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緑膿菌選択的化学コミュニケーション分子の機能解明と創薬シーズへの展開

Publicly Offered Research

Project AreaFrontier research of chemical communications
Project/Area Number 18H04599
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

市川 聡  北海道大学, 薬学研究院, 教授 (60333621)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2018: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords緑膿菌 / 抗菌剤 / 天然物 / 抗菌薬 / 薬剤耐性 / 薬剤耐性緑膿菌 / ヌクレオシド系抗生物質 / 有機化学 / 創薬化学
Outline of Annual Research Achievements

ムレイドマイシンAの誘導体である3’-ヒドロキシムレイドマイシンAが、抗菌活性を発現するうえでの標的酵素であるMraYを強力に阻害し(IC50 3.2 nM)、様々な臨床分離株、セロタイプ、多剤耐性株に対して広く抗緑膿菌活性(MIC 8~128 ug/mL)を示す事を明らかにした。ムレイドマイシンの緑膿菌選択的な抗菌活性は、緑膿菌が有する特有なトランスポーターによって選択的に取り込まれている事を示唆する。そこで、3’-ヒドロキシムレイドマイシンAの長期暴露によって取得した耐性菌の全ゲノムシークエンス解析による遺伝学的手法により、オリゴペプチドトランスポーターとして知られているNppA1A2BCDがムレイドマイシン選択的なトランスポーターである事を同定した。NppA1A2BCDは、緑膿菌特異的に発現しているトランスポーターであり、このことは、ムレイドマイシンが緑膿菌選択的に抗菌活性を示す事と大きく一致する。さらに、国外連携研究者(米国Duke大学、Seok-Yong Lee准教授)との共同研究により、Aquifex aeolicus由来MraYと3’-ヒドロキシムレイドマイシンAを含むヌクレオシド系天然物群(カルバカプラザマイシン、カプラマイシン)との網羅的な複合体とのX線結晶構造解析に成功した。本成果により、MraYの構造に基づいた論理的な薬物設計が可能となり、例えばウレア部をスクアラミドへ変換した単純化誘導体(IC50 3.2 nM)を設計・合成する事ができた。また、ムレイドマイシンと同様に強力なMraY阻害活性を有するツニカマイシンに関する構造活性相関研究も行った。その結果、ウリジン部は活性に必須であるが、長鎖脂肪酸、N-アセチルグルコサミン部は活性発現に重要ではあるものの、変換可能である事がわかった。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] Duke University(米国)

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Journal Article] Chemical logic of MraY inhibition by antibacterial nucleoside natural products2019

    • Author(s)
      Ellene H. Mashalidis, Benjamin Kaeser, Yuma Terasawa, Akira Katsuyama, Do-Yeon Kwon, Kiyoun Lee, Jiyong Hong, Satoshi Ichikawa, Seok-Yong Lee
    • Journal Title

      Nat. Commun.

      Volume: 10 Pages: 2917-2917

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural requirement of tunicamycin V for MraY inhibition2019

    • Author(s)
      Kazuki Yamamoto, Akira Katsuyama, Satoshi Ichikawa
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 27 Issue: 8 Pages: 714-1719

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2019.02.035

    • Related Report
      2019 Annual Research Report 2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tunicamycin: Chemical synthesis and biosynthesis2019

    • Author(s)
      Yamamoto Kazuki; Ichikawa Satoshi
    • Journal Title

      J. Antibiot.

      Volume: 72 Pages: 924-933

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] スファエリミシン類コア骨格の合成研究2019

    • Author(s)
      引地祐太、仲谷岳志、市川 聡
    • Organizer
      日本薬学会北海道支部第 146 回例会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Tunicamycin V の全合成と構造に基づいたMraY 選択的阻害剤への変換2018

    • Author(s)
      山本 一貴、市川 聡
    • Organizer
      第60回天然有機化合物討論会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Tunicamycin Vの全合成2018

    • Author(s)
      山本 一貴、薬師寺 文華、市川 聡
    • Organizer
      第28回万有福岡シンポジウム
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Nucleoside Natural Products Inhibiting Bacterial Cell Wall Biosynthesis -Chemistry and Biology-2018

    • Author(s)
      Satoshi Ichikawa
    • Organizer
      6th SNU Joint Symposium
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2021-01-27  

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