ヒト褐色脂肪組織活性の遺伝学研究
Publicly Offered Research
Project Area | Integrative understanding of biological phenomena with temperature as a key theme |
Project/Area Number |
18H04687
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
中山 一大 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (90433581)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2020-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2019)
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Budget Amount *help |
¥10,010,000 (Direct Cost: ¥7,700,000、Indirect Cost: ¥2,310,000)
Fiscal Year 2019: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2018: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
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Keywords | 褐色脂肪組織 / SNP / ゲノムワイド関連解析 / 一塩基多型 / 寒冷適応 / 熱産生 / ヒト / 遺伝的多様性 |
Outline of Annual Research Achievements |
ヒトにおける重要な熱産生組織の一つである褐色脂肪組織の活性に相関するゲノム領域を同定するべく、北海道在住の成人男女を対象に、フッ素同位体標識グルコース投与と陽電子放出断層撮影-コンピューター断層撮影法による褐色脂肪組織活性の測定とゲノム試料の収集を実施した。Axiom ジャポニカアレイをもちいて約66万座位のSNPの遺伝型を判定し、さらに、東北メディカルメガバンク機構のスーパーコンピューターをもちいたインピュテーション解析(実験的に遺伝型判定をしていない多型部位の遺伝型情報を、多人数の全ゲノム塩基配列を参照して復元する手法)を実施した。これまでに、およそ360名分のジャポニカアレイ解析およびインピュテーションが完了しており、これらデータを用いたゲノムワイド関連解析では、12番染色体上にゲノムワイド関連解析における有意水準をクリアしたSNPを検出できた。このSNPについて、近傍のいくつかの遺伝子の発現量への影響をバイオインフォマティクスの手法を用いて推定するとともに、九州大学で構築した人工気候室実験による寒冷曝露実験コホート(日本人成人約50名)を用いて、寒冷曝露時における生理反応への影響を検証している。さらに、ゲノムワイド関連解析で得られた証拠をさらに強固なものにするべく、赤外線カメラをもちいた皮膚温測定による褐色脂肪組織活性の検出実験とゲノム試料収集による追加コホートの構築を開始した。
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Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Associations of erythrocyte fatty acid compositions with FADS1 gene polymorphism in Japanese mothers and infants.2020
Author(s)
Nita R, Kawabata T, Kagawa Y, Nakayama K, Yanagisawa Y, Iwamoto S, Kimura F, Miyazawa T, Tatsuta N, Arima T, Yaegashi N, Nakai K.
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Journal Title
Prostaglandins, Leukotrienes and Essential Fatty Acids
Volume: 152
Pages: 102031-102031
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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