• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

個体モデルを用いた大規模シングルセル解析によるがん組織の要素還元論的な理解

Publicly Offered Research

Project AreaConquering cancer through neo-dimensional systems understanding
Project/Area Number 16H01581
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionNational Cancer Center Japan

Principal Investigator

岡本 康司  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (80342913)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥8,450,000 (Direct Cost: ¥6,500,000、Indirect Cost: ¥1,950,000)
Fiscal Year 2017: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2016: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Keywordsシングルセル解析 / 癌
Outline of Annual Research Achievements

がん微小環境はがん由来の細胞とそれらを取り巻く正常組織由来の細胞により構成されるが、これらの構成細胞はお互いの相互作用による細胞間ネットワークを構築し、がんの発生進展に寄与すると考えられる。従って、がん細胞と非がん細胞の織りなすがん組織の全体像を理解する事は、がんの本質的な治療戦略を構築する上で重要である。
このような細胞間ネットワークを明らかにする目的で、申請者らはマウス動物モデルを用いた発がん過程のシングルセル解析を行った。実験系としては、Apc 変異マウスのDSS炎症大腸発がんモデルを用い、上皮腸管細胞の発がん過程におけるシングルセル解析を行った。解析対象となる遺伝子は、Wntターゲット遺伝子とし、これらの発現の解析をがん組織、および非がん組織で行い、クラスタリング解析、主成分解析とうの統計処理後、両者を比較する事により、がん化に伴い出現する幹細胞性を持った細胞集団の存在を明らかにした。これらの解析により、Wntターゲット遺伝子の発現変動に伴う大腸がん幹細胞の発生機序を明らかにした。さらに、がん細胞のみならず各種の非がん細胞を含めたがん組織全体の大規模シングルセル解析を試行し、その実験条件を確立し、発がん過程における血液系細胞、間質細胞の動態の一端を明らかにした。大規模シングルセルの結果より、がんの発生過程において、血液系細胞、間質細胞の大規模な特性変化が起きている事が明らかになった。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2017 2016

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Heterogeneity among Lgr5-positive colon stem cells2017

    • Author(s)
      Shiokawa D and Okamoto K
    • Journal Title

      Mol. Cell. Oncol.

      Volume: 4 Issue: 4 Pages: e1335271-e1335271

    • DOI

      10.1080/23723556.2017.1335271

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Induction of Selected Wnt Target Genes by Tcf1 Mediates Generation of Tumorigenic Colon Stem Cells2017

    • Author(s)
      Shiokawa D, Sato A, Ohata H, Muto M, Sekine S, Kato M, Shibata T, Nakagama H, Okamoto K.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 19 Issue: 5 Pages: 981

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.04.017

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 卵巣がん幹細胞の鍵シグナル2017

    • Author(s)
      岡本康司
    • Journal Title

      月刊「細胞」

      Volume: 49 Pages: 108-111

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Journal Article] Sox2-dependent inhibition of p21 is associated with poor prognosis of endometrial cancer2017

    • Author(s)
      Yamawaki K, Ishiguro T, Mori Y, Yoshihara K, Suda K, Tamura R, Yamaguchi M, Sekine M, Kashima K, Higuchi M, Fujii M, Okamoto K, Enomoto T
    • Journal Title

      Cancer Sci.

      Volume: 108 Issue: 4 Pages: 632

    • DOI

      10.1111/cas.13196

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Tumor-derived spheroids: class FormattedString { value: Relevance to cancer stem cells and clinical applications }2017

    • Author(s)
      Ishiguro T, Ohata H, Sato A, Yamawaki K, Enomoto T, Okamoto K.
    • Journal Title

      Cancer Sci.

      Volume: 108 Issue: 3 Pages: 283

    • DOI

      10.1111/cas.13155

    • URL

      https://localhost/en/publications/eef7fb2c-fd0d-4541-a89f-9f16a203d42e

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] TNIK inhibition abrogates colorectal cancer stemness2016

    • Author(s)
      Masuda M, Uno Y, Ohbayashi N, Ohata H, Mimata A, Kukimoto-Niino M, Moriyama H, Kashimoto S, Inoue T, Goto N, Okamoto K, Shirouzu M, Sawa M, Yamada T.
    • Journal Title

      Nature Comm.

      Volume: 7 Issue: 1 Pages: 12586-12586

    • DOI

      10.1038/ncomms12586

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] シングルセル発現解析による大腸がん組織多様性の理解2017

    • Author(s)
      岡本康司
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 大腸がん幹細胞性の進展メカニズム2017

    • Author(s)
      岡本康司
    • Organizer
      第48回高松宮妃癌研究基金国際シンポジウム
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] スフェロイド形成による難治がん由来がん幹細胞の培養と特性解析2016

    • Author(s)
      岡本康司
    • Organizer
      第39 回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2016-04-26   Modified: 2018-12-17  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi