ＤＮＡ変換酵素のスライディングと共役した酵素活性機構の動的構造基盤の解明

• Project Area: Novel measurement techniques for visualizing 'live' protein molecules at work
• Project/Area Number: 15H01634
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Complex systems
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 永田 崇 京都大学, エネルギー理工学研究所, 准教授 (10415250)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2017-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2016)
• Budget Amount: ¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000); Fiscal Year 2016: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000); Fiscal Year 2015: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
• Keywords: NMR / APOBEC / 実時間計測 / 脱アミノ化 / AFM

Outline of Annual Research Achievements

今年度はまず、がんの原因変異を引き起こすシチジン脱アミノ化酵素APOBEC3B（A3B）について、NMR実時間解析を行った。A3Bは一本鎖DNA（ssDNA）に含まれるTC配列を脱アミノ化してTU配列に変換する。今回、A3Bは短いssDNAに含まれるTC配列に対して高い活性を示すこと、また長いssDNAにおいては、末端領域よりも中心領域に含まれるTC配列に対して高い活性を示すこと等を明らかにした。これらの性質は、同じAPOBECファミリーの抗HIV1因子APOBEC3G（A3G）の性質とは大きく異なる。A3Gは長いssDNAに含まれるシチジンに対して高い活性を示すとともに、シチジンの位置依存性に関しては3’→5’極性を有することを、我々は明らかにして来た。A3Bについて得られた新しい知見について論文を作成し、海外学術誌に投稿した。今後は高速AFM観察により、A3BとA3Gの異なる機能発現機構を明らかにする。
一方昨年度は、A3GがssDNA上をスライディングする姿を高速AFMで観察することを試みて、問題点と改善の指針を得ていた。今年度はそれを踏まえて、ssDNAの向きを決められる系を構築するとともに、ssDNAが比較的弱く固定化出来る条件を検討した。前者により、A3GがssDNA上を動く際の向きを知ることができ、後者により、ssDNAの固定化が及ぼすA3Gの動きへの影響を抑えることが出来る。領域内共同研究により更なる条件検討を進めている。
新たにはじめた核酸のin-cell NMRについては、ヒト培養細胞に導入した核酸のNMRスペクトルを世界に先駆けて得ることに成功していた。今年度は、細胞内環境、疑似細胞内環境及び試験管内環境における核酸のスペクトルを比較した。異なる環境への感受性は核酸配列または構造により異なることがわかった。現在論文作成と追加実験を進めている。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Int'l Joint Research] National Institute of Health/Kansas State University/UCSF(米国)
• [Int'l Joint Research] ETH(Switzerland)
• [Int'l Joint Research] Universite Laval(Canada)
• [Journal Article] Molecular Landscape of the Ribosome Pre-initiation Complex during mRNA Scanning: Structural Role for eIF3c and Its Control by eIF5 (2017)
  • Author(s): Obayashi E, Luna RE, Nagata T, Martin-Marcos P, Hiraishi H, Singh CR, Erzberger JP, Zhang F, Arthanari H, Morris J, Pellarin R, Moore C, Harmon I, Papadopoulos E, Yoshida H, Nasr ML, Unzai S, Thompson B, Aube E, Hustak S, Stengel F, Dagraca E, Ananbandam A, Gao P, Urano T, Hinnebusch AG, Wagner G, Asano K.
  • Journal Title: Cell Report Volume: 18 Issue: 11 Pages: 2651-2663
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2017.02.052
  • NAID: 120006358788
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Structure, dynamics and interaction of p54nrb/NonO RRM1 with 5' Splice Site RNA sequence. (2016)
  • Author(s): Duvignaud JB, Bedard M, Nagata T, Muto Y, Yokoyama S, Gagne; SM, Vincent M
  • Journal Title: Biochemistry Volume: 0 Issue: 18 Pages: 0-0
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.5b01240
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] The binding specificity of translocated in liposarcoma/fused in sarcoma with lncRNA transcribed from the promoter region of cyclin D1 (2016)
  • Author(s): Yoneda, R., Suzuki, S., Mashima, T., Kondo, K., Nagata, T., Katahira, M. and Kurokawa, R.
