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組織夾雑系の理解を目的としたケミカルプローブの設計戦略

Publicly Offered Research

Project AreaChemical Approaches for Miscellaneous / Crowding Live Systems
Project/Area Number 18H04543
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

田井中 一貴  新潟大学, 脳研究所, 教授 (80506113)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2018: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywordsケミカルプローブ / 組織夾雑 / 3Dイメージング / 組織透明化
Outline of Annual Research Achievements

ヒトの脳組織は、神経細胞やグリア細胞、血管や軸索など、多様な構成因子が複雑に絡み合い、共同的に機能を発揮していることから、生命科学において最も夾雑性の高い標本と言えよう。本研究では、かように夾雑なヒト脳のシステムを、従来の2次元平面画像ではなく、立体のまま全てを観察する3次元イメージングにより紐解くケミカルプローブの開発を目的とする。
ヒト脳を高度に透明化するための透明化プロトコールの開発に取り組んだ。その結果、1.組織の内在的因子を保存したままの高度な脱脂手法、2.透明化時に生じる組織の褐変およびリポフスチンなどの強度な自家蛍光の効率的な抑制手法を開発することに成功した。脂質除去のための界面活性剤の網羅的スクリーニングを実施した結果、アルキル鎖の最も短い1,2-Hexanediolが既存の界面活性剤の中で、組織の損傷を伴わない最も高効率な脱脂剤であることを明らかにした。広く透明化で使用される界面活性剤SDSに比べて100-1000倍以上高速に脱脂可能な透明化プロトコールを確立した(Inoue et al., Bioorg Med Chem Lett, 2019)。また、種々の酸化・還元反応を探索した結果、過酸化水素や種々の還元剤が高効率に組織の漂白および自家蛍光の消光を伴うことを明らかにした。更に、これらの酸化・還元反応は組織内の化学組成に変化をもたらし、ケミカルプローブの染色性の多様性をもたらすことが分かった。脳研究所の潤沢な剖検サンプルを活用し、ヒト脳透明化標本に適用可能なケミカルプローブの網羅的探索を行った結果、3.30種以上の特徴的な染色性を示すケミカルプローブを発見した。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2020 2019 2018

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 8 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Rapid chemical clearing of white matter in the post-mortem human brain by 1,2-hexanediol delipidation.2019

    • Author(s)
      Inoue M, Saito R, Kakita A, Tainaka K.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 29 Issue: 15 Pages: 1886-1890

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2019.05.049

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemical Landscape for Tissue Clearing Based on Hydrophilic Reagents.2018

    • Author(s)
      Tainaka K, Murakami TC, Susaki EA, Shimizu C, Saito R, Takahashi K, Hayashi-Takagi A, Sekiya H, Arima Y, Nojima S, Ikemura M, Ushiku T, Shimizu Y, Murakami M, Tanaka KF, Iino M, Kasai H, Sasaoka T, Kobayashi K, Miyazono K, Morii E, Isa T, Fukayama M, Kakita A, Ueda HR.
    • Journal Title

      Cell Rep.

      Volume: 24 Issue: 8 Pages: 2196-2210

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2018.07.056

    • NAID

      120006542018

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] CUBIC: Whole-brain/body imaging with single-cell resolution using hydrophilic chemical cocktails2019

    • Author(s)
      Kazuki Tainaka
    • Organizer
      International Symposium of Biofunctional Chemistry
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] CUBIC:生体組織透明化による包括的3Dイメージング技術2019

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      新潟医学会特別講演
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CUBIC: 組織透明化技術による3Dイメージング2019

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第60回新潟生化学懇話会プログラム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 3D 神経病理学に向けたホールマウント染色手法の開発2019

    • Author(s)
      田井中 一貴・齋藤 理恵・井上 雅文・柿田 明美
    • Organizer
      第60回日本神経病理学会総会学術研究会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Comprehensive 3D Imaging by Tissue Clearing Technique CUBIC2019

    • Author(s)
      Kazuki Tainaka
    • Organizer
      Neuro2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 組織透明化による3D神経病理学2019

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第16回 日本病理学会カンファレンス
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CUBIC: Whole-organ, whole-body imaging with single-cell resolution using chemical cocktails2019

    • Author(s)
      Kazuki Tainaka
    • Organizer
      リエゾンラボ炎症シンポジウムin北海道大学
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 有機化学が拓く次世代3D組織化学2019

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第5回 北海道大学部局横断シンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CUBIC: Whole-brain/body imaging with single-cell resolution using hydrophilic chemical cocktails2019

    • Author(s)
      Kazuki Tainaka
    • Organizer
      BRI The 9th international symposium
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 組織透明化技術CUBICによる3D神経病理学2018

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第13回年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 組織透明化技術CUBICによる3D神経病理学2018

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第107回日本病理学会総会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 水溶性試薬による組織透明化の化学2018

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第12回バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of 3D neuropathology based on tissue clearing technique2018

    • Author(s)
      Kazuki Tainaka, Rie Saito, Akiyoshi Kakita
    • Organizer
      ICN2018, 19th International Congress of Neuropathology
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 『病理と臨床』2020年3月号 組織・細胞の透明化2020

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Total Pages
      4
    • Publisher
      文光堂
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Book] 『ぶんせき』2019年10号 入門講座 組織透明化技術と蛍光顕微鏡 3D イメージング2019

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      公益社団法人 日本分析化学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2018-04-23   Modified: 2021-01-27  

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