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生細胞深部の分子構造変化ダイナミクスをとらえる1分子FRET計測法の開発

Publicly Offered Research

Project AreaNovel measurement techniques for visualizing 'live' protein molecules at work
Project/Area Number 15H01654
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

岡本 憲二  国立研究開発法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 専任研究員 (40402763)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords1分子計測 / FRET / 蛋白質構造 / 生細胞計測 / Raf / 1分子計測(SMD) / 細胞 / 生体分子 / 1分子計測 (SMD)
Outline of Annual Research Achievements

コンフォーカル顕微鏡をベースとし、2基の検出器ですべてのフォトンの検出時刻を記録する TS 検出を実現した1分子FRET計測顕微鏡装置を開発した。予備実験段階ではS/N比が低く、FRETの異なる分子を識別できていなかったが、実験条件を最適化してS/N比を向上し、複数のFRETピークを分離して識別できるまでに測定精度を向上させることに成功した。またアクセプタの直接励起を可能にするレーザーを導入し、2色の励起光を高速(周期 10kHz)で切り換えることでALEX計測を実現する装置開発をおこなった。これにより、バースト毎に、FRETと蛍光ラベルの活性状態との同時検出を可能にした。2重らせんDNAの参照試料を用いたin vitro系実験で、開発した装置の検証をおこなった結果、褪色分子の影響を取り除き、FRET分布の情報だけを取り出せることを明らかにした。
開発した装置を用いて、細胞内Raf分子の1分子FRET計測をおこなった。褪色分子の影響を取り除いて細胞内Raf構造分布を得ることに成功し、その結果、少なくとも3つの構造状態が存在すること、細胞にEGF刺激が加わると5分程度で高FRETから低FRETに分布が移動し、20分程度までにほぼ元の分布に戻ること、などが明らかになった。このようなEGF刺激への過渡的な応答は、従来の知見やバルクでの細胞イメージング実験結果と整合するものである。また、分子毎の分布として捉えたことにより、EGF刺激に応答しない成分が存在することが分かった他、応答して構造変化したRafの応答前後でのFRETや、応答したRafの割合などを定量的に捉えることにも成功した。細胞質中の分子について1分子計測をおこない、特に、細胞内反応ネットワークとの相互作用による変化を検出した点、さらに、応答による変化を定量的に捉えた点に関しては、世界でも初めての画期的な成果である。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] State transition analysis of spontaneous branch migration of the Holliday junction by photon-based single-molecule fluorescence resonance energy transfer.2016

    • Author(s)
      Okamoto, K. and Sako, Y.
    • Journal Title

      Biophys. Chem.

      Volume: 209 Pages: 21-27

    • DOI

      10.1016/j.bpc.2015.11.004

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 単一分子計測で明らかにする細胞中の分子動態2017

    • Author(s)
      岡本憲二、廣島通夫、日比野佳代、佐甲靖志
    • Organizer
      レーザー学会学術講演会第37回年次大会
    • Place of Presentation
      徳島大学常三島キャンパス(徳島県徳島市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] In-cell Single-molecule FRET Measurement of Cytosolic Proteins2017

    • Author(s)
      Kenji Okamoto
    • Organizer
      Protein & Peptide Conference-2017
    • Place of Presentation
      ヒルトン福岡シーホーク(福岡県福岡市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 生細胞内1分子FRET計測による情報処理蛋白質Rafの細胞質中構造分布の計測2016

    • Author(s)
      岡本憲二
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 信号処理蛋白質Rafの生細胞内ALEX計測2016

    • Author(s)
      岡本憲二、日比野佳代、佐甲靖志
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Raf の生細胞内構造分布を明らかにする1分子 FRET 計測2015

    • Author(s)
      岡本 憲二、日比野 佳代、佐甲 靖志
    • Organizer
      第53回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学(石川県・金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 上皮成長因子受容体(EGFR)の膜貫通および膜近傍ドメインの構造ダイナミクス解析2015

    • Author(s)
      前田 亮、佐藤 毅、岡本 憲二、稲葉 岳彦、佐甲 靖志
    • Organizer
      第53回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学(石川県・金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Related Report
      2015 Annual Research Report

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Published: 2015-04-16   Modified: 2018-03-28  

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