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細胞分化可塑性を規定する染色体高次構造の解析

Publicly Offered Research

Project AreaIntegral understanding of the mechanism of transcription cycle through quantitative, high-resolution approaches
Project/Area Number 15H01352
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

山本 拓也  京都大学, iPS細胞研究所, 特定拠点講師 (60546993)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2016: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2015: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Keywordsゲノム / 発生・分化 / 発生・分化
Outline of Annual Research Achievements

「細胞の分化能力」を染色体の高次構造の制御という観点から明らかにすることが本研究の目標である。多能性幹細胞の重要な性質の一つである多分化能の本質は、幹細胞で発現していない遺伝子群が分化刺激に対して、適切に転写を開始できることにある。したがって、多能性幹細胞で発現していない分化関連遺伝子群がどのような制御を受けて転写を開始する準備を整えているのかを知ることは重要であるが、解析はほとんど進んでいない。本研究では、多能性幹細胞において、分化関連遺伝子群の転写制御領域の染色体高次構造を同定し、その制御メカニズムを明らかにすることにより、幹細胞の重要な性質を規定する根本原理に迫ることを目的とした。

前年度までに、染色体高次構造解析により、分化関連遺伝子の特徴であるバイバレント修飾をプロモーター領域にもつ遺伝子群が3次元空間上で、近傍に位置しやすいということを明らかにした。本年度は、我々の染色体高次構造解析と公共データベースに存在する核内部の染色体位置データを統合して解析することにより、体細胞初期化過程において、核膜の近傍に存在するバイバレント遺伝子は、核の中心へ移動することを示した。解析過程で、種々の網羅的解析に関するプログラムの開発も行なっている。また、機能阻害実験により、PRC1、PRC2、TrxG複合体が、多能性幹細胞において、バイバレントプロモーターの3次元空間上での集合に必要であることを示した。これらの結果は、エピジェネティック修飾と染色体の空間配置や高次構造が密接に関連し、分化関連遺伝子が外部刺激に対して素早く応答できるように制御されていることを示唆するものである。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2017 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] レスター大学(英国)

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Journal Article] Hybrid Cellular Metabolism Coordinated by Zic3 and Esrrb Synergistically Enhances Induction of Naive Pluripotency2017

    • Author(s)
      Masamitsu Sone, Nobuhiro Morone, Tomonori Nakamura, Akito Tanaka, Keisuke Okita, Knut Woltjen, Masato Nakagawa, John E Heuser, Yasuhiro Yamada, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto
    • Journal Title

      Cell Metabolism

      Volume: 印刷中

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] HYBRID CELLULAR METABOLISM COORDINATED BY ZIC3 AND ESRRB SYNERGISTICALLY ENHANCES SOMATIC CELL REPROGRAMMING2016

    • Author(s)
      Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto
    • Organizer
      ISSCR 2016
    • Place of Presentation
      San Francisco, CA, U.S.
    • Year and Date
      2016-06-22
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Hybrid Cellular Metabolism Coordinated by Zic3 and Esrrb Synergistically Enhance2016

    • Author(s)
      Sone M, Yamanaka S, and Yamamoto T.
    • Organizer
      CiRA/ISSCR 2016
    • Place of Presentation
      日本、京都
    • Year and Date
      2016-03-22
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] CHROMATIN INTERACTIONS AT DEVELOPMENTAL GENE LOCI ARE REESTABLISHED BY SOMATIC CELL REPROGRAMMING2015

    • Author(s)
      Hiroki Ikeda, Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto
    • Organizer
      ISSCR 13th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      スウェーデン, ストックホルム
    • Year and Date
      2015-06-24
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR AND ZIC FAMILY TRANSCRPTION FACTORS SYNERGISTICALLY ENHANCE SOMATIC CELL REPROGRAMMING2015

    • Author(s)
      Sone M, Yamanaka S, and Yamamoto T.
    • Organizer
      ISSCR 13th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      スウェーデン, ストックホルム
    • Year and Date
      2015-06-24
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 京都大学iPS細胞研究所山本研究室

    • URL

      http://www.cira.kyoto-u.ac.jp/yamamoto/

    • Related Report
      2016 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-04-16   Modified: 2022-01-31  

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