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植物の発生を支えるmicroRNAネットワークの解明

Publicly Offered Research

Project AreaMultidimensional Exploration of Logics of Plant Development
Project/Area Number 16H01229
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

濱田 隆宏  東京大学, 大学院総合文化研究科, 助教 (20452534)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥10,660,000 (Direct Cost: ¥8,200,000、Indirect Cost: ¥2,460,000)
Fiscal Year 2017: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2016: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
KeywordsmicroRNA / ゼニゴケ / シロイヌナズナ / tudor / 植物 / AGO / Tudor / RNA顆粒
Outline of Annual Research Achievements

ゼニゴケmicroRNAに関する研究では、CRISPR/Cas9技術により作出したmicroRNA欠失変異体のうち、杯状体形成に異常が生じるmicroRNA欠失変異体に注目し、その詳細な解析を行った。このmicroRNA欠失変異体は葉状体の成長は正常だが、野生型よりも杯状体形成頻度が低く、まれに形成される杯状体内の無性芽数も極めて少なくなる。そのため、このmicroRNAは杯状体や無性芽の形成に必須ではないが、正常な形成過程に必要な因子であると言える。野生型とmicroRNA欠失変異体のトランスクリプトーム解析を行った結果、microRNA欠失変異体では杯状体形成に関連した特異的なRNA量の変動が認められた。
シロイヌナズナTARPタンパク質に関する研究では、TARP同様のドメイン構造を有するが、これまでに解析してきたTARP1, TARP2とは異なるクレードに属するTARP4, TARP5の解析を行った。変異体の表現型解析では、tarp4/tarp5二重変異体とtarp1/tarp2二重変異体は共に矮性ではあるが、その形態は大きく異なることを明らかにした。さらにsmall RNA解析及びトランスクリプトーム解析の結果、tarp1/tarp2二重変異体で得られていたような特徴的なsmall RNA量の変化やトランスクリプトームの変化が見られなかった。そのためTARP4, TARP5はTARP1, TARP2とは異なる機能を持っていることが示唆された。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2018 2017 2016

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome.2017

    • Author(s)
      Bowman J, Kouchi T,..(106名)..Yokoyama R, ..(4名)
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 171 Issue: 2 Pages: 287-304

    • DOI

      10.1016/j.cell.2017.09.030

    • NAID

      120006353839

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The GYF domain protein PSIG1 dampens the induction of cell death during plant-pathogen interactions2017

    • Author(s)
      Matsui Hidenori、Nomura Yuko、Egusa Mayumi、Hamada Takahiro、Hyon Gang-Su、Kaminaka Hironori、Watanabe Yuichiro、Ueda Takashi、Trujillo Marco、Shirasu Ken、Nakagami Hirofumi
    • Journal Title

      PLOS Genet.

      Volume: 13 Issue: 10 Pages: 1-29

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1007037

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Liverwort life cycle and the miRNAs2018

    • Author(s)
      Masayuki Tsuzuki, Kazutaka Futagami, Takahiro Hamada, Yuichiro Watanabe
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケにおけるmiR319の機能解析2018

    • Author(s)
      二神和敬、都筑正行、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける新規トランスポゾン抑制因子候補TARP4/5の機能解析2018

    • Author(s)
      武井敬仁、塚田道雄、栗原志夫、松井南、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Functional Analysis of miR319 in liverwort, Marchantia polymorpha2017

    • Author(s)
      Kazutaka Futagami, Masayuki Tsuzuki, Takahiro Hamada, Yuichiro Watanabe
    • Organizer
      第19回日本RNA学会年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Analyses of novel tudor-armadilo repeat proteins (TARPs) in Arabidopsis.2017

    • Author(s)
      Michio Tsukada, Takahito Takei, Yuichiro Watanabe, Takahiro Hamada
    • Organizer
      THE PLANT EPIGENETICS CONSORTIUM IN JAPAN-SECOND MEETING
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] TARPs regulate developmental gene expression via siRNA-transposon modules2017

    • Author(s)
      Takahiro Hamada, Michio Tsukada, Takahito Takei, Masayuki Tsuzuki, Yoichiro Fukao, Yukio Kurihara, Minami Matsui, Kentaro Tamura, Ikuko Hara-Nishimura, Yuichiro Watanabe
    • Organizer
      Taiwan-Japan Plant Biology 2017
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functional Analysis of miR319 In Marchantia polymorpha2017

    • Author(s)
      Kazutaka Futagami, Masayuki Tsuzuki, Takahiro Hamada, Yuichiro Watanabe
    • Organizer
      65th NIBB Conference “Renaissance of Marchantia polymorpha ‐the genome and beyond‐
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 植物におけるストレス顆粒形成の観察2016

    • Author(s)
      矢光真子、福澤麻里奈、周郁文、佐藤繭子、亀井保博、柳川由紀、西村いくこ、豊岡公徳、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • Organizer
      第1回Biothermology Workshop - 生命システムの熱科学 -
    • Place of Presentation
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2016-12-10
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Conditions of Stress Granules Assembly in Hot Spring Alga, Cyanidioschyzon merolae.2016

    • Author(s)
      周郁文、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • Organizer
      第1回Biothermology Workshop - 生命システムの熱科学 -
    • Place of Presentation
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2016-12-10
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 陸上植物に保存されたmicroRNAによる発生制御機構2016

    • Author(s)
      都筑正行、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • Organizer
      日本植物学会 第80回大会
    • Place of Presentation
      沖縄カンファレンスセンター(沖縄県宜野湾市)
    • Year and Date
      2016-09-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 免疫電子顕微鏡を用いた植物ストレス顆粒の解析2016

    • Author(s)
      矢光真子、福澤麻里奈、佐藤繭子、亀井保博、柳川由紀、西村いくこ、豊岡公徳、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • Organizer
      日本植物学会 第80回大会
    • Place of Presentation
      沖縄カンファレンスセンター(沖縄県宜野湾市)
    • Year and Date
      2016-09-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA granules network in Arabidopsis2016

    • Author(s)
      濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • Organizer
      第1回RNA顆粒/RNAタンパク質複合体研究会
    • Place of Presentation
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2016-07-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Book] ノンコーディングRNA2016

    • Author(s)
      都筑正行、濱田隆宏、佐藤豊
    • Total Pages
      372
    • Publisher
      化学同人
    • Related Report
      2016 Annual Research Report

URL: 

Published: 2016-04-26   Modified: 2018-12-17  

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