  • Journal Title: Cell Biosci. Volume: 6(4) Issue: 1 Pages: 1-12
  • DOI: 10.1186/s13578-016-0068-8
  • NAID: 120005763383
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse components in solution (2016)
  • Author(s): Okamura, H., Nishimura, H., Nagata, T., Kigawa, T., Watanabe, T. and Katahira M.
  • Journal Title: Sci. Rep. Volume: 6(21742) Issue: 1 Pages: 1-12
  • DOI: 10.1038/srep21742
  • NAID: 120005705947
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Characterization of the deamination coupled with sliding along DNA of anti-HIV factor APOBEC3G on the basis of the pH-dependence of deamination revealed by real-time NMR monitoring (2016)
  • Author(s): Kamba K, Nagata T, Katahira M
  • Journal Title: Front. Microbiol. Volume: 0 Pages: 0-0
  • DOI: 10.3389/fmicb.2016.00587
  • NAID: 120005947002
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] K+-responsive off-to-on switching of hammerhead ribozyme through dual G-quadruplex formation requiring no heating and cooling treatment (2015)
  • Author(s): Yamaoki Y, Nagata T, Mashima T, Katahira M
  • Journal Title: Biochemical and biophysical research communications Volume: 468(1-2) Issue: 1-2 Pages: 27-31
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.10.173
  • NAID: 120005712951
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] リグノセルロースの糖－リグニン複合体とその酵素反応の解析 (2017)
  • Author(s): 西村 裕志,左近 静香, Jenny Arnling Baath, Amanda Ristinmaa, Johanna Nilsson, Gunnar Westman, Lisbeth Olsson, 永田 一真, 永田 崇, 片平 正人, 渡辺 隆司
  • Organizer: 第67回日本木材学会大会
  • Place of Presentation: 九州大学（福岡市）
  • Year and Date: 2017-03-17
• [Presentation] 安定同位体標識法を用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとリグニン間相互作用のNMRによる解析 (2017)
  • Author(s): 徳永有希、大城理志、永田崇、近藤敬子、西村裕志、片平正人、渡辺隆司
  • Organizer: 第67回日本木材学会大会
  • Place of Presentation: 九州大学（福岡市）
  • Year and Date: 2017-03-17
• [Presentation] Characterization of Glutathione-Dependent Enzymes from White Rot Fungi (2017)
  • Author(s): Wan Hasnidah Wan Osman, Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • Organizer: 日本農芸化学会2017年度京都大会
  • Place of Presentation: ウェスティン都ホテル京都（京都市）
  • Year and Date: 2017-03-17
• [Presentation] Heterologous expression of the ligninolytic enzymes from wood rotting fungi and analysis of peroxidase activity, lignin model degradation, and homologous modeling (2017)
  • Author(s): Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • Organizer: 日本農芸化学会2017年度京都大会
  • Place of Presentation: ウェスティン都ホテル京都（京都市）
  • Year and Date: 2017-03-17
• [Presentation] Characterization of the deamination activity of APOBEC3B by real-time NMR, which is distinct from that of APOBEC3G (2017)
  • Author(s): Li Wan, Takashi Nagata, Ryo Morishita, Akifumi Takaori-Kondo, Masato Katahira
  • Organizer: 7th Asia-Pacific NMR Symposium
  • Place of Presentation: Indian Institute of Science (Bangalore)
  • Year and Date: 2017-02-16
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Sliding and intersegmental transfer along DNA enhance the enzymatic activity of APOBEC3G as revealed by real-time NMR monitoring methods (2017)
  • Author(s): Keisuke Kamba, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • Organizer: 7th Asia-Pacific NMR Symposium
  • Place of Presentation: Indian Institute of Science (Bangalore)
  • Year and Date: 2017-02-16
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] リアルタイムNMRモニタリング法による酵素反応の定量解析及びヒト抗ウイルス因子ＡＰＯＢＥＣ３Ｇの脱アミノ化機構の解明 (2017)
  • Author(s): 神庭圭佑、永田崇、片平正人
  • Organizer: 定量生物学の会年会
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター（岡崎）
  • Year and Date: 2017-01-05
• [Presentation] NMR study for the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS, a key regulator of the transcriptional repression by cyclin D1 and telomere (2017)
