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山火事の熱と煙で目覚めるアカパンカビ子嚢胞子のシグナル伝達経路網

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrative understanding of biological signaling networks based on mathematical science
Project/Area Number 17H05998
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionUniversity of Fukui

Principal Investigator

本田 信治  福井大学, 学術研究院医学系部門, 助教 (90632167)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Fiscal Year 2018: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2017: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Keywords応用微生物学 / 菌類
Outline of Annual Research Achievements

アカパンカビ子嚢胞子は山火事で発生した約50℃を超える熱、もしくは煙成分を感知して休眠解除する。前年度、熱と煙感知の関係を詳細に調べた結果、煙成分は濃度依存的に休眠解除の温度閾値を下げることを見出した。領域内の共同研究により、この子嚢胞子の熱と煙成分による発芽率の数理モデル化を試みた。まず、熱と煙成分による発芽と生存確率(高熱と高濃度の煙成分は生存に悪影響)を独立させた数理モデル化では、煙成分が濃度依存的に発芽の温度閾値を下げる現象を表現できなかった以外は、実測値に近似した。つまり、この現象を正確に表現するには煙成分と温度センサーを繋ぐシグナル伝達経路を加えた数理モデル化が最低限必要であることがわかった。今後は、本研究グループが同定した温度センサーを調節する2つのシグナル伝達経路を加えた数理モデル化により本現象を忠実にシミュレーションできるか、他の経路が必要かなどを検討する。
これまでの一連のシグナル伝達経路の因子群の同定は大規模な逆遺伝学手法により行ってきたが、それぞれの経路の標的・相互作用の解析は進んでいない。その理由として、従来の生化学手法がアカパンカビ子嚢胞子の細胞壁が強固であるため適さないためである。そこで、最新の手法である生体内ビオチン化ラベルによる標的蛋白質の探索・相互作用を調べるBioID、BioID2、TurboIDに着目し、アカパンカビに導入した。その結果、TurboIDのみが目的蛋白質のビオチン化の検出に成功した。しかし、内因性のビオチン化蛋白質が無視できない量で存在するため、現在、この内因性ビオチン化酵素の発現を抑える変異株の作製を行っている。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2018 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] ASH1-catalyzed H3K36 methylation drives gene repression and marks H3K27me2/3-competent chromatin2018

    • Author(s)
      Bicocca Vincent T、Ormsby Tereza、Adhvaryu Keyur K、Honda Shinji、Selker Eric U
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 7

    • DOI

      10.7554/elife.41497

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Nucleosome Positioning by an Evolutionarily Conserved Chromatin Remodeler Prevents Aberrant DNA Methylation in Neurospora2018

    • Author(s)
      Klocko Andrew D.、Uesaka Miki、Ormsby Tereza、Rountree Michael R.、Wiles Elizabeth T.、Adhvaryu Keyur K.、Honda Shinji、Selker Eric U.
    • Journal Title

      Genetics

      Volume: 211 Issue: 2 Pages: 563-578

    • DOI

      10.1534/genetics.118.301711

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Telomere repeats induce domains of H3K27 methylation in Neurospora2018

    • Author(s)
      Jamieson Kirsty、McNaught Kevin J、Ormsby Tereza、Leggett Neena A、Honda Shinji、Selker Eric U
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 7

    • DOI

      10.7554/elife.31216

    • NAID

      120006488715

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ascospore sleepless-1 and -2 are required for ascospore dormancy in Neurospora crassa2018

    • Author(s)
      Uesaka M, Yokoyama A and Honda S
    • Organizer
      Neurospore meeting
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 福井大学学術研究院医学系染色体機能学

    • URL

      https://www.med.u-fukui.ac.jp/laboratory/chromosome/

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Remarks] 福井大学 医学部医学科 染色体機能学

    • URL

      http://www-n.med.u-fukui.ac.jp/laboratory/chromosome/

    • Related Report
      2017 Annual Research Report

URL: 

Published: 2017-04-28   Modified: 2019-12-27  

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