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一分子再構成系を用いた染色分体間接着マシナリーの理解

Publicly Offered Research

Project AreaChromosome Orchestration System
Project/Area Number 18H04711
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

西山 朋子  名古屋大学, 理学研究科, 准教授 (90615535)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥8,320,000 (Direct Cost: ¥6,400,000、Indirect Cost: ¥1,920,000)
Fiscal Year 2019: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2018: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Keywordsコヒーシン / ゲノム高次構造 / 染色分体間接着 / 一分子解析系 / 姉妹染色分体間接着
Outline of Annual Research Achievements

姉妹染色分体間接着に必須のコヒーシンは、真核生物の間で高度に保存されたリング状のタンパク質複合体であり、近年では、接着のみならず、高次クロマチン構造制御においても重要な因子として注目されている。本研究では、コヒーシンがどのようにしてクロマチン高次構造を形成するのか、その接着機能との違いを明らかにするため、DNA高次構造形成の仕組みを一分子レベルで明らかにすることを目指した。
本年度は、前年度に構築したDNAループ形状一分子解析系を用い、コヒーシン複合体依存的なDNAループの形状変化解析を行った。ヒトコヒーシン複合体は、遺伝子を昆虫細胞Sf21に導入・発現・精製し、コヒーシンScc1サブユニットに付加したHaloタグにAlexa488を共有結合させることでコヒーシン複合体を蛍光標識した。コヒーシンのDNAへのローディングに必要なNIPBL-Mau2複合体についても、Sf21細胞にて発現精製をおこなった。これらの精製複合体を一分子DNA観察系に導入したところ、NIPBL-Mau2およびATP依存的に、50kb長のlambda DNAがループを形成する様子を観察することに成功した。より詳細にコヒーシンの構造とループ形成機能の関係を明らかにするため、ATPの加水分解に伴うSmcリングの開放を強制的に抑止するヘッドドメイン結合型コヒーシン複合体を作製したところ、この変異体ではループ形成頻度が顕著に減少し、ATP加水分解だけでなく、ヘッドドメイインの解離がループ形成に必須であることが明らかになった。
計画班01(平野班)との共同研究により、同様の解析をコンデンシン複合体でも行い、哺乳動物コンデンシンに依存したDNAループ形成の観察に成功している。今後、変異体の解析を進める予定である。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2019 2018

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Compartments in the Ring2019

    • Author(s)
      Nishiyama Tomoko
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 75 Issue: 2 Pages: 201-203

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2019.07.002

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Journal Article] Cohesion and cohesin-dependent chromatin organization2019

    • Author(s)
      Nishiyama Tomoko
    • Journal Title

      Current Opinion in Cell Biology

      Volume: 印刷中 Pages: 8-14

    • DOI

      10.1016/j.ceb.2018.11.006

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] コヒーシンの構造とゲノム機能2019

    • Author(s)
      西山 朋子
    • Organizer
      国立遺伝学研究所研究会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Impacts of cohesin ring conformation on the translocation and DNA replication2019

    • Author(s)
      Tomoko Nihsiyama
    • Organizer
      EMBO workshop Smc proteins
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Dynamics of cohesin at single-molecule resolution reveals cohesin-dependent chromatin structure2019

    • Author(s)
      Tomoko Nihsiyama
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Understanding cohesin dependent structural organization of DNA in single molecule resolution2019

    • Author(s)
      Tomoko Nihsiyama
    • Organizer
      Chromosome Dynamics 2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Observation of single-cohesin molecules reveals cohesin-dependent alteration of DNA structure2018

    • Author(s)
      Tomoko Nishiyama
    • Organizer
      EMBL Symposia "Principles of Chromosome Structure and Function"
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 教科書を書き換えろ!染色体の新常識 第3章-32018

    • Author(s)
      西山朋子
    • Total Pages
      214
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      9784758103749
    • Related Report
      2018 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2021-01-27  

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