  • Author(s): K. Kondo, T. Mashima, T. Oyoshi, R. Yoneda, R. Kurokawa, T. Nagata, M. Katahira
  • Organizer: International Symposium for NMR of Nucleic Acids
  • Place of Presentation: Gyeongsang National Univ. (Korea)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Development of K+-responsive RNA aptamer and ribozyme, and in-cell NMR of nucleic acids in human cells (2017)
  • Author(s): Y. Yamaoki, A. Kiyoishi, T. Mashima, F. Kano, M. Murata, T. Nagata, M. Katahira
  • Organizer: International Symposium for NMR of Nucleic Acids
  • Place of Presentation: Gyeongsang National Univ. (Korea)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] プリオンタンパク質とプリオンタンパク質を標的とするRNA分子のAβ線維化への影響 (2016)
  • Author(s): 飯田 真美子, 真嶋 司, 山置 佑大, 永田 崇, 片平正人
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] スライディングとストランド間移動を用いたヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの高効率なDNA配列探索：実時間NMRによる新知見 (2016)
  • Author(s): 神庭 圭佑、永田 崇、片平 正人
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] 非コードRNAと結合してcyclin D1転写を抑制するTLS/FUSのRNA認識機構の構造学的基盤 (2016)
  • Author(s): 真嶋司, 小澤 駿介, 近藤 敬子, Nesreen Hamad, 米田竜馬, 黒川 理樹, 永田崇, 片平 正人
  • Organizer: 第39回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: シフィコ横浜（横浜市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] Characterization of the deamination activity of APOBEC3B by real-time NMR, which is distinct from that of APOBEC3G (2016)
  • Author(s): Li Wan, Takashi Nagata, Ryo Morishita, Akifumi Takaori-Kondo, Masato Katahira
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（つくば市）
  • Year and Date: 2016-11-25
• [Presentation] 深層学習に支援されたNMRシグナルの自動解析 (2016)
  • Author(s): 小林直宏、服部良一、永田崇、児嶋長次郎、藤原敏道
  • Organizer: 第55回NMR討論会
  • Place of Presentation: 広島国際会議場（広島市）
  • Year and Date: 2016-11-16
• [Presentation] Cyclin D1遺伝子転写制御やテロメア長制御に関わるTLS/FUSタンパク質と非コード核酸間の相互作用のNMR法による解析 (2016)
  • Author(s): 近藤 敬子, 真嶋 司, 大吉 崇文, 米田 竜馬, 黒川 理樹, 永田 崇, 片平 正人
  • Organizer: 第55回NMR討論会
  • Place of Presentation: 広島国際会議場（広島市）
  • Year and Date: 2016-11-16
• [Presentation] 木質バイオマスにおける超分子構造とステレオ選択的な酵素反応及び核酸のin-cell NMR (2016)
  • Author(s): 山置佑大，永田一真、清石彩華、西村裕志、加納ふみ、村田昌之、大田ゆかり、渡辺隆司、永田崇、片平正人
  • Organizer: 第55回NMR討論会
  • Place of Presentation: 広島国際会議場（広島市）
  • Year and Date: 2016-11-16
• [Presentation] Heterologous expression and structure-activity relationship analysis of the oxidative enzymes from wood rotting fungi that are involved in lignocellulose degradation (2016)
  • Author(s): Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • Organizer: 第61回リグニン討論会
  • Place of Presentation: 京都大学（宇治市）
  • Year and Date: 2016-10-27
• [Presentation] リグノセルロースバイオリファイナリーのためのリグニン・ペプチド間相互作用解析 (2016)
  • Author(s): 山口亜佐子、末富高志、大城理志、徳永有希、西村裕志、永田崇、真嶋司、 片平正人、磯﨑勝弘、高谷光、中村正治、渡辺隆司
  • Organizer: 第61回リグニン討論会
  • Place of Presentation: 京都大学（宇治市）
  • Year and Date: 2016-10-27
• [Presentation] 海洋性細菌に由来するリグニンβ-O-4還元開裂酵素GST4の解析 (2016)
  • Author(s): 嶋根康弘、前田亜鈴悠、塩谷美夏、黒澤佳奈子、市川淳子、 布浦拓郎、山置佑大、永田崇、片平正人、高谷光、 吉田亮太、中村正治、渡辺隆司、大田ゆかり
  • Organizer: 第61回リグニン討論会
  • Place of Presentation: 京都大学（宇治市）
  • Year and Date: 2016-10-27
• [Presentation] Investigation of the interactions between eukaryotic initiation factors implicated during ribosomal scanning and start codon recognition (2016)
  • Author(s): Takashi Nagata
  • Organizer: The 42nd Naito Conference on “In the Vanguard of Structural Biology: Revolutionizing Life Sciences”
  • Place of Presentation: シャトレーゼカトーキングダム（札幌市）
  • Year and Date: 2016-10-04
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Non-coding RNA/DNA recognition by TLS/FUS that causes repression of cyclin D1 transcription and telomere elongation (2016)
  • Author(s): Kondo, K., Mashima, T., Oyoshi, T., Yoneda, R., Kurokawa, R., Nagata, T. and Katahira, M.
