Reproductive system of lincRNA/miR2118/phasiRNA in plant
Publicly Offered Research
| Project Area | Neo-taxonomy of noncoding RNAs |
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| Project/Area Number |
17H05608
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University |
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Principal Investigator |
小宮 怜奈 沖縄科学技術大学院大学, サイエンステクノロジーグループ, サイエンス・テクノロジー アソシエート (独立研究員) (90631416)
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| Project Period (FY) |
2017-06-30 – 2019-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2018)
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| Budget Amount *help |
¥8,060,000 (Direct Cost: ¥6,200,000、Indirect Cost: ¥1,860,000)
Fiscal Year 2018: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2017: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
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| Keywords | 生殖 / non-coding RNA / miRNA / small RNA / イネ / microRNA / 植物 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
植物のnon-coding RNA研究は、個々のnon-coding RNAの生理機能が解明されつつあるが、植物のゲノムワイドな非コードゲノム領域の機能と存在意義に関する知見は極めて乏しい。
本研究では、減数分裂前の生殖初期に特異的に発現する700種以上の生殖lincRNAs (large intergenic non-coding RNA)とmicroRNA2118 (miR2118) の機能と制御機構を解析し、植物生殖細胞発生の分子メカニズム解明を目指す。これら生殖lincRNAには、miR2118が認識する22塩基長の共通配列が存在する。生殖lincRNAsは、miR2118切断を介して、21塩基間隔にプロセシングされ、21塩基のフェーズを示すphased small interfering RNA (phasiRNAs) が生成される。これら21塩基のphasiRNAは、イネの生殖細胞特異的に働くArgonauteタンパク質と結合することを明らかにしている (Komiya et al., Plant J 2014)。
本年度は、phasiRNA生成に重要なmiR2118変異イネを用いたsmall RNA シーケンス、生殖lincRNA シーケンス、及び、ゲノムシーケンスを行い、変異部位の同定、及び、変異によるphasiRNA生成/生殖lincRNAの発現への影響を明らかにした。さらに、プロテオーム解析を行い総体的なタンパク質の発現変動を解析した。変異体解析、トランスクリプトーム、及び、プロテオームの融合により、生殖で機能する新たな候補因子、及び、有用領域を絞り込んだ。本年度は、国際学会、及び、国内学会で本研究内容を報告した。また、本研究の論文投稿に向けて現在準備を進めている。
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(10 results)
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[Journal Article] Multiplicity in Long Noncoding RNA Biomedical Sciences2018
Author(s)
3.R. Kurokawa, R. Komiya, T. Oyoshi, Y. Matsuno, H. Tani, M. Katahira, K. Hitachi, Y. Iwashita, T. Yamashita, K. Kondo, R. Yoneda, Y. Yamaoki, N. Ueda, T. Mashima, N. Kobayashi, T. Nagata, A. Kiyoishi, M. Miyake, F. Kano, M. Murata1, N. Hamad, K. Sasaki, N. Shoji
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Journal Title
Biomedical Sciences
Volume: 4
Issue: 2
Pages: 18-23
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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