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Functional analysis of terpene synthases and its application to the synthesis of unusual terpenoids

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries
Project/Area Number 19H04661
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionOsaka City University

Principal Investigator

品田 哲郎  大阪市立大学, 大学院理学研究科, 教授 (30271513)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥7,540,000 (Direct Cost: ¥5,800,000、Indirect Cost: ¥1,740,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Keywords生合成酵素 / 有機合成 / 酵素反応 / テルペノイド / 生合成 / 非天然型化合物 / テルペン合成酵素 / 鎖状テルペン / 基質合成 / 反応解析 / 反応機構
Outline of Research at the Start

本研究では(1)解析が進んでいないテルペン合成酵素の機能と構造を明らかにすること、ならびに、(2)基質の再設計から非天然型のテルペンアナログを合成する方法を開拓することを目的とする。具体的には、酵素反応基質を合成し、酵素反応に供する。生成物の構造解析、酵素の構造解析、反応機構の解析を通じて「精密な生合成設計図を描くこと」に貢献するとともに、「天然にはない複雑骨格機能分子の創製」に向けた道筋を開拓する。

Outline of Annual Research Achievements

有機合成を基盤として(1)解析が進んでいない天然物生合成合成酵素の機能と構造を明らかにすること、ならびに、(2)基質の再設計から非天然型のテルペンアナログを合成する方法を開拓することを研究目的とした。これにより、新学術領域、生合成リデザインの発展に貢献する。
課題(1)の成果として(あ)~(え)に示す、生合成酵素の機能を調べるための基質合成と酵素の機能解析を行った。得られた成果はそれぞれ論文発表した。(あ)枯草菌由来の新規クラスIB,C35長鎖テルペン合成酵素の機能解析:長鎖テルペンアナログを合成し、酵素・基質結晶構造を作成、その解析に成功した。これより新規クラスIBテルペン合成酵素の反応機構の詳細を明らかにできた。(い)植物由来C25テルペン環化酵素の機能解析:表題の環化酵素の機能解析に資する長鎖テルペンを合成し、その結晶構造解析を元に、環化酵素の機能を明らかにした。(う)アミノキャリアータンパク質が関与する含窒素生合成経路の解明:アミノキャリアータンパク質が関与する含窒素天然物生合成経路の詳細を明らかにするために、鍵中間体の一つであるDADHの初の合成を行った。(え)電子環状反応を促進する新規生合成酵素の機能解析:オルトジアルキル置換ベンゼンを生合成するPKS生合成系の詳細を初めて明らかにした。
課題(2)の成果として、本年度はテルペン合成酵素から誘導される含窒素化合物の構造を決定するための化学合成を行った。生成物の推定構造として、5員環炭素骨格に環状アミドが連結しかつ、3つの不斉炭素中心を有するものを想定した。検討の結果、市販されているテルペンを出発原料として、2つの不斉炭素中心を含む中間体まで合成できた。現在、アミド複素環の構築を進めている。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Chinese Academy of Sciences(中国)

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  • [Int'l Joint Research] 中国科学院(中国)

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  • [Journal Article] Stereoselective Synthesis of (2S,6R)‐Diamino‐(5R,7)‐dihydroxy‐heptanoic Acid (DADH): An Unusual Amino Acid from Streptomyces sp. SANK 604042021

    • Author(s)
      Okamura Hironori、Yasuno Yoko、Nakayama Atsushi、Takikawa Hirosato、Shinada Tetsuro
    • Journal Title

      European Journal of Organic Chemistry

      Volume: 2021 Issue: 9 Pages: 1396-1401

    • DOI

      10.1002/ejoc.202001646

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reconstitution of a Highly Reducing Type II PKS System Reveals 6π-Electrocyclization Is Required for o-Dialkylbenzene Biosynthesis2021

    • Author(s)
      Zhang J, Yuzawa S, Thong WL, Shinada T, Nishiyama M, Kuzuyama T.
    • Journal Title

      J Am Chem Soc

      Volume: 143 Issue: 7 Pages: 2962-2969

    • DOI

      10.1021/jacs.0c13378

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      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Basis for Sesterterpene Diversity Produced by Plant Terpene Synthases2020

    • Author(s)
      Chen Qingwen、Li Jianxu、Liu Zhixi、Mitsuhashi Takaaki、Zhang Yuting、Liu Haili、Ma Yihua、He Juan、Shinada Tetsuro、Sato Tsutomu、Wang Yong、Liu Hongwei、Abe Ikuro、Zhang Peng、Wang Guodong
    • Journal Title

      Plant Communications

      Volume: 1 Issue: 5 Pages: 100051-100051

    • DOI

      10.1016/j.xplc.2020.100051

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Characterization of Class IB Terpene Synthase: The First Crystal Structure Bound with a Substrate Surrogate2020

    • Author(s)
      Stepanova Rafaella、Inagi Hayato、Sugawara Kei、Asada Kazuya、Nishi Tomoyuki、Ueda Daijiro、Yasuno Yoko、Shinada Tetsuro、Miki Kunio、Fujihashi Masahiro、Sato Tsutomu
    • Journal Title

      ACS Chemical Biology

      Volume: - Issue: 6 Pages: 1517-1525

    • DOI

      10.1021/acschembio.0c00145

    • NAID

      120006892058

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    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 有機合成化学を基盤とするテルペン系天然物の生合成および生物機能の解明2021

    • Author(s)
      品田哲郎
    • Organizer
      有機合成化学協会 2019年度企業冠賞受賞講演会
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    • Invited
  • [Presentation] アーキア型メバロン酸経路におけるホスホメバロン酸デヒドラターゼの特性評価2020

    • Author(s)
      米山睦、齋藤甲斐、保野陽子、品田哲郎、吉村徹、邊見久
    • Organizer
      日本農芸化学会 2020年度大会
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  • [Presentation] Synthetic Study of Deuterium-labelled Acyclic Terpenes2020

    • Author(s)
      Katsushi Kumadaki, Hironori Okamura, Yoko Yasuno, Tetsuro Shinada
    • Organizer
      日本化学会 第100回春季年会
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      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization and mutation of class-IB terpene synthase2020

    • Author(s)
      Rafaella Stepanova, Tomoyuki Nishi, Kei Sugawara1, Daijiro Ueda, Hayato Inagi, Kunio Miki,. Masahiro Fujihashi, Yoko Yasuno, Tetsuro Shinada, and Tsutomu Sato
    • Organizer
      The 3rd International Conference on Natural Products Discovery and Development in the Genomic Era
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  • [Remarks] 大阪市立大学大学院理学研究科物質分子系専攻分子変換学研究室

    • URL

      http://www.sci.osaka-cu.ac.jp/chem/henkan/index.html

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Published: 2019-04-18   Modified: 2021-12-27  

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