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Risk Assessment of development disorder using spatiotemporal statistical shape model

Publicly Offered Research

Project AreaMultidisciplinary computational anatomy and its application to highly intelligent diagnosis and therapy
Project/Area Number 17H05304
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

小橋 昌司  兵庫県立大学, 工学研究科, 教授 (00332966)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2018: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2017: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords新生児 / MRI画像 / 医用画像解析 / 深層学習 / 時空間統計的形状モデル / 脳疾患 / 発達障害 / 発症リスク / 機械学習 / MR画像 / 発症予測 / 計算機診断支援 / 画像診断
Outline of Annual Research Achievements

新生児期において,脳はその大きさ,形,また形態は成長時点により大きく変化する.脳発達に伴う正常な脳形状の変形を理解し,脳疾患に起因する微小な脳形状変形を検出することで,脳疾患を早期に発見できる.特に小児期の脳疾患は,より早期の治療,療育が症状の低減に有効であることが知られている.また,MRI画像での診断は,問診等に依らないため,新生児期から適用可能である.しかし,これまで新生児期を対象とした脳MRI画像診断支援に関する研究はほとんど行われていない.
本研究では,新生児脳疾患診断支援システムを構築するため,畳み込みニューラルネットワークに基づく3次元脳MR画像からの全脳領域抽出法を提案した.特に成人脳MR画像を事前学習する転移学習法により精度向上を図る.さらに,正常な脳発達に伴う脳形状変形をモデル化するため,統計的に個人間変動をモデル化した時空間統計的形状モデル(stSSM; spatiotemporal statistical shape model)を提案した.同stSSMを用いることで,新生児脳形状の静的形状パラメータの抽出,さらに成長に伴うパラメータ変動の抽出を行う.これら抽出パラメータを用い,機械学習によるクラス識別問題とすることで,新生児脳MR画像からの脳疾患検出法を提案した.
提案法を修正齢-5日から730日の新生児脳MR画像に適用した結果をダイス形式で評価すると,学習データに対しては0.958,評価データに対しては0.919であった.また転移学習無しの手法では,それぞれ0.919,0.838であり,提案法の有効性が示された.また,時空間統計的形状モデルにおいては,カルマンフィルタを導入することで,時間連続したモデル構築を可能とした.

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2019 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 国際経営農業技術大学(バングラデシュ)

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] IUBAT(Bangladesh)

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Journal Article] 新生児脳の成長統計形状モデル構築による子どもの発達障害発症リスク評価2019

    • Author(s)
      盛田 健人, 小橋 昌司
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 12 Pages: 666-669

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Journal Article] Spatiotemporal Statistical Shape Model for Temporal Shape Change Analysis of Adult Brain2018

    • Author(s)
      Binte Alam Saadia、Nii Manabu、Shimizu Akinobu、Kobashi Syoji
    • Journal Title

      Current Medical Imaging Reviews

      Volume: 15 Issue: 5 Pages: 1-10

    • DOI

      10.2174/1573405615666181120141147

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Disorder Development Onset Prediction Based on Spatiotemporal Statistical Shape Model2018

    • Author(s)
      Alam Saadia Binte、Shimizu Akinobu、Ando Kumiko、Ishikura Reiichi、Kobashi Syoji
    • Journal Title

      2018 IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics (SMC)

      Volume: 1 Pages: 385-390

    • DOI

      10.1109/smc.2018.00075

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Neonatal Brain development characterization using spatio-temporal statistical shape model2018

    • Author(s)
      S. Kobashi
    • Organizer
      Genesis Workshop in Spokane
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      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Soft Computing and artificial intelligence in medical image analysis2018

    • Author(s)
      S. Kobashi
    • Organizer
      World Automation Congress
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      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Neonatal Brain Development Modeling Using Brain MR images2018

    • Author(s)
      S. Kobashi
    • Organizer
      Joint 2018 7th International Conference on Informatics, Electronics & Vision (ICIEV) & 2nd International Conference on Imaging, Vision & Pattern Recognition (icIVPR)
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 時間連続性を考慮した新生児脳時空間統計的形状モデルの構築2018

    • Author(s)
      盛田健人, アラム サーディア ビンテ, 新居 学, 若田ゆき, 安藤久美子, 石藏礼一, 清水昭伸, 小橋昌司
    • Organizer
      メディカルイメージング連合フォーラム
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Machine learning with 3D spatio-temporal SSM for Alzheimer's disease patient classification2017

    • Author(s)
      S. Alam, M. Nii, A. Shimizu, and S. Kobashi
    • Organizer
      31st International Congress and Exhibition on Computer Assisted Radiology and Surgery
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Medical image analysis with machine learning techniques2017

    • Author(s)
      S. Kobashi
    • Organizer
      Student Conference on Science & Engineering,
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] Non-Invasive Diagnostic Methods2018

    • Author(s)
      Binte Alam Saadia、Kobashi Syoji
    • Total Pages
      12
    • Publisher
      IntechOpen
    • ISBN
      9781789848458
    • Related Report
      2018 Annual Research Report

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Published: 2017-04-28   Modified: 2019-12-27  

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