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非天然型基質群の設計・酵素変換による多環式アルカロイド群の迅速合成

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries
Project/Area Number 19H04647
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionThe University of Tokyo (2020)
Tokyo University of Agriculture and Technology (2019)

Principal Investigator

大栗 博毅  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (80311546)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥7,800,000 (Direct Cost: ¥6,000,000、Indirect Cost: ¥1,800,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Keywords化学-酵素ハイブリッド合成 / NRPS / イソキノリン / アルデヒド中間体 / アルカロイド / 生合成 / 化学酵素ハイブリッド合成 / 天然物 / テトラヒドロイソキノリン
Outline of Research at the Start

シンプルな基質群から中間体を単離せずに,五環式骨格を迅速構築できる NRPSの長所と基質/中間体の構造や反応性を合理的に改変できる有機合成化学の利点を相乗的に活かして,多官能性の生理活性分子群を人工的に創出する次世代の創薬基盤技術を開発する。既往の生合成研究は解析的な視点での研究が主流であった。これに対し本研究では,天然物全合成や骨格多様化合成研究で培った合成化学者の視点を融合した研究を推し進める。合成化学者が生合成システムをリデザインし,有効活用していくための基盤整備に貢献する。

Outline of Annual Research Achievements

サフラマイシンやエクテナサイジンは,テトラヒドロイソキノリン(THIQ)が複数連結した複雑な五環性骨格を持つ。抗腫瘍性抗生物質として注目され,エクテナサイジンは臨床応用されている。本研究では非天然型の基質群を設計・合成し,THIQアルカロイドやそのアナログを化学酵素ハイブリッド合成する。
NRPS のAドメインは,アミノ酸を識別して活性化するので,一般に基質許容範囲が狭い。これに対し本研究で着目したSfmC-PS (Pictet-Spengler)ドメインは,Rドメインがチオエステルを還元して生じた遊離のアルデヒドを基質とする。そのため,Aドメインと比較してPSドメインは,アルデヒド型基質に対しての許容性を大幅に拡張できる可能性がある。実際,合成した非天然型アルデヒド基質群を活用したSfmC 酵素変換を鍵工程として,最近,三系統のTHIQアルカロイド[サフラマイシンA, ジョルナマイシンA, N-Fmoc サフラマイシン Y3] の化学酵素ハイブリッド全合成を達成した(北大及川・南らとの共同研究: J. Am. Chem. Soc. 2018)。上記知見に基づいて本研究では,非天然型アルデヒド基質をTHIQアルカロイドNRPSに適用する手法を種々検討している。本年度は、有機合成した非天然型アルデヒド基質のSfmC酵素変換で一挙に五環性母骨格を構築した。酵素反応生成物を単離せずに、C21シアノ化/N12還元的アミノ化で新規アナログ群を系統的に合成した。
7連続の骨格形成反応の鍵中間体と想定している二環性アルデヒドやその前駆体となるチオエステルを合成化学的に調製し、in vitro変換の検討に着手した。
生合成マシナリーにおいて、SfmCの上流に位置するSfmBを大腸菌で発現した。実際にSfmBのAドメインの酵素活性を確認し、アミノ酸選択性やin vitro酵素変換を検討した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

サフラマイシン類、エクテナサイジン類に代表されるテトラヒドロイソキノリン(THIQ)アルカロイド群では、N12位はいずれもN-メチル化されており構造改変は極めて困難である。そのため、現在中分子薬として臨床応用されている半合成制ガン剤についてもN12の置換基は全てメチル基に限定されている。本年度は,申請者らが開発した化学酵素ハイブリッド合成法で第二級アミン型中間体を迅速に供給できる点に着目し,任意の置換基をN12位へ自在に導入することに成功した。還元的アミノ化でN12位へメチル基以外のアルキル基を導入するとともに、アシル化反応によりアミド型誘導体の創製も実現した。
7連続反応で五環性骨格を一挙に構築するSfmC酵素変換プロセスの鍵中間体と想定した二環性アルデヒドの化学合成を検討した。アルデヒド基質やその誘導体の安定性等について重要な知見を蓄積した。アルデヒドのみならずチオエステルとした中間体群を設計・合成し、in vitro酵素変換を検討できるようになった。
生合成マシナリーにおいて、SfmCの上流に位置するSfmBを大腸菌で発現した。SfmBのAドメインの酵素活性を比色分析で評価する手法を検討し、簡便に再現性良く酵素活性を評価する系を確立した。これによりSfmBのAドメインのアミノ酸選択性について実験データを蓄積し、提唱した生合成メカニズムと合致することを明らかにした。更に、SfmBとSfmCを共存させる系で連続的なin vitro酵素変換の検討に着手することができた。

