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Chemical redesign of biosynthetic system based on functional alteration of enzymes by synthetic molecules

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries
Project/Area Number 19H04650
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

有安 真也  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (50586998)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords擬似基質 / 親水性基質 / 基質認識 / 選択的水酸化 / 網羅的活性評価 / 酵素 / 機能改変 / デコイ分子 / 多段階酵素反応 / 親水性デコイ分子 / エポキシ化 / 脱メチル化
Outline of Research at the Start

本研究課題では、複雑骨格機能分子の合成に必要な窒素や酸素、硫黄原子を含む親水性基質の立体選択的な化学変換技術の開発を目指し、我々が開発した基質類似分子(デコイ分子)の外部添加による酵素の基質特異性や位置・立体選択性を制御する技術をさらに発展させ、化学的アプローチによる生合成リデザイン、および、複雑骨格機能分子の合成法を行う。デコイ分子の先端に様々な官能機を導入することで、天然のアミノ酸にはない官能基を酵素の反応中心に自在に配置することが可能であり、生合成系のリデザインを化学の視点から展開することを目指す。

Outline of Annual Research Achievements

2020年度は2019年度に遂行した(i)基質認識型デコイ分子による親水性基質の化学変換法の開拓と、(ii) 多段階酵素反応による複雑骨格機能分子の構築法の開発の足がかりを基に、申請時の計画通り、(i)と(ii)の継続と、(iii)菌体内反応系への応用の検討を中心に行った。(i)の継続として水酸基を有するフェノール、窒素系官能基を持つアニリンやピリジン、硫黄原子を有するチオアニソールやその他、カルボニル基を有する様々な非天然基質に適用範囲の拡大を目指し、基質認識型デコイ分子の開発をさらに進展させた。また、申請とは別に、P450BM3によるベンゼン水酸化を効率よく誘起するデコイ分子を開発する過程で600分子を超えるデコイ分子ライブラリーと、オートサンプラや自動分注機を用いた迅速スクリーニングを併用して、いくつかのデコイ分子において基質認識による水酸化位置の変換が観測された。例えば、フェノールの水酸化においては、従来のデコイ分子ではパラ位に水酸基が導入されたヒドロキノンがほぼ選択的に生成するのに対し、見出した基質認識型のデコイ分子ではオルト位に水酸基が導入されたカテコールの生成が見られた。また、(ii)の多段階酵素反応への応用に関しては、上記の非天然基質への水酸基の導入の他、メトキシ基への脱メチル化、二重結合へのエポキシ化など、多段階反応に有効な官能基を非天然基質に導入することに成功した。(iii)の菌体反応への応用に関しては、基質認識型デコイ分子が従来の分子よりも親水性が強く、菌体反応に用いる大腸菌ではデコイ分子が菌体の膜構造の浸透が困難であり、従来の大腸菌での反応が困難であることが明らかとなったが、大腸菌以外の菌体を用いたところ、デコイ分子の透過性の傾向が大きく異なることを明らかにし、基質認識型デコイ分子による菌体反応の基盤となる技術の開発に成功した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2020 2019

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Expanding the Applicability of Cytochrome P450s and other Haemoproteins2020

    • Author(s)
      Shinya Ariyasu, Joshua Kyle Stanfield, Yuichiro Aiba, Osami Shoji
    • Journal Title

      Current Opinion in Chemical Biology

      Volume: 59 Pages: 155-163

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2020.06.010

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Systematic Evolution of Decoy Molecules for the Highly Efficient Hydroxylation of Benzene and Small Alkanes Catalyzed by Wild-Type Cytochrome P450BM32020

    • Author(s)
      Kai Yonemura, Shinya Ariyasu, Joshua Kyle Stanfield, Kazuto Suzuki, Hiroki Onoda, Chie Kasai, Hiroshi Sugimoto, Yuichiro Aiba, Yoshihito Watanabe, Osami Shoji
    • Journal Title

      ACS Catalysis

      Volume: 10 Issue: 16 Pages: 9136-9144

    • DOI

      10.1021/acscatal.0c01951

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular Design and Regulation of Metalloenzyme Activities through two Novel Approaches: Ferritin and P450s2020

    • Author(s)
      Yoshihito Watanabe, Yuichiro Aiba, Shinya Ariyasu, Satoshi Abe
    • Journal Title

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      Volume: 93 Issue: 3 Pages: 379-392

    • DOI

      10.1246/bcsj.20190305

    • NAID

      130007808692

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] シトクロムP450BM3の誤作動状態を利用したガス状アルカンの直接水酸化2020

    • Author(s)
      有安真也、愛場雄一郎、荘司長三
    • Journal Title

      えねるみくす(日本エネルギー学会機関誌)

      Volume: 9 Pages: 147-154

    • NAID

      130007824226

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Journal Article] 気体資源の有効活用を目指した高圧反応装置の開発2020

    • Author(s)
      有安真也、荘司長三
    • Journal Title

      機能材料(シーエムシー出版)

      Volume: 40 Pages: 46-56

    • NAID

      40022627414

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Journal Article] Development of a High-Pressure Reactor Based on Liquid-Flow Pressurisation to Facilitate Enzymatic Hydroxylation of Gaseous Alkanes2019

    • Author(s)
      Ariyasu, S.; Kodama, Y. (equal contribution); Kasai, C; Cong, Z.; Stanfield, J. K.; Aiba, Y.; Watanabe, Y.; Shoji, O.
    • Journal Title

      ChemCatChem

      Volume: 11 Issue: 19 Pages: 4709-4714

    • DOI

      10.1002/cctc.201901323

    • NAID

      120006777540

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Enzymatic Hydroxylation of Small Alkanes by P450BM3 with Decoy Molecules under High Pressure2020

    • Author(s)
      Shinya Ariyasu, Yusaku Kodama, Kai Yonemura, Chie Kasai, Joshua Kyle Stanfield, Yuma Shisaka, Yuichiro Aiba, Yoshihito Watanabe, Osami Shoji
    • Organizer
      The 4th IRCCS International Symposium
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] シトクロムP450による高難度ガス状アルカンの直接水酸化2020

    • Author(s)
      有安 真也、児玉 侑朔、米村 開、笠井 千枝、愛場 雄一郎、荘司 長三
    • Organizer
      第14回バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 合成分子による酵素の機能改変に基づく化学的生合成リデザイン2020

    • Author(s)
      有安 真也
    • Organizer
      新学術領域研究「生合成リデザイン」第9回公開シンポジウム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Effects of Mutagenesis and Decoy Molecules in Hydroxylation of Gaseous Alkanes by Cytochrome P450BM32019

    • Author(s)
      Shinya Ariyasu, Yusaku Kodama, Chie Kasai, Yoshihito Watanabe, Osami Shoji
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] シトクロムP450によるガス状アルカンの高効率水酸化を目指した高圧反応装置の開発2019

    • Author(s)
      有安真也、児玉侑朔、笠井千枝、愛場雄一郎、渡辺芳人、荘司長三
    • Organizer
      第52回酸化反応討論会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] シトクロムP450BM3の非天然基質の水酸化における擬似基質と変異導入の効果2019

    • Author(s)
      有安真也、鈴木和人、佐々木結花、笠井千枝、中村大介、柳澤颯太、ジョシュア・カイル・スタンフィールド、愛場雄一郎、渡辺芳人、荘司長三
    • Organizer
      第3回 新学術領域研究「生合成リデザイン」若手シンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2021-12-27  

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