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肺炎マイコプラズマの接着滑走マシナリーの微細構造解明と構成タンパク質の構造解析

Publicly Offered Research

Project AreaHarmonized supramolecular machinery for motility and its diversity
Project/Area Number 15H01337
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNational Institute of Infectious Diseases

Principal Investigator

見理 剛  国立感染症研究所, 細菌第二部, 室長 (80270643)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥11,310,000 (Direct Cost: ¥8,700,000、Indirect Cost: ¥2,610,000)
Fiscal Year 2016: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2015: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
KeywordsMycoplasma pneumoniae / 肺炎マイコプラズマ / 細胞接着 / 滑走運動 / 接着器官 / P1 タンパク質 / 構造解析 / 細胞骨格 / タンパク質構造解析 / 蛍光タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

肺炎マイコプラズマの細胞接着と滑走運動を担う P1 タンパク質の構造解析を進めるため、組換え P1 の生産条件を改良した。改良した条件では、大腸菌培養液 1 リットルあたり、1~1.5 mg 程度の高純度な組換え P1 が精製でき、10~20 mg/ml の濃縮 P1 サンプルが大量調製できようになった。このサンプルを使用し大規模な結晶化スクリーニングを行ったが、X線結晶解析を行えるような P1 結晶は得られなかった。現時点で P1 結晶を得ることはできなかったが、X線小角散乱法(SAXS)による分析では、組換え P1 は球状の単量体で、コンパクトな形状をしており、今後結晶化条件が見つかる可能性はあると考えられる。P1 にはアミノ酸配列が少し異なるサブタイプがいくつか知られている。本研究課題では 1 型の P1 について結晶化の試みを続けてきたが、2a 型の P1 についても、今後結晶化を試みるため発現系を構築した。組換え P1 について領域内の共同研究でクライオ電顕による単粒子解析も進めた。
一方、肺炎マイコプラズマの HMW2 は 216 kDa の細胞骨格タンパク質で、coiled-coil モチーフに富んでいる。HMW2 は肺炎マイコプラズマの接着器官の形成と維持に必須な細胞骨格(core 構造)の主成分だと考えられている。HMW2 は N末端を細胞の外側、C末端を内側に向ける配置で平行に会合し core 構造を形成していると考えられる。今回 HMW2 の coiled-coil モチーフ領域を欠失または重複させることによって、肺炎マイコプラズマの細胞内で core 構造の長さを 変化させられるようになった。Core 構造の長さが異なることよって、肺炎マイコプラズマの滑走運動性がどのように変化するのか詳しく解析している。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Inter- and intra-strain variability of tandem repeats in Mycoplasma pneumoniae based on next-generation sequencing data2017

    • Author(s)
      Zhang J, Song X, Ma MJ, Xiao L, Kenri T, Sun H, Ptacek T, Li S, Waites KB, Atkinson TP, Shibayama K, Dybvig K, Feng Y
    • Journal Title

      Future Microbiol.

      Volume: 12 Issue: 2 Pages: 119-129

    • DOI

      10.2217/fmb-2016-0111

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Complete genome sequences of the p1 gene type 2b and 2c strains Mycoplasma pneumoniae KCH-402 and KCH-4052017

    • Author(s)
      Kenri T, Suzuki S, Horino A, Sekizuka T, Kuroda M, Fujii H, Hashimoto T, Nakajima H, Ohya H, Shibayama K
    • Journal Title

      Genome Announc.

      Volume: 5

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Epidemiology of Mycoplasma pneumoniae infections in Japan and therapeutic strategies for macrolide-resistant M. pneumoniae2016

    • Author(s)
      Yamazaki T, Kenri T
    • Journal Title

      Front. Microbiol.

      Volume: 7

    • DOI

      10.3389/fmicb.2016.00693

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Systematic structural analyses of attachment organelle in Mycoplasma pneumonia2015

    • Author(s)
      Nakane D, Kenri T, Matsuo L, Miyata M.
    • Journal Title

      PLOS Pathogens

      Volume: 11 Issue: 12 Pages: 1-19

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1005299

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] ヒト肺炎原因菌 Mycoplasma pneumoniae の“あし”P1 adhesin2017

    • Author(s)
      松本 優, 川北 祥人, 見理 剛, 森 茂太郎, 浜口 祐, 木下 実紀, 川本 晃大, 加藤 貴之, 難波 啓一, 宮田 真人
    • Organizer
      第90回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      仙台市
    • Year and Date
      2017-03-19
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Epidemiological pattern of Mycoplasma pneumoniae pneumonia in Japan and genomic analyses of2017