  • Organizer: The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • Place of Presentation: 熊本大学（熊本市）
  • Year and Date: 2016-09-27
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Invention of K+-responsive Tat-binding RNA aptamer and hammerhead ribozyme, and in-cell NMR of nucleic acids (2016)
  • Author(s): Yudai Yamaoki, Ayaka Kiyoishi, Tsukasa Mashima, Fumi Kano, Masayuki Murata, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • Organizer: The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • Place of Presentation: 熊本大学（熊本市）
  • Year and Date: 2016-09-27
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] カリウムイオン応答性Tat結合RNAアプタマーおよびハンマーヘッドリボザイムの創製およびin-cell NMR法による細胞内核酸の観測 (2016)
  • Author(s): 山置 佑大, 清石 彩華, 真嶋 司, 加納 ふみ, 村田 昌之, 永田 崇, 片平 正人
  • Organizer: 第10回バイオ関連化学シンポジウム、第31回生体機能関連化学シンポジウム、第19回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  • Place of Presentation: 石川県立音楽堂（金沢市）
  • Year and Date: 2016-09-07
• [Presentation] Development of artificial RNA and artificial peptide to control gene expression by using NMR (2016)
  • Author(s): Yumi Takeda, Takashi Nagata, Ryo Amano, Yusuke Nomura, Kazuo Harada, Colin A. Smith, Masato Katahira, Taiichi Sakamoto
  • Organizer: The 7th International Symposium of Advanced Energy Science
  • Place of Presentation: 京都大学（宇治市）
  • Year and Date: 2016-09-05
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Low-cost degradation of azo dyes using the GRP-tagged azoreductase combined with NADPH regeneration enzymes immobilized on the curdlan sheet (2016)
  • Author(s): Masataka Horiuchi, Yasuhiko Suzuki, Masanori Ochiai, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • Organizer: The 7th International Symposium of Advanced Energy Science
  • Place of Presentation: 京都大学（宇治市）
  • Year and Date: 2016-09-05
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Structural study of RNA aptamer and peptide that potently perturb the function of intrinsically disordered proteins related to disease (2016)
  • Author(s): Takashi Nagata
  • Organizer: The 5th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
  • Place of Presentation: 理化学研究所横浜キャンパス（横浜市）
  • Year and Date: 2016-08-29
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse compounds, and real-time monitoring of enzymatic reaction (2016)
  • Author(s): Okamura, H., Kamba, K., Nishimura, H., Kigawa, T., Watanabe, T., Nagata, T., Katahira, M.
  • Organizer: The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都市）
  • Year and Date: 2016-08-21
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] K+-responsive Activation of Ribozyme System via Structural Transition from Duplex to Dual-quadruplex Requiring no Heating and Cooling Treatment (2016)
  • Author(s): Yudai Yamaoki, Takashi Nagata, Tsukasa Mashima, Masato Katahira
  • Organizer: The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都市）
  • Year and Date: 2016-08-21
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] NMR analysis of the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS which causes transcriptional repression of cyclin D1 and telomere shortening (2016)
  • Author(s): Tsukasa Mashima, Keiko Kondo, Takanori Oyoshi, Ryoma Yoneda, Riki Kurokawa, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • Organizer: The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都市）
  • Year and Date: 2016-06-28
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Binding properties of high-affinity RNA aptamers against AML1 Runt domain (2016)
  • Author(s): Ryo Amano, Kenta Takada, Yoichiro Tanaka, Takashi Nagata, Masato Katahira, Yoshikazu Nakamura, Tomoko Kozu, Taiichi Sakamoto
  • Organizer: The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都市）
  • Year and Date: 2016-06-28
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] K+-responsive activation of dual-quadruplex forming ribozyme system requiring no heating and cooling treatment (2016)
  • Author(s): Yudai Yamaoki, Tsukasa Mashima, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • Organizer: The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都市）
  • Year and Date: 2016-06-28
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Analysis of molecular interaction of peptides with lignin for lignocellulosic biorefinery (2016)
  • Author(s): Watanabe, T., Yamaguchi, A., Oshiro, S., Suetomi, T., Nishimura, H., Nagata, T., Mashima, T., Katahira, M., Isozaki, K., Takaya, H. and Nakamura, M.
