
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Book] “Genome editing in higher plants” in “Targeted Genome Editing Using Engineered Nucleases: ZFNs, TALENs, and the CRISPR/Cas9 System”2015

    • Author(s)
      Osakabe, Y., Osakabe, K
    • Total Pages
      9
    • Publisher
      Springer -Verlag
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Remarks] 徳島大学生物資源産業学部生物育種生産学分野

    • URL

      http://www.plantbio.bb.tokushima-u.ac.jp

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] 徳島大学教育研究者総覧 准教授:刑部 祐里子

    • URL

      http://pub2.db.tokushima-u.ac.jp/ERD/person/289666/work-ja.html

    • Related Report
      2016 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-04-16   Modified: 2018-03-28  

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