    • Author(s)
      Tsuyoshi Kenri
    • Organizer
      ARI panel meeting, United States - Japan Cooperative Medical Sciences Program
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2017-02-09
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Novel sequence variations in the cytadherence-related orf6 gene of Mycoplasma pneumoniae2016

    • Author(s)
      Tsuyoshi Sekizuka, Masato Suzuki, Atsuko Horino, Hiroyuki Fujii, Toru Hashimoto, Hiroshi Nakajima, Hitomi Ohya, Shigetarou Mori, Makoto Kuroda, Keigo Shibayama, Tsuyoshi Kenri
    • Organizer
      21st Congress of the International Organization for Mycoplasmology
    • Place of Presentation
      Brisbane, Australia
    • Year and Date
      2016-07-03
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structure and function of P1 adhesin, the leg for Mycoplasma pneumoniae gliding2016

    • Author(s)
      U Matsumoto, Yoshito Kawakita, Tsuyoshi Kenri, Shigetaro Mori, Miki Kinoshita, Akihiro Kawamoto, Takayuki Kato, Keiichi Namba, Makoto Miyata
    • Organizer
      21st Congress of the International Organization for Mycoplasmology
    • Place of Presentation
      Brisbane, Australia
    • Year and Date
      2016-07-03
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] P1遺伝子 2b 型、2c型の M. pneumoniae 株で見つかった細胞接着関連遺伝子 orf6 の変化2016

    • Author(s)
      見理 剛、関塚 剛史、鈴木 仁人、堀野 敦子、森 茂太郎、藤井 寛之、橋本 徹、中嶋 洋、大屋 日登美、黒田 誠、柴山 恵吾
    • Organizer
      日本マイコプラズマ学会 第43回学術集会
    • Place of Presentation
      長崎市
    • Year and Date
      2016-06-24
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Mycoplasma pneumoniae の滑走のあし、P1 adhesinの詳細な構造2016

    • Author(s)
      松本 優, 川北 祥人, 見理 剛, 森 茂太郎, 木下 実紀, 川本 晃大, 加藤 貴之, 難波 啓一, 宮田 真人
    • Organizer
      日本マイコプラズマ学会 第43回学術集会
    • Place of Presentation
      長崎市
    • Year and Date
      2016-06-24
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Structure and function of P1 adhesin, leg in Mycoplasma pneumoniae gliding2016

    • Author(s)
      松本 優, 川北 祥人, 見理 剛, 森 茂太郎, 浜口 祐, 木下 実紀, 川本 晃大, 加藤 貴之, 難波 啓一, 宮田 真人
    • Organizer
      日本細菌学会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Structure and Function of the Attachment Organelle of Mycoplasma pneumoniae2016

    • Author(s)
      Tsuyoshi Kenri
    • Organizer
      US/Japan Cooperative Medical Science Program: 18th Acute Respiratory Infections (ARI) Panel Meeting
    • Place of Presentation
      ベゼスダ, MD, USA
    • Year and Date
      2016-01-13
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structure and Function of P1 Adhesin of Mycoplasma pneumoniae2015

    • Author(s)
      U Matsumoto, Yoshito Kawakita, Tsuyoshi Kenri, Shigetaro Mori, Tasuku Hamaguchi, Miki Kinoshita, Akihiro Kawamoto, Takayuki Kato, Keiichi Namba and Makoto Miyat
    • Organizer
      The 2nd East-Asia Microscopy Conference (EAMC2)
    • Place of Presentation
      姫路
    • Year and Date
      2015-11-24
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structure and function of P1 adhesin of Mycoplasma pneumoniae2015

    • Author(s)
      Yu Matsumoto, Yoshito Kawakita, Tsuyoshi Kenri, Shigetaro Mori, Tasuku Hamaguchi, Miki Kinoshita, Akihiro Kawamoto, Takayuki Kato, Keiichi Namba, Makoto Miyata
    • Organizer
      第53回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Mycoplasma pneumoniae、P1 adhesinの構造と機能2015

    • Author(s)
      松本 優、川北祥人、見理 剛、森茂太郎、木下実紀、宮田真人
    • Organizer
      日本マイコプラズマ学会 第42回学術集会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2015-05-22
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Book] 最新マイコプラズマ学2016

    • Author(s)
      見理 剛
    • Total Pages
      13
    • Publisher
      近代出版
    • Related Report
      2015 Annual Research Report

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Published: 2015-04-16   Modified: 2018-03-28  

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