The evolution of 'lock-and-key' systems in plant self-incompatibility: an investigation from theoretical and experimental approaches
Publicly Offered Research
Project Area | Evolutionary theory for constrained and directional diversities |
Project/Area Number |
18H04813
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Research Institution | Chiba University |
Principal Investigator |
土松 隆志 千葉大学, 大学院理学研究院, 准教授 (60740107)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2020-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2019)
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Budget Amount *help |
¥10,400,000 (Direct Cost: ¥8,000,000、Indirect Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2019: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2018: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
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Keywords | 自家不和合性 / 共進化 / シミュレーション |
Outline of Annual Research Achievements |
共進化する生物同士にはしばしば,特定の相手としか相互作用しないというパートナー選択の特異性がみられる.このような特異性を担う分子的実体は受容体とリガンドであることが多いが,新しい特異性,すなわち「新しい受容体とリガンドのセット」はどのように進化するのかという問題が以前から指摘されていた.本研究では,自家受精を防ぐ自己認識機構である植物の自家不和合性を対象にこの問題に取り組んだ.特に着目したのが,自家不和合性の受容体とリガンドのセット(「S対立遺伝子」と呼ぶ)の特異性が不安定化し部分的に自家和合化するような,特異性の「ゆらぎ」現象である.本課題は,数理モデルと実験によりS対立遺伝子の進化過程を予測・再現することを通して,特異性のゆらぎと新規受容体-リガンドのセットの進化可能性との関係を,理論と実験の両面から探ることを目的とした. まず、自家不和合性における新規S対立遺伝子の進化と特異性のゆらぎとの関係を探るために,進化過程を再現する数理モデルを構築した.主要な結果として,認識特異性がゆらいだ中間状態があることで,たしかに新規S対立遺伝子が長期に渡って集団内に維持されることが予測された.また,S対立遺伝子の優劣性と新規S対立遺伝子の進化しやすさとの間にも関係が見られた. 続いて,実際の野生集団においてどのようなS対立遺伝子が分離しているのかを把握するために,シロイヌナズナに近縁の自家不和合性種ハクサンハタザオを用いて,リシークエンスデータに基づくS遺伝子座の塩基配列解析を行った.その結果,同一の特異性をもつとされるS対立遺伝子内にもいくつかの非同義置換が見られることが明らかになった.これらの多型は特異性に影響を与えゆらぎを引き起こす可能性があると考えられる.
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Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(27 results)
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[Journal Article] Exploring genetic diversity and signatures of horizontal gene transfer in nodule bacteria associated with Lotus japonicus in natural environments2019
Author(s)
Bamba, M., Aoki, S., Kajita, T., Setoguchi H., Watano, Y., Sato, S., and Tsuchimatsu, T.
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Journal Title
Molecular Plant-Microbe Interactions
Volume: 印刷中
Issue: 9
Pages: 1110-1120
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Diversity and horizontal gene transfer of nodule bacteria associated with Lotus japonicus in natural environments2018
Author(s)
Bamba, M., Aoki, S., Kajita, T., Watano, Y., Setoguchi, H., Sato, S., Tsuchimatsu, T.
Organizer
Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution
Related Report
Int'l Joint Research
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