低次元化に基づく免疫受容体配列ダイバーシティ解析手法の改良と応用展開
Publicly Offered Research
| Project Area | Integrated analysis and regulation of cellular diversity |
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| Project/Area Number |
18H05096
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
小林 徹也 東京大学, 生産技術研究所, 准教授 (90513359)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2020-03-31
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| Project Status |
Discontinued (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥7,800,000 (Direct Cost: ¥6,000,000、Indirect Cost: ¥1,800,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2018: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
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| Keywords | レパトア / NGS / T細胞受容体 / 多様性 / 低次元化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
手法のスケールアップを目指し、双曲空間への埋め込みの新しい方法などの検討を行なった。また、前年度にクオリティチェックを完了した経時的に取得されたT細胞受容体シーケンスのデータを用いて、経時的な低次元化の方法の検討を行なった。具体的にはDECOLDによる同時埋め込みによる低次元化を行うとともに、レニーダイバージェンスによる特徴化や、PCAを用いた情報の縮約に関しても解析を進めた。
並行して、受容体多様性が変動する過程を力学系の観点から解析する方法を検討し、実験的に観測されている受容体のパワー則の生成メカニズムを整理した。
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(16 results)