  • Organizer: 4th Symposium on Biotechnology applied to Lignocelluloses
  • Place of Presentation: CSIC downtown Campus (Madrid)
  • Year and Date: 2016-06-19
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Cyclin D1転写抑制を担う TLS/FUS タンパク質と非コード RNA の相互作用の NMR 法による解析 (2016)
  • Author(s): 真嶋司, 小澤 駿介, 近藤 敬子, 永田崇, 黒川 理樹, 片平 正人
  • Organizer: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] プリオン蛋白質とそれを標的とする RNA 分子の A β線維化への影響 (2016)
  • Author(s): 飯田 真美子, 真嶋 司, 山置 佑大, 永田 崇, 片平正人
  • Organizer: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場（福岡市）
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] Binding properties of RNA aptamer against AML1 Runt domain (2016)
  • Author(s): R. Amano, K. Takada, T. Nagata, Y. Nomura, J. Fukunaga, Y. Tanaka, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu and T. Sakamoto
  • Organizer: Aptamer 2016
  • Place of Presentation: St Hilda's College (Oxford)
  • Year and Date: 2016-04-04
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Tandem GGA repeat G-quadruplex as an anti-prion protein aptamer and a K+-responsive structural/functional switching device (2016)
  • Author(s): T. Nagata, T. Mashima, Y. Yamaoki, F. Nishikawa, Y.O. Kamatari, S. Nishikawa, K. Kuwata and M. Katahira
  • Organizer: Aptamer 2016
  • Place of Presentation: St Hilda's College (Oxford)
  • Year and Date: 2016-04-04
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 転写因子AML1のDNA結合部位を標的とする高親和性RNAアプタマーの開発と解析 (2016)
  • Author(s): 天野亮，高田健多，田中陽一郎， 永田崇， 片平正人， 中村義一， 神津知子，坂本泰一
  • Organizer: 第5回日本生物物理学会関東支部会
  • Place of Presentation: 桐生地域地場産業振興センター (桐生市)
  • Year and Date: 2016-03-10
• [Presentation] 疾患に関わる天然変性蛋白質の昨日を阻害するRNAアプタマーと高親和性ペプチドのNMRによる構造機能相関解析 (2016)
  • Author(s): 永田 崇
  • Organizer: 第4回ネオバイオ分子研究会
  • Place of Presentation: 大阪府立大学 (大阪市)
  • Year and Date: 2016-01-29
  • Invited
• [Presentation] Binding properties of RNA aptamer that binds to the transcription factor AML1 Runt domain (2016)
  • Author(s): R. Amano, K. Takada, Y. Tanaka, T. Nagata, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu and T. Sakamoto
  • Organizer: The 8th Takeda Science Foundation Symposium on PharmaSciences
  • Place of Presentation: 武田薬品研修所 (大阪)
  • Year and Date: 2016-01-21
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] NMR study of RNA aptamer that binds to the transcription factor AML1 Runt domain (2016)
  • Author(s): T. Sakamoto, R. Amano, Y. Nomura, T. Nagata, M. Katahira, J. Fukunaga, Y. Tanaka, Y. Nakamura and T. Kozu
  • Organizer: The 8th Takeda Science Foundation Symposium on PharmaSciences
  • Place of Presentation: 武田薬品研修所 (大阪)
  • Year and Date: 2016-01-21
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 転写因子AML1 Runt domainを標的とした高親和性RNAアプタマーの特徴 (2015)
