• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Elucidation and Theoretical Application of the Temperature Sensing Mechanism of Proton Channel

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrative understanding of biological phenomena with temperature as a key theme
Project/Area Number 18H04697
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionKagawa University

Principal Investigator

藤原 祐一郎  香川大学, 医学部, 教授 (20532980)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥10,010,000 (Direct Cost: ¥7,700,000、Indirect Cost: ¥2,310,000)
Fiscal Year 2019: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2018: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Keywordsイオンチャネル / 温度センサー / 温度感受性イオンチャネル / 電位依存性チャネル / プロトンチャネル / ゲーティング
Outline of Annual Research Achievements

Hvチャネルの温度特性を解析する。その高い温度依存性を生み出す分子機構を明らかにし、電位依存性チャネルスーパーファミリーに普遍的に通用する温度センシング機構を解明することを目指し、タンパク質の構造-機能-物性を「温度という共通のパラメター」を基軸として解析を行なった。計算科学を用い理論と実験の両側面からチャネルタンパク質を解析し、各パラメターの有機的なつながりを検討した。
1) Hvチャネルの温度感知機構の電気生理学的解析と蛋白質化学的解析結果を融合させ、温度感知機構の理論構築を行った。作成した変異体にも適合するか実験的に検証を行った。
2) 分子動力学解析:Hvチャネルの結晶構造を用いて温度を変えたシミュレーションを行った。温度依存性ドメインの局所的センサー機能が膜貫通領域に伝わりチャネルの開閉を制御する機構を理解するために、膜貫通領域も付加したfull-lengthのチャネルを用いてシミュレーションを行った。
3)他の温度センシングチャネルへのアイデアの展開
Hvチャネルは最小単位の分子構成からなり、他の分子たとえば電位依存性チャネルスーパーファミリー(TRPチャネルも含まれる)の電位センサードメインと構造類似性が高いため、Hv研究で得られる知見の応用が期待される。TRPチャネルにHvチャネルから得られたアイデアで変異を導入し、温度特性を変化させることが出来るかを電気生理学的に解析した。温度依存性のほとんど無い他の電位センサー分子に変異を導入し温度感知機構をもたらすことが出来るか試みた。実験で用いたチャネルに対して、構造情報を基に温度センシング機構を考察した。領域内共同研究を通じて、他種動物の温度感受性チャネルの解析と解析手法の応用を応用を試みた。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2021 2020 2019 2018 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 3 results) Book (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The mechanoreceptor DEG-1 regulates cold tolerance in Caenorhabditis elegans2020

    • Author(s)
      Takagaki N., Ohta A., Ohnishi K., Kawanabe A., Minakuchi Y., Toyoda A., Fujiwara Y., Kuhara A.
    • Journal Title

      EMBO reports

      Volume: 21 Issue: 3 Pages: 1-14

    • DOI

      10.15252/embr.201948671

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural Basis for the Membrane Association of Ankyrin2018

    • Author(s)
      藤原 祐一郎, 近藤 寛子, 城田 松之, 木下 賢吾
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 58 Issue: 3 Pages: 152-154

    • DOI

      10.2142/biophys.58.152

    • NAID

      130007378614

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Structural and molecular basis of Na+/D-glucose co-transporters hexose specificity2020

    • Author(s)
      Kazuyo Kamitori, Yuichiro Fujiwara
    • Organizer
      第97回日本生理学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 電位依存性プロトンチャネルの細胞内側からの制御  Intracellular regulation of the voltage-gated proton channel.2020

    • Author(s)
      川鍋陽、藤原祐一郎
    • Organizer
      第58回日本生物物理学会年会、群馬
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Sugar specificity and structural analyses of Na+/D-glucose co-transporters Could rare sugars be transported via SGLTs?2019

    • Author(s)
      Kazuyo Kamitori, Yuichiro Fujiwara
    • Organizer
      7th International Sciety of Rare Sugars
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 電位依存性プロトンチャネルがpHと膜電位を感じる機構2019

    • Author(s)
      藤原 祐一郎
    • Organizer
      第11回日本生物物理学会 中国四国支部大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] What is the pH-gradient Sensing in the Voltage- Gated H+ Channel?2019

    • Author(s)
      藤原祐一郎
    • Organizer
      第9回アジアオセアニア生理学会(第96回日本生理学会合同大会)
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Toward the understanding of hexose specificity of Na+ D-glucose cotransporters SGLT1 and SGLT22019

    • Author(s)
      神鳥和代、藤原祐一郎
    • Organizer
      第9回アジアオセアニア生理学会(第96回日本生理学会合同大会)
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ion Permeation of Voltage Sensor and its Foundation Structure2019

    • Author(s)
      片木絢子、藤原祐一郎
    • Organizer
      第9回アジアオセアニア生理学会(第96回日本生理学会合同大会)
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 電位依存性H+チャネルの電気的・化学的勾配センシング機構2018

    • Author(s)
      藤原祐一郎
    • Organizer
      蛋白研研究会「構造情報に基づいた膜イオン輸送タンパク質の 生理機能の解明に向けて」
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Book] 温度を基軸とした生命現象の統合的理解(温度生物学)報告書2021

    • Author(s)
      藤原 祐一郎(担当:分担執筆, 範囲:電位依存性チャネルタンパク質の温度センシング機構の解明, p61-63)
    • Total Pages
      514
    • Publisher
      新学術領域温度生物学事務局
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Book] 温度を基軸とした生命現象の統合的理解(温度生物学)Newsletter No.72020

    • Author(s)
      藤原 祐一郎(担当:分担執筆, 範囲:プロトンチャネルの温度感知機構の解明と理論応用(p14))
    • Total Pages
      56
    • Publisher
      新学術領域温度生物学事務局
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Book] 温度を基軸とした生命現象の統合的理解(温度生物学)Newsletter No.62019

    • Author(s)
      藤原 祐一郎(担当:分担執筆, 範囲:本領域の活動 アウトリーチ活動報告(p26))
    • Total Pages
      40
    • Publisher
      新学術領域温度生物学事務局
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 温度生物学トピックス「TRPV1の熱活性はポアドメインに備わっている。」

    • URL

      http://www.nips.ac.jp/thermalbio/report/report2018_01.html

    • Related Report
      2018 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi