染色体機能ドメイン制御の可塑性とその意義
Publicly Offered Research
| Project Area | Chromosome Orchestration System |
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| Project/Area Number |
16H01405
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Mie University |
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Principal Investigator |
竹林 慎一郎 三重大学, 医学系研究科, 講師 (50392022)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2017)
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| Budget Amount *help |
¥8,450,000 (Direct Cost: ¥6,500,000、Indirect Cost: ¥1,950,000)
Fiscal Year 2017: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2016: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
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| Keywords | 単一細胞 / DNA複製ドメイン / 哺乳類染色体 / 染色体 / 機能ドメイン / DNA複製 / ゲノム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、最近申請者が開発した染色体複製ドメイン構造を単一細胞で、かつゲノムワイドに調べることができる新しい手法(scRepli-seq法）を用いて、これまでアプローチが困難であった個々の細胞レベルでの染色体構造制御を明らかにすることを目指している。最終的には、そのような制御を生み出すメカニズム解明にむけた基盤情報を当該研究分野に提示することを目標としている。本年度は、昨年度に引き続きマウスES細胞および神経前駆細胞からデータを収集した。また、scRepli-seq法のプロトコール改良を進め、SNP情報を利用して単一細胞内の父方と母方由来染色体を区別した解析系や、より低コストで実験を行える系を確立した。さらに収集したデータの解析パイプラインの確立を進めた。染色体ドメイン構造の安定性を定量的に再評価したところ、昨年度に得られた結果（大部分の複製ドメイン構造は個々の細胞レベルで非常に安定に形成されている）に加えて、これまでの解析では気付かなかったドメイン構造制御の特徴が明らかになった。具体的には、１）細胞分化の過程で構造変化を起こす染色体ドメインは、未分化状態の細胞では構造的に不安定な傾向がある、２）この不安定性は、細胞が分化すると消失する、ということが明らかとなった。細胞分化状態と染色体構造制御の関係を示す非常に興味深い結果である。現在、これらの知見を取りまとめて論文として投稿中である。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(20 results)
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[Journal Article] Correlation between Histone Acetylation and Expression of Notch1 in Human Lung Carcinoma and Its Possible Role in Combined Small Cell Lung Carcinoma.2017
Author(s)
Hassan, W., Takebayashi, S. I., Abdalla, M. O., Fujino, K., Kudoh, S., Motooka, Y., Sato, Y., Naito, Y., Higaki, K., Wakimoto, J., Okada, S., Nakao, M., Ishikawa, Y., and Ito, T.
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Journal Title
Lab. Invest.
Volume: 印刷中
Issue: 8
Pages: 913-921
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] The SETD8/PR-Set7 Methyltransferase Functions as a Barrier to Prevent Senescence-Associated Metabolic Remodeling.2017
Author(s)
Tanaka, H., Takebayashi S. I., Sakamoto, A., Igata, T., Nakatsu, Y., Saitoh, N., Hino, S., and Nakao, M.
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Journal Title
Cell Rep.
Volume: 18
Issue: 9
Pages: 2148-2161
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Direct Visualization of DNA Replication Dynamics in Zebrafish Cells. Zebrafish2015
Author(s)
Kuriya, K., Higashiyama, E., Avsar-Ban, E., Tamaru, Y., Ogata, S., Takebayashi, S., Ogata, M., Okumura, K.
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Journal Title
Zebrafish
Volume: 12
Issue: 5
Pages: 432-439
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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