  • Author(s): 高田健多，天野亮，田中陽一郎，永田崇，片平正人，中村義一，神津知子，坂本泰一
  • Organizer: 第38回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド (神戸市)
  • Year and Date: 2015-12-01
• [Presentation] Analysis of the biocharacteristics of APOBEC3F by real-time NMR (2015)
  • Author(s): L. Wan，K. Kamba，T. Nagata，M. Katahira
  • Organizer: 第38回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド (神戸市)
  • Year and Date: 2015-12-01
• [Presentation] Heterologous expression and struature-activity relationship analysis of the oxidative enzymes involved in lignosellulose degradatioin from wood rotting fungi (2015)
  • Author(s): M. Lin，T. Nagata，B. Mikami，M. Katahira
  • Organizer: 第38回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド (神戸市)
  • Year and Date: 2015-12-01
• [Presentation] NMRによる実時間酵素活性アッセイにより抗ウィルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化機構を明らかにする (2015)
  • Author(s): 神庭圭佑，永田崇，片平正人
  • Organizer: 第38回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド (神戸市)
  • Year and Date: 2015-12-01
• [Presentation] AML1 (RUNX1)タンパク質のRuntドメインとRNAアプタマーの相互作用のNMR解析 (2015)
  • Author(s): 天野亮，高田健多，田中陽一郎，永田崇，片平正人，野村祐介，福永淳一，中村義一，神津知子， 坂本泰一
  • Organizer: 日本核酸医薬学会第1回年会
  • Place of Presentation: 京都テルサ (京都市)
  • Year and Date: 2015-11-30
• [Presentation] リアルタイムNMR法の新たな展開ー抗HIVタンパク質APOBECG3Gの認識ヌクレチド、DNA上のスライディング及びエピジェネクスとの関連に関する新知見ー (2015)
  • Author(s): 神庭圭佑，永田崇，片平正人
  • Organizer: 第54回NMR討論会
  • Place of Presentation: 千葉工業大学 (千葉市)
  • Year and Date: 2015-11-06
• [Presentation] 転写因子AML1 Runt domainに結合する高親和性RNAアプタマーのNMR解析 (2015)
  • Author(s): 高田健太，天野亮，田中陽一郎，永田崇，片平正人，中村義一，神津知子，坂本泰一
  • Organizer: 第54回NMR討論会
  • Place of Presentation: 千葉工業大学 (千葉市)
  • Year and Date: 2015-11-06
• [Presentation] 木質バイオマスの特性を決めるリグニンー多糖結合様式の決定 (2015)
  • Author(s): 神谷明宏，西村裕志，永田一真，永田崇，渡辺隆司，片平正人
  • Organizer: 第54回NMR討論会
  • Place of Presentation: 千葉工業大学 (千葉市)
  • Year and Date: 2015-11-06
• [Presentation] 海洋性Novosphingubium属細菌に由来するリグニンモデル2量体β-O-4結合開裂酵素群の酵素学的解析 (2015)
  • Author(s): 大田ゆかり、黒澤佳奈子、永田崇、片平正人、西村裕志、渡辺隆司、長谷川良一、秦田勇二
  • Organizer: 第60回リグニン討論会
  • Place of Presentation: 筑波大学 (筑波市)
  • Year and Date: 2015-11-05
• [Presentation] NMR study of the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS, a key regulator of cyclin D1 (2015)
  • Author(s): Kondo, K., Mashima, T., Oyoshi, T., Kurokawa, R., Nagata, T. and Katahira, M.
  • Organizer: The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • Place of Presentation: イーグレ姫路 (姫路市)
  • Year and Date: 2015-09-23
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Nucleic acid determinants of deamination by human anti-HIV factor, APOBEC3G, as revealed by real-time NMR method (2015)
  • Author(s): Kamba, K., Nagata, T., and Katahira, M.
