Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
われわれはこれまでの研究結果(Uchi et al. 2016 PLoS Genet.)から、我々は「腫瘍内遺伝学的不均一性は、大腸癌の成長に伴って常に生み出され続ける。その分布は全体と部分が相似している(fractal)」という仮説を立てた。本研究では、PDXマウスモデル及びLaser Micro dissection(LMD)法を駆使し、次世代シークエンサーによるエキソームシークエンスを行うことで、この仮説を検証した。1)大腸癌の症例集積とPDXマウスモデルの作成:九州大学病院別府病院外科にて手術を行った進行大腸癌症例2例において、摘出後の大腸癌原発巣組織を一部採取し、NOD/SCIDマウスの皮下に腫瘍組織を移植することでPDXマウスモデルを作成した。この際、同時に正常大腸組織の一箇所、大腸癌原発巣組織の複数箇所より組織を採取し冷凍保存した。マウスに移植された腫瘍が増大し、適切な容積となった時点でマウスを安楽死させ、腫瘍を摘出した。この腫瘍を更に別のマウスに移植することを繰り返し、経時的に腫瘍を採取した。1症例目では順調に腫瘍組織の採取を行ったが、2症例目では組織の生着が見られず、実験を中止した。2)DNA抽出と全エキソームシークエンス:1.で得られた正常大腸組織、大腸癌組織及びマウスに移植して得られた大腸癌組織計13検体よりgenomic DNAを抽出し、全エキソームシークエンシングを行った。13検体全てにおいてシークエンスが終了し、現在遺伝子変異について解析を終えた。その結果、継代を経る毎に多様性が失われ、収束していることを明らかにした。
29年度が最終年度であるため、記入しない。
All 2018 2017 2016 2015
All Journal Article (37 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results, Peer Reviewed: 37 results, Open Access: 33 results, Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (23 results) (of which Invited: 6 results)
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