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「ベイズ最適化を活用した」分子自己組織化による ナノ構造制御

Publicly Offered Research

Project AreaExploration of nanostructure-property relationships for materials innovation
Project/Area Number 16H00879
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Packwood Daniel  京都大学, 高等研究院, 講師 (40640884)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
Fiscal Year 2017: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Keywordsベイズ最適化 / 密度汎関数理論 / 表面科学 / 分子自己組織化 / グラフェンナノリボン / 有機薄膜 / 有機エレクトロニクス / マテリアルインフォマティクス / molecular self-assembly / surface / first-principles / Bayesian optimisation / machine leanring / 化学物理 / 情報基礎 / 統計数学 / ナノ材料 / 複合材料
Outline of Annual Research Achievements

髪の毛の直径の100000分の1、銅とほぼ同じ導電率であるグラフェンナノリボン(GNR)はナノエレクトロニクスのために活発に研究されている。GNRを合成するには「ボトムアップ」というアプローチが国内外の研究グループにうまく活用されている。ここでは、金属基盤に吸着したプリカーサ分子は互いに引きあい、GNRを自己組織的に形成する。このアプローチは容易なGNR合成を可能にするが、プリカーサ分子を正しく選ばないと分子自己組織化がうまく進まない。この背景の中、与えられたプリカーサ分子の自己組織化によって何が形成されるか予測するための計算手法が必要になった。

本研究では、ベイズ最適化を密度汎関数理論(=DFT)を導入し、金属基盤上のプリカーサ分子の振る舞いを解明するための計算手法を開発した。この手法では、DFTから得られた情報による系のエネルギー地形をベイズ分析で推定し、そのエネルギー地形からエネルギーを最小化にする分子配置を予測する。この手法では、金属銅に分子が2個吸着している系に対し、ほぼ15のDFT計算の範囲以内で最適な分子配置を特定することが可能であり、分子配置の無作為抽出と比べるとほぼ9倍の効率性を達成する。プリカーサ分子が2個以上の場合を取り扱えるように研究を進めている。また、新しいGNRを形成するためのプリカーサ分子を予測するという逆問題をベイズ最適化により解決できて、横に並んでいるGNR集合を形成するプリカーサ分子を特定した。実験検証は進んでいる。

本研究の期間内に、ベイズ最適化の簡単な入門書を出版した(Packwood. Bayesian Optimization for Materials Science, Springer Briefs in the Mathematics of Materials, Tokyo, 2017)。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2018 2017 2016 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Substrate-molecule decoupling induced by self-assembly - implications for graphene nanoribbon fabrication2018

    • Author(s)
      Xinqian Li and Daniel Packwood
    • Journal Title

      AIP Advances

      Volume: 8 Issue: 4 Pages: 045117-045123

    • DOI

      10.1063/1.5025101

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Chemical and entropic control on the molecular self-assembly process2017

    • Author(s)
      Daniel Packwood, Patrick Han, Taro Hitosugi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 144643-14451

    • DOI

      10.1038/ncomms14463

    • NAID

      120005971845

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Rapid prediction of molecule arrangements on metal surfaces via Bayesian optimization2017

    • Author(s)
      Daniel Packwood, Taro Hitosugi
    • Journal Title

      Applied Physics Express

      Volume: 10 Pages: 065502-065506

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 表面上の分子自己組織化のための機械学習とモンテカルロ法2017

    • Author(s)
      Daniel Packwood
    • Organizer
      ものづくり企業に役に立つ応用数学手法の研究会(主催:日本応用数理学会)
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Machine learning for molecular self-assembly on surfaces2017

    • Author(s)
      Daniel Packwood
    • Organizer
      International Workshop on Machine Learning for Materials Science (Aalto University, Finland)
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 「ベイズ最適化を活用した」分子自己組織化によるナノ構造制御2016

    • Author(s)
      Daniel Packwood
    • Organizer
      新学術領域「ナノ構造情報」第5全体会議
    • Place of Presentation
      京都
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Bayesian optimization for nanostructure prediction2016

    • Author(s)
      Daniel Packwood
    • Organizer
      COMBO Users Meeting
    • Place of Presentation
      東京
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Book] Bayesian Optimization for Materials Science2017

    • Author(s)
      Daniel Packwood
    • Total Pages
      50
    • Publisher
      Springer
    • ISBN
      9789811067815
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Remarks] Group website

    • URL

      http://www.packwood.icems.kyoto-u.ac.jp/

    • Related Report
      2017 Annual Research Report

URL: 

Published: 2016-04-26   Modified: 2018-12-17  

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