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Study on systemic RNAs that respond to specific environments

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrative system of autonomous environmental signal recognition and memorization for plant plasticity
Project/Area Number 16H01465
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

野田口 理孝  名古屋大学, 高等研究院(農), 助教 (00647927)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥10,400,000 (Direct Cost: ¥8,000,000、Indirect Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2017: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2016: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Keywords長距離シグナル伝達 / 移行性RNA / 接木 / 接ぎ木 / 篩管 / RNA / 環境応答 / 植物 / 分子生理
Outline of Annual Research Achievements

植物が外界からの環境刺激に対し、個体の発生・成長様式を適応させる手段の一つとして篩管を介した長距離シグナリングが知られる。しかし、篩管を介して長距離輸送されるシグナル様分子は多数同定されるものの、その多くは機能未知であり、中でもRNA分子については理解が進んでこなかった。そこで本研究では、全身移行性のRNA分子の機能に迫ることを最終ゴールとして、接木実験により環境要因特異的なRNA分子を同定した。
全身移行性RNAをゲノムワイドに同定するため、マイクログラフティング法によりシロイヌナズナshootとルベラナズナrootの接木を行い、RNA-Seq解析を通してシロイヌナズナshootからルベラナズナrootへ移行するシロイヌナズナ由来のmRNAを同定した。同定は、unique SNPsを指標とする解析パイプラインによって行った。環境要因によって移行性mRNAのプロファイルに変化が現れるかを調べる目的で、栄養欠乏区を用意して、栄養リッチ区と比較試験を行った。その結果、環境要因によって移行性mRNAのプロファイルは大きく変化することが明らかとなり、環境情報が移行性mRNAへと置換されている可能性があるという仮説が改めて支持された。種を越えた現象の保存性を調べるため、トマトでもシロイヌナズナで行った試験と同様の試験を行った。二種の間で移行性mRNAのプロファイルを比較したところ、多くのmRNAが共通して見つり、個体内のmRNAの長距離移行メカニズムは保存された現象であることが示唆された。環境要因特異的な全身移行性RNA分子の個体内におけるダイナミクスを理解するため、RNAアプタマーSpinachを用いたRNA分子の可視システムを構築した。今後は以上の得られた知見をもとに、移行性mRNAが環境情報の伝達物質として働くのか、その機能同定につなげたい。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (38 results)

All 2018 2017 2016

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (35 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 14 results)

  • [Journal Article] The Use of Grafting to Study Systemic Signaling in Plants2017

    • Author(s)
      Michitaka Notaguchi
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 58 Issue: 8 Pages: 1291-1301

    • DOI

      10.1093/pcp/pcx098

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 植物の全身を長距離移行するRNA2017

    • Author(s)
      野田口理孝
    • Journal Title

      BSJ-Review

      Volume: 8 Issue: B Pages: 121-129

    • DOI

      10.24480/bsj-review.8b9.00119

    • ISSN
      2432-9819
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Pollen tube contents initiate ovule enlargement and enhance seed coat development without fertilization.2016

    • Author(s)
      Kasahara R., Notaguchi M., Nagahara S., Suzuki T., Susaki D., Honma Y., Maruyama D., Higashiyama T.
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 2 Issue: 10 Pages: 1-7

    • DOI

      10.1126/sciadv.1600554

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 植物資源に新たな価値をもたらす接木法2018

    • Author(s)
      野田口理孝
    • Organizer
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      野田口理孝
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      野田口理孝
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      野田口理孝
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      Michitaka Notaguchi
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      鹿児島県鹿児島市, 鹿児島大学郡元キャンパス
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      2017-03-16
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      野田口理孝
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      第58回日本植物生理学会年会, 若手の会
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      鹿児島県鹿児島市, 鹿児島大学郡元キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-16
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      野田口理孝
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      第9回アサガオ研究集会
    • Place of Presentation
      愛知県春日井市, 名城大学・春日井キャンパス・農学部附属農場
    • Year and Date
      2017-03-04
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      第6回超異分野学会
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      東京都千代田区, 秋葉原UDX
    • Year and Date
      2017-03-02
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      野田口理孝
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      Michitaka Notaguchi
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      愛知県農業総合試験場講演
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      野田口理孝
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      野田口理孝
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      野田口理孝
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      IGER International Symposium on Long-distance Signaling in Plants
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  • [Presentation] 接ぎ木の技術革新を目指して2017

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  • [Presentation] Interfamily grafting with a variety of vascular plants is achieved by Nicotiana2016

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      Michitaka Notaguchi
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      Cold Spring Harbor Asia Conference, Latest Advances in Plant Development and Environmental Response
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      淡路夢舞台国際会議場
    • Year and Date
      2016-11-29
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  • [Presentation] 異科接木における癒着2016

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      野田口理孝
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      日本植物学会 第80 回大会
    • Place of Presentation
      沖縄県宜野湾市, 沖縄コンベンションセンター
    • Year and Date
      2016-09-16
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  • [Presentation] 篩管を介して長距離移行するRNA2016

    • Author(s)
      野田口理孝
    • Organizer
      日本植物学会 第80 回大会
    • Place of Presentation
      沖縄県宜野湾市, 沖縄コンベンションセンター
    • Year and Date
      2016-09-16
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  • [Presentation] 異科接木における癒着過程の形態学的解析2016

    • Author(s)
      丹羽優樹, 東山哲也, 野田口理孝
    • Organizer
      日本植物学会 第80 回大会
    • Place of Presentation
      沖縄県宜野湾市, 沖縄コンベンションセンター
    • Year and Date
      2016-09-16
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  • [Presentation] タバコ属植物による異科植物間接木2016

    • Author(s)
      丹羽優樹, 野田口理孝
    • Organizer
      第28回 高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • Place of Presentation
      長野県伊那市, 高遠さくらホテル
    • Year and Date
      2016-08-25
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    • Invited
  • [Presentation] Interfamily Grafting with a Variety of Vascular Plants Is Achieved by Nicotiana2016

    • Author(s)
      Michitaka Notaguchi, Yoshikatsu Sato, Tetsuya Higashiyama
    • Organizer
      The Fourth International Conference on Plant Vascular Biology
    • Place of Presentation
      China, Shenzhen, Kylin Villa
    • Year and Date
      2016-07-19
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    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2016-04-26   Modified: 2018-12-17  

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