• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Redesign of prenyltransfer reactions enabled by "permissive" substrate recognition

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries
Project/Area Number 19H04651
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

邊見 久  名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (60302189)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥7,670,000 (Direct Cost: ¥5,900,000、Indirect Cost: ¥1,770,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Keywordsプレニル基転移酵素 / イソプレノイド / 古細菌
Outline of Research at the Start

プレニル基転移反応は、イソプレノイドという自然界で最大の天然化合物群の生合成に関わる酵素反応であり、この反応の生成物を変化させることでイソプレノイドの構造多様性を拡張することが可能となる。最近我々は通常の酵素が受け入れない化合物を基質とするプレニル基転移酵素を見出している。その基質認識機構を解明し、その知見をもとに他の酵素の厳格な基質認識を変化させることで、非天然イソプレノイドの合成を試みる。

Outline of Annual Research Achievements

各種プレニル基転移酵素を対象として、それらの「緩い」基質特異性の物質生産への応用、およびその特異性の分子機構の解明を目指した研究を実施した。シス型プレニル基転移酵素に関しては、メタン生成古細菌より見出した、基質特異性の緩い同酵素であるMM_0014が、通常の基質であるイソペンテニル二リン酸の4位炭素へのプレニル基転移(C-プレニル化)反応だけでなく、グリセロールなど小分子アルコールの水酸基へのプレニル基転移(O-プレニル化)反応を触媒できることを、X線結晶構造解析や質量分析などにより明らかにした。また、古細菌膜脂質の生合成に関わるプレニル基転移酵素の緩い基質特異性を利用し、天然には存在しないC30という長い炭素鎖を有する古細菌膜脂質アナログの酵素合成、および大腸菌による生産に成功した。その他、近年我々が見出した古細菌型メバロン酸経路の中間体を、野生型および変異型の各種プレニル基転移酵素の基質とする実験も実施した。期待した結果を得ることはできなかったものの、その研究の過程で、同経路に関わる新奇酵素について、いくつかの新しい発見を行うことができた。例えばホスホメバロン酸脱水酵素が、真正細菌由来の近縁酵素に関する報告とは異なり、[4Fe-4S]型の鉄硫黄クラスターを活性中心に保持していることをEPR解析により証明した。また、ホスホトランスアンヒドロメバロン酸脱炭酸酵素がプレニル化フラビンを補酵素とすることを再構成実験により証明した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (21 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] A versatile cis-prenyltransferase from Methanosarcina mazei catalyzes both C- and O-prenylations2021

    • Author(s)
      Okada Miyako、Unno Hideaki、Emi Koh-ichi、Matsumoto Mayuko、Hemmi Hisashi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: in press Pages: 100679-100679

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.100679

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 古細菌型メバロン酸経路の発見2021

    • Author(s)
      邊見 久
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 93 Pages: 221-224

    • NAID

      40022582932

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Journal Article] Construction of an artificial biosynthetic pathway for hyperextended archaeal membrane lipids in the bacterium Escherichia coli2020

    • Author(s)
      Yoshida Ryo、Hemmi Hisashi
    • Journal Title

      Synthetic Biology

      Volume: 5 Issue: 1

    • DOI

      10.1093/synbio/ysaa018

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reconstruction of the "archaeal" mevalonate pathway from the methanogenic archaeon Methanosarcina mazei in Escherichia coli cells2020

    • Author(s)
      Yoshida Ryo、Yoshimura Tohru、Hemmi Hisashi
    • Journal Title

      Applied Environmental Microbiology

      Volume: 86 Issue: 6

    • DOI

      10.1128/aem.02889-19

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A heteromeric cis-prenyltransferase is responsible for the biosynthesis of glycosyl carrier lipids in Methanosarcina mazei2019

    • Author(s)
      Emi Koh-ichi、Sompiyachoke Kitty、Okada Miyako、Hemmi Hisashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 520 Issue: 2 Pages: 291-296

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.09.143

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 超好熱性アーキア由来ホスホメバロン酸デヒドラターゼの活性中心に存在する鉄硫黄クラスターの解析2021

    • Author(s)
      米山 睦、三野 広幸、保野 陽子、品田 哲郎、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      2021年度日本農芸化学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] アーキア型メバロン酸経路の鍵酵素ホスホ-trans-アンヒドロメバロン酸デカルボキシラーゼの酵素学的研究2021

    • Author(s)
      松嶋 夏海、栗木 莉子、保野 陽子、品田 哲郎、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      2021年度日本農芸化学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Methanosarcina mazei 由来プレニル二リン酸特異的 Nudix hydrolase の機能解明2021

    • Author(s)
      石橋 裕美、松嶋 夏海、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      2021年度日本農芸化学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 未培養真正細菌に存在する古細菌型メバロン酸経路2020

    • Author(s)
      邊見 久、Riko Kuriki、吉田 稜
    • Organizer
      第30回イソプレノイド研究会例会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 古細菌型メバロン酸経路に関与するプレニル化FMN依存性脱炭酸酵素の研究2019

    • Author(s)
      松嶋夏海、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      日本ビタミン学会第71回大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 古細菌型メバロン酸経路に関与するプレニル化FMN依存性脱炭酸酵素の研究2019

    • Author(s)
      松嶋夏海、品田哲郎、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      酵素補酵素研究会2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 超好熱アーキアに見出した「第4の」メバロン酸経路2019

    • Author(s)
      邊見 久
    • Organizer
      微生物ウィーク2019 シンポジウム「好熱菌研究最前線」
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Recounstruction of the archaeal mevalonate pathway from the mesophilic methanogenic archaeon Methanosarcina mazei in Escherichia coli cells2019

    • Author(s)
      Ryo Yoshida, Tohru Yoshimura, Hisashi Hemmi
    • Organizer
      TERPNET 2019 14th International Meeting on the Biosynthesis, Function and Synthetic Biology of Isoprenoids
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Discovery of a “fourth” mevalonate pathway from the hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix2019

    • Author(s)
      Hisashi Hemmi
    • Organizer
      Thermophiles 2019 15th International Congress on Thermophiles
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A heteromeric cis-prenyltransferase from the thermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus: purification and biochemical characterization2019

    • Author(s)
      Kitty Sompiyachoke, Koh-ichi Emi, Tohru Yoshimura, Hisashi Hemmi
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 非天然型C25,C30-アーキア膜脂質の生合成経路の構築2019

    • Author(s)
      吉田 稜、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 超好熱性アーキアAeropyrum pernix由来ホスホメバロン酸デヒドラターゼの解析2019

    • Author(s)
      米山 睦、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      第29回イソプレノイド研究会例会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 超好熱性アーキアAeropyrum pernix由来ホスホ-trans-アンヒドロメバロン酸デカルボキシラーゼの特性評価2019

    • Author(s)
      邊見 久、松嶋夏海、品田哲郎、吉村 徹
    • Organizer
      第20回極限環境生物学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 「緩い」基質認識が可能にするプレニル基転移反応のリデザイン2019

    • Author(s)
      邊見 久
    • Organizer
      生合成リデザイン第7回公開シンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] アーキア型メバロン酸経路におけるホスホメバロン酸デヒドラターゼの特性評価2019

    • Author(s)
      米山 睦、齋藤甲斐、保野陽子、品田哲郎、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      2020年度日本農芸化学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Does the archaeal mevalonate pathway exist in an unculturable bacterium, Candidatus Promineofilum breve?2019

    • Author(s)
      Riko Kuriki, Ryo Yoshida, Tohru Yoshimura, Hisashi Hemmi
    • Organizer
      2020年度日本農芸化学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi