Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
本研究は、赤潮原因藻ヘテロシグマ(学名 Heterosigma akashiwo)に感染する大型二本鎖DNAウイルス( 以下GDNAVと略)であるHeterosigma akashiwo virus（HaV）の特性を明らかにし、また、その感染戦略を理解するために行った。まず、HaVの1系統であるHaV53の全長配列を解読し、遺伝子予測を行ったところ、HaV53は247遺伝子を持ち、また、3つのtRNAをコードすることが明らかになった。その遺伝子配列を、他のGDNAVゲノムと比較・精査したところ、HaV53は、他のGDNAVとは異なる特徴を持ったウイルスであることが明らかとなった。GDNAは、Nucleocytoplasmic large dsDNA virusとも呼ばれ、その増幅・転写は、多くは宿主核周辺で、その機能を利用して起こると理解されてきた。例えば、ウイルスゲノムが増殖する際に見られる「ウイルス工場」は、核内、あるいは核に隣接して観察され、また、これまで発表されたケースでは、感染過程で検出されるRNAはポリアデニル化されたものであることが知られてきた。しかし、HaVが感染した宿主のRNAをpolyAセレクション後にRNAseqした場合には、ウイルス由来の転写物はほとんど見出されなかった。一方、total RNAからribosomal RNAを除去したものをRNAseqした場合には、ウイルス由来転写物が検出された。つまり、HaV53感染時に検出されるウイルス遺伝子由来のRNAは、HaV53感染時の遺伝子転写は、核内RNAポリメラーゼ以外の機構を利用していることを示唆している。このような例は、GDNAVでは初めての報告であり、HaVの独自性を示すものであり、また、GDNAVの多様な感染戦略の一端を明らかにしたものと言える。
28年度が最終年度であるため、記入しない。
All 2016 Other
All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results, Open Access: 2 results, Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (1 results)
Frontiers in Microbiology
Volume: 7
120005980911
Genome Annoucements
Volume: 4
http://www.rib.okayama-u.ac.jp/researchactivity/20161220-1.html