Strategy for Future Research Activity

非天然型アルデヒドやその前駆体に相当するチオエステル群を系統的に化学合成し、THIQアルカロイドNRPSに適用する。チロシン誘導体(申請者ら不斉合成法: TL 2016)は,他のTHIQアルカロイド群においても共通なので,エクテナサイジン類やサフラシン類のNRPS等へ適用していく。アルデヒド/チオエステル型基質での酵素変換にとどまらず,ホスホパンテテイニルトランスフェラーゼ群を活用し,非天然型基質群をPCP上へ直接導入するアプローチを並行して検討する。Pictet-Spengler 反応の進行が期待される非天然型合成基質群の適用範囲を拡大しながら、基質-酵素の最適な組合せを探索する。また、in vitro酵素反応条件を再度見直して低コスト化を図るとともに、酵素反応のスケール向上にも取り組んでいく。

Report

(1 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 7 results)

  • [Journal Article] Total synthesis of alkaloids using both chemical and biochemical methods2020

    • Author(s)
      Tanifuji Ryo、Minami Atsushi、Oguri Hiroki、Oikawa Hideaki
    • Journal Title

      Natural Product Reports

      Volume: 37 Issue: 8 Pages: 1098-1121

    • DOI

      10.1039/c9np00073a

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Generation of C5-desoxy analogs of tetrahydroisoquinoline alkaloids exhibiting potent DNA alkylating ability2019

    • Author(s)
      Tanifuji, Ryo; Tsukakoshi, Kaori; Ikebukuro, Kazunori; Oikawa, Hideaki; Oguri, Hiroki
    • Journal Title

      Bioorganic & medicinal chemistry letters

      Volume: 29 (14) Issue: 14 Pages: 1807-1811

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2019.05.009

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 天然物合成化学と生合成工学・超分子化学との融合を目指して2020

    • Author(s)
      大栗博毅
    • Organizer
      産総研 第82回触媒化学融合研究センター講演会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Concise and divergent access to alkaloidal scaffolds by integrating organic and biogenetic synthesis2019

    • Author(s)
      Hiroki Ogui
    • Organizer
      The Fourth A3 Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Concise Synthesis of Natural Products and their Variants: a Chemoenzymatic and an Element Implantation Approach2019

    • Author(s)
      Hiroki Oguri
    • Organizer
      The14th International Conference on Cutting-Edge Organic Chemistry in Asia
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Artificial assembly lines for divergent synthesis of natural products and their variants2019

    • Author(s)
      Hiroki Oguri
    • Organizer
      The 27th French-Japanese Symposium on Medicinal and Fine Chemistry
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Development of divergent synthetic processes to explore frontiers in natural product chemistry2019

    • Author(s)
      Hiroki Oguri
    • Organizer
      Let’s Leap! Challenges in Organic Chemistry, Department of Chemistry, School of Science, The University of Tokyo
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 生合成拡張型合成の新展開と機能創発への挑戦2019

    • Author(s)
      大栗博毅
    • Organizer
      理研シンポジウム:第14回有機合成化学フロンティア
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 生合成拡張型合成プロセスの開発と機能性中分子群創製2019

    • Author(s)
      大栗博毅
    • Organizer
      微生物ウィーク2019 コラボシンポジウム:放線菌が生産する構造多様性に富んだ化合物とその応用への展開
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2021-01-27  

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