Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
植物のnon-coding RNA研究は、個々のnon-coding RNAの生理機能が解明されつつあるが、植物のゲノムワイドな非コードゲノム領域の機能と存在意義に関する知見は極めて乏しい。本研究では、減数分裂前の生殖初期に特異的に発現する700種以上の生殖lincRNAs (large intergenic non-coding RNA)とmicroRNA2118 (miR2118) の機能と制御機構を解析し、植物生殖細胞発生の分子メカニズム解明を目指す。これら生殖lincRNAには、miR2118が認識する22塩基長の共通配列が存在する。生殖lincRNAsは、miR2118切断を介して、21塩基間隔にプロセシングされ、21塩基のフェーズを示すphased small interfering RNA (phasiRNAs) が生成される。これら21塩基のphasiRNAは、イネの生殖細胞特異的に働くArgonauteタンパク質と結合することを明らかにしている (Komiya et al., Plant J 2014)。本年度は、phasiRNA生成に重要なmiR2118変異イネを用いたsmall RNA シーケンス、生殖lincRNA シーケンス、及び、ゲノムシーケンスを行い、変異部位の同定、及び、変異によるphasiRNA生成/生殖lincRNAの発現への影響を明らかにした。さらに、プロテオーム解析を行い総体的なタンパク質の発現変動を解析した。変異体解析、トランスクリプトーム、及び、プロテオームの融合により、生殖で機能する新たな候補因子、及び、有用領域を絞り込んだ。本年度は、国際学会、及び、国内学会で本研究内容を報告した。また、本研究の論文投稿に向けて現在準備を進めている。
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
All 2018 2017 Other
All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results, Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Remarks (1 results)
Biomedical Sciences
Volume: 4 Issue: 2 Pages: 18-23
10.11648/j.bs.20180402.11
生物工学
Volume: 96 Pages: 349-349
https://groups.oist.jp/ja/stg/reina-komiya-phd