Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
癌の悪性化には「細胞文脈」や「進化・多様性」が重要な役割を果たす。これまで我々は、腫瘍微小環境が癌の悪性化に関与することを報告してきた。本研究は、癌の「細胞文脈」や「進化・多様性」を規定する腫瘍微小環境のエピゲノム、トランスクリプトーム、メタボローム、リピドーム、リン酸化プロテオームというオミクス解析を統合する数理システムを構築し、さらに、分子生物学的実験で検証することにより、癌悪性化・治療抵抗性の統合的な理解と克服を目的とし解析を行った。本年度の進展状況、及び、新たに得られた知見として、(1)腫瘍微小環境における低酸素・低栄養・低pHという「細胞文脈」において、RNA-Seq、ChIP-Seqを行い低酸素・低栄養・低pHで重要なエピゲノム変化と各コンデイションにおける転写因子群を同定した。本研究では、領域内の連携研究より、低pH状態のがん組織において、コレステロール代謝のマスターレギュレーターである転写因子SREBP2が活性化され、コレステロール合成経路や酢酸代謝経路における一連の酵素群の発現を促進し、腫瘍増殖および患者予後に関与するなどがんの悪性化に寄与することを明らかにし論文報告及びプレスリリースを行なった(Cell Reports, 2017) 。(2)領域内の連携研究により、エピゲノム、とランスクリプトーム、インターラクトーム、メタボロームのオミクス統合解析を発展させて、癌細胞における生理活性代謝物の同定と機能解析を行い、低栄養の癌細胞、癌組織検体で、細胞膜合成経路の律速酵素の抑制により新規のがん代謝物候補を同定し、in vivoのマウス腫瘍増殖、及び、乳がん患者における予後不良に関与することが明らかとなった。このように低酸素下のがん細胞においてがん代謝物が合成されるメカニズムがドライとウエットの融合から明らかになりつつある。
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results, Peer Reviewed: 6 results, Open Access: 5 results, Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 7 results) Book (2 results) Remarks (3 results)
Oncotarget
Volume: 9 Issue: 12 Pages: 10510-10524
10.18632/oncotarget.24063
J Vis Exp.
Volume: 129 Issue: 129
10.3791/56660
Sci Rep
Volume: 7:3855 Issue: 1 Pages: 1-16
10.1038/s41598-017-03994-1
Molecular and Cellular Biology
Volume: 37 Issue: 18
10.1128/mcb.00125-17
Nucleic Acids Research
Volume: 印刷中 Issue: 8 Pages: 4344-4358
10.1093/nar/gkx159
Cell Reports
Volume: 18 Issue: 9 Pages: 2228-2242
10.1016/j.celrep.2017.02.006
http://neosystemscancer.hgc.jp/%E5%85%AC%E5%8B%9F%E7%A0%94%E7%A9%B6/a01-2-16_%E5%A4%A7%E6%BE%A4_%E6%AF%85
http://www.lsbm.org/news/2017/0301.html
http://www.genome.rcast.u-tokyo.ac.jp/wordpress/wp-content/uploads/2017/03/a62d8951728e5cf5ce0382c895756c61.pdf