  • Organizer: The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • Place of Presentation: イーグレ姫路 (姫路市)
  • Year and Date: 2015-09-23
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 効率よくウイルスDNAに変異を導入するAPOBEC3Gの脱アミノ化機構 (2015)
  • Author(s): 神庭 圭佑、永田 崇、片平 正人
  • Organizer: 第53回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 金沢大学 (金沢市)
  • Year and Date: 2015-09-13
• [Presentation] 異常型プリオン蛋白質の産生を抑制する四重鎖核酸の構造解析 (2015)
  • Author(s): 真嶋司，西川富美子，鎌足雄司，永田崇，西川諭，桑田一夫，片平正人
  • Organizer: 第９回バイオ関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 熊本大学 (熊本市)
  • Year and Date: 2015-09-10
• [Presentation] カリウムイオンを認識して活性がスイッテングするTat結合RNAアプタマーおよびハンマーヘッドリボザイムの創製 (2015)
  • Author(s): 山置佑大，真嶋司，永田崇，片平正人
  • Organizer: 第９回バイオ関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 熊本大学 (熊本市)
  • Year and Date: 2015-09-10
• [Presentation] Structural and biochemical studies on eIF1 with eIF3c and eIF5; rearrangement of subunit interaction for accurate recognition of AUC start codon (2015)
  • Author(s): Obayashi, E., Urano, T., Asano, K., Katahira, M., and Nagata, T.
  • Organizer: The 6th International Symposium of Advanced Energy Science～Towards the Realization of Zero-Emission Energy～
  • Place of Presentation: 京都大学 (宇治市)
  • Year and Date: 2015-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] NMR analyses of RNA-peptide complexes for the development of biomolecules which regulate gene expression (2015)
  • Author(s): R. Amano, Y. Nomura, T. Nagata, N. Kobayashi, Y. Mori, J. Fukunaga, Y. Tanaka, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu and T. Sakamoto
  • Organizer: The 6th International Symposium of Advanced Energy Science～Towards the Realization of Zero-Emission Energy～
  • Place of Presentation: 京都大学 (宇治市)
  • Year and Date: 2015-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] New strategy for high-throughput NMR analysis of biomolecules using the NMR database BMRB and tools for automated NMR analysis, MagRO, FLYA and CYANA (2015)
  • Author(s): N. Kobayashi, M. Yokochi, T. Iwata, BR. Sahoo, T. Nagata, JL. Markley, EL. Ulrich, E. Schmidt, P. Güntert, C. Kojima and T. Fujiwara
  • Organizer: International Society of Magnetic Resonance
  • Place of Presentation: China Executive Leadership Academy (Shanghai)
  • Year and Date: 2015-08-16
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Real-time NMR methods reveals deamination mechanism by human antiviral factor APOBEC3G (2015)
  • Author(s): K. Kamba, T. Nagata, M. Katahira
  • Organizer: 6th Asia-Pacific NMR Symposium
  • Place of Presentation: Hong Kong University of Science and Technology (Hong Kong)
  • Year and Date: 2015-08-13
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 転写抑制やテロメア短縮を引き起こすTLS/FUSと長鎖非コードRNAおよびDNA間結合の構造基盤 (2015)
  • Author(s): 近藤 敬子、 真嶋 司、大吉 崇文、黒川 理樹、永田 崇、片平 正人
  • Organizer: RNA meeting 2015
  • Place of Presentation: ホテルライフォート札幌 (札幌市)
  • Year and Date: 2015-07-15
• [Presentation] AML1タンパク質のDNA結合ドメインに対するRNAアプタマーの特性 (2015)
  • Author(s): 高田 健多，天野 亮，田中 陽一郎，永田 崇，片平 正人，中村 義一，神津 知子，坂本泰一
  • Organizer: RNA meeting 2015
  • Place of Presentation: ホテルライフォート札幌 (札幌市)
  • Year and Date: 2015-07-15
• [Presentation] AML1 タンパク質の Runt ドメインに結合する RNA アプタマーの取得と解析 (2015)
  • Author(s): 高田健多，天野亮，田中陽一郎，永田崇，片平正人，中村義一，神津知子， 坂本泰一
  • Organizer: 平成27年度日本生化学会関東支部例会
  • Place of Presentation: 新潟日報メディアシップ (新潟市)
  • Year and Date: 2015-06-20
• [Presentation] タンパク質の構造、相互作用、酵素反応のNMRによる解析 (2015)
  • Author(s): 永田 崇
  • Organizer: 第56回日本生化学会 中国-四国支部例会
  • Place of Presentation: 島根大学大学会館 (松江市)
  • Year and Date: 2015-05-29
  • Invited