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細胞スケール閉鎖空間内における反応拡散波の物理

Publicly Offered Research

Project AreaSynergy of Fluctuation and Structure:Foundation of Universal Laws in Nonequilibrium Systems
Project/Area Number 16H00809
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

藤原 慶  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (20580989)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2017: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Keywords合成生物学 / 反応拡散系 / 細胞分裂 / 人工細胞 / 反応拡散 / 自己組織化 / ソフトマター / 生物物理
Outline of Annual Research Achievements

バクテリアの細胞分裂開始面を決定するMinタンパク質の反応拡散波(Min波)の人工細胞内再構成系を用い、反応拡散波の細胞サイズ空間におけるふるまいを解明することを目的としている。H28年度までに、Min波の人工細胞内での創発に必要な条件を見出したが、そのメカニズムは不明であった。そこでH29年度は、生化学的手法とMin波の人工細胞のサイズ相関を組み合わせ、このメカニズムに迫った。
Min波の発生条件を探索したところ、Min波の要素であるMinEの自発的な膜吸着が小さな空間サイズでは促進されることを見出した。空間サイズとMinEの自発的吸着の相関を解析したところ、MinE濃度依存的に空間依存性が変化することが見出された。そこでMinEの膜吸着能が異なる変異体を用意し同様の解析を行ったところ、その空間サイズ依存性は変異体の性質に伴い大きく変化することが示された。この結果は、MinEとの結合依存性が異なるよう脂質膜成分を変化させることに観察された。このことから、空間サイズが支配する細胞質:膜面での存在比の変化が細胞サイズ空間における反応拡散波の発生に重要であることが示された。
また、人工細胞内でのMin波は、バルク系と異なり、一定の濃度下でのみ発生することが明らかになった。それゆえ、転写翻訳装置の添加によりMin波の成分を合成させたところ、Min波の発生と消失が遷移する現象が観察された。
さらにMin波が示す性質の空間サイズ依存性を解析したところ、空間サイズがMin波の形状や速さをスケーリングし、波が単一の条件では空間サイズによらずMin波の占有率や回転周期が一定となる現象を見出した。この現象は数値シミュレーションにより、空間サイズに由来することが示唆された。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2017 2016

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Liposomal internal viscosity affects the fate of membrane deformation induced by hypertonic treatment2017

    • Author(s)
      K Fujiwara、M Yanagisawa
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 13 Issue: 48 Pages: 9192-9198

    • DOI

      10.1039/c7sm01421j

    • NAID

      130007648205

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Universal glass-forming behavior of in vitro and living cytoplasm2017

    • Author(s)
      Nishizawa Kenji、Fujiwara Kei、Ikenaga Masahiro、Nakajo Nobushige、Yanagisawa Miho、Mizuno Daisuke
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Issue: 1 Pages: 15143-15143

    • DOI

      10.1038/s41598-017-14883-y

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Minシステムからみた人工細胞内の反応拡散波2017

    • Author(s)
      藤原慶
    • Organizer
      第11回 自己組織化討論会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Behavior and characters of Min wave in cell-sized space2017

    • Author(s)
      Kei Fujiwara
    • Organizer
      アクティブマターの概念で繋ぐ生命機能の階層性
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] A localization wave of proteins reconstituted in artificial cells with crowding2017

    • Author(s)
      Kei Fujiwara
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 大腸菌細胞分裂面の決定機構の人工細胞内における再構成と解析2017

    • Author(s)
      光山隼史、義永那津人、栁澤実穂、土居信英、藤原慶
    • Organizer
      第14回21世紀大腸菌研究会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Confinement Effects on Reaction-Diffusion Waves of Min System Emerged in Lipid Droplets2017

    • Author(s)
      S. Kohyama, N. Yoshinaga、M. Yanagisawa, N. Doi, K. Fujiwara
    • Organizer
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2017
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 人工細胞内におけるMinシステムの起動条件の探索2017

    • Author(s)
      光山隼史、義永那津人、栁澤実穂、土居信英、藤原慶
    • Organizer
      細胞を創る研究会10.0
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Min反応拡散波の油中水滴内再構成2016

    • Author(s)
      光山隼史、土居信英、藤原慶
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県,つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-26
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工細胞内におけるMinシステム再構成条件の解明2016

    • Author(s)
      光山隼史、土居信英、藤原慶
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会9.0
    • Place of Presentation
      早稲田大学(東京都,新宿区)
    • Year and Date
      2016-11-21
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Min反応拡散波の細胞モデル油中水滴内における自己組織化2016

    • Author(s)
      光山隼史、土居信英、藤原慶
    • Organizer
      非線形ソフトマター研究会2016
    • Place of Presentation
      横浜市民ふれあいの里 上郷・森の家(神奈川県,横浜市)
    • Year and Date
      2016-10-29
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] A bacterial reaction-diffusion system entrapped in artificial cells2016

    • Author(s)
      K Fujiwara
    • Organizer
      Current and Future Perspectives in Active Matter
    • Place of Presentation
      Koshiba Hall, The University of Tokyo (Bunkyo-ku, Tokyo)
    • Year and Date
      2016-10-29
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Elucidation of configuration structure in micro behavior and collective pattern formation2016

    • Author(s)
      K Fujiwara
    • Organizer
      RIMS seminars, “Elucidation of configuration structure in micro behavior and collective pattern formation”
    • Place of Presentation
      Kyoto university, RIMS (Sakyo-ku, Kyoto)
    • Year and Date
      2016-09-12
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2016-04-26   Modified: 2018-12